第二結構段表述歸命佛寶與僧寶。首先，對佛稟白，我善導，至誠恭敬，運心廣大，歸命盡虛空遍法界十方法、報、化三身諸佛。法身佛即法性真如海，十方諸佛共證一法身。
此法性真如像大海般的深廣，故云法性真如海。由真如法身衍生出來的報身度化登地菩薩，由報身應眾生機緣顯現的無量化身，對此法、報、化三身諸佛悉要平等地恭敬歸命。
同時還要一心歸命盡虛空遍法界十方一切諸菩薩。一一菩薩又有無量眷屬，無量的身相莊嚴及無量神通。這些菩薩或是十住、十行、十回向三賢位，或是證入十地聖位，數量之多，如大海般無涯無際。
此三賢十地諸菩薩，因地修行的時劫或已圓滿，或未圓滿 ；果上的福慧或究竟，或未究竟 ；現行的煩惱，或已斷盡，或未斷盡 ；煩惱習氣或完全消除，或尚未完全消除 ；自行化他的功行或有作意 （七地以還） ，或契入無作妙用 （八地以上） ；
或已證一切智，或未證一切智 ；直到等覺菩薩還有一分生相無明未破，「正受金剛心」，以薩婆若（一切智） 相應之一念金剛智斷盡無明，便頓然獲證常樂我淨之涅槃果德。
這四十一階位的菩薩，我以平等的恭敬心悉皆歸命。同時祈願法、報、化三佛菩提無上尊，以無障礙神通威神力量，於冥冥中，加持攝受，我亦以平等恭敬心悉皆歸命。
還有十方盡虛空遍法界一切聲聞、緣覺與菩薩之三乘諸賢聖，長劫以來常隨佛學，效法佛的同體大悲心，自行化他，精進無退，亦恭請祈願他們遙相加被，令我得念佛三昧，隨心願得見十方諸佛。
請看偈頌 ：
我等愚痴身，曠劫來流轉，今逢釋迦佛，末法之遺蹟，彌陀本誓願，極樂之要門，定散等回向，速證無生身。我依菩薩藏，頓教一乘海，說偈歸三寶，與佛心相應。十方恆沙佛，六通照知我，今秉二尊教，廣開淨土門。願以此功德，平等施一切，同發菩提心，往生安樂國。
第三結構段是歸命淨土法門。首先，自忖根機，我等愚痴業報身，迷惑顛倒，曠劫以來，於三界六道，常沒常流轉，今生幸得人身，幸遇釋迦佛末法之遺教，尤其是淨土經典所昭示的阿彌陀佛本願之海，往生極樂世界之要門。
《觀經》所示定善與散善二門，平等回向，悉可得蒙阿彌陀佛弘願攝受接引，往生到極樂世界，成為阿鞞跋致菩薩，疾速證得無生法忍。
《觀經》所示的定善與散善二門，從判教角度來看，乃屬菩薩藏，義理境界如大海般深廣之一乘圓頓教。我於此宣說歸三寶偈頌，欲與十方諸佛拯濟群萌的平等慈悲心相應，作如來使。
十方恆沙諸佛以六種神通 （即天耳通、天眼通、他心通、神足通、宿命通、漏盡通） ，能現量觀照了知我的心願。我現今欲秉承本土釋迦牟尼佛和極樂阿彌陀佛兩尊佛的教敕，廣開念佛往生淨土之妙門。自信教人信，真成報佛恩。
最後一偈是回向發願，願以此撰述《四帖疏》的功德，平等回施一切眾生，俾法界一切有緣眾生共同發起念佛往生成佛之心。
此「歸三寶偈」表明導祖深沉的淨土情懷。厭離娑婆，欣慕極樂。至誠懇請十方三寶加被，令凡夫業識心頓開佛慧，如實闡釋經文法義，為末世注經者作一表範。——大安法師《觀經四帖疏玄義分講記》