增值稅一般納稅人，應納稅額等於當期銷項稅額減當期進項稅額。增值稅一般納稅人當期應納稅額的多少，取決於當期銷項稅額和當期進項稅額這兩個因素。在分別確定銷項稅額和進項稅額的情況下，就不難計算出應納稅額。
一、銷項稅額的計算
銷項稅額是指納稅人銷售貨物或者提供應稅勞務，按照銷售額或應稅勞務收入和規定的稅率計算並向購買方收取的增值稅稅額。銷項稅額的計算公式為：
銷項稅額＝銷售額×適用稅率
銷項稅額是增值稅條例中的一個概念，從定義和公式中我們可以知道，它是由購買方支付的稅額；對於屬於一般納稅人的銷售方來講，在沒有抵扣其進項稅額前，銷售方收取的銷項稅額還不是其應納增值稅稅額。銷項稅額的計算取決於銷售額和適用稅率兩個因素。適用稅率在前已有說明，此處主要介紹銷售額。需要強調的是，增值稅是價外稅，公式中的「銷售額」必須是不包括收取的銷項稅額的銷售額。
（一）一般銷售方式下的銷售額正確計算應納增值稅額，需要首先核算準確作為增值稅計稅依據的銷售額。銷售額是指納稅人銷售貨物或者提供應稅勞務向購買方（承受應稅勞務也視為購買方）收取的全部價款和價外費用，但是不包括收取的銷項稅額。
價外費用（實屬價外收入）是指價外向購買方收取的手續費、補貼、基金、集資費、返還利潤、獎勵費、違約金（延期付款利息）、包裝費、包裝物租金、儲備費、，優質費、運輸裝卸費、代收款項、代墊款項及其他各種性質的價外收費。但下列項目不包括在內：
1.向購買方收取的銷項稅額；
2.受委託加工應徵
消費稅的消費品所代收代繳的消費品；
3.同時符合以下條件的代墊運費：
（1）承運者的運費發票開具給購貨方的；
（2）納稅人將該項發票轉交給購貨方的。
凡隨同銷售貨物或提供應稅勞務向購買方收取的價外費用，無論其會計制度如何核算，均應併入銷售額計算應納稅額。
稅法規定各種性質的價外收費都要併入銷售額計算徵稅，目的是防止以各種名目的收費減少銷售額逃避納稅的現象。但是應當注意，根據國家
稅務總局規定：對增值稅一般納稅人（包括納稅人自己或代其他部門）向購買方收取的價外費用和逾期包裝物押金，應視為含稅收入，在徵稅時換算成不含稅收入再併入銷售額。按會計制度規定，由於對價外收費一般都不在「產品銷售收入」或「商品銷售收入」科目中核算，而在「其他應付款」、「其他業務收入」、「營業外收入」等科目中核算。這樣，企業在實務中時常出現對價外收費雖在相應科目中作會計核算。但卻未核算銷項稅額；有的企業則既不按會計核算要求進行收入核算，又不按規定核算銷項稅額，而是將發生的價外收費直接衝減有關費用科目。這些做法都是逃避納稅的錯誤行為，是要受到稅法處罰的。因此，納稅人對價外收費按稅法規定併入銷項稅額計稅必須予以高度重視，嚴格核查各項價外收費，保證做到正確計稅和會計核算。
（二）特殊銷售方式下的銷售額
在銷售活動中，為了達到促銷的目的，有多種銷售方式。不同銷售方式下，銷售者取得的銷售額會有所不同。對不同銷售方式如何確定其計徵增值稅的銷售額，既是納稅人關心的問題，也是稅法必須分別予以明確規定的事情。稅法對以下幾種銷售方式分別作了規定：
1.採取折扣方式銷售
折扣銷售是指銷貨方在銷售貨物或應稅勞務時，因購貨方購貨數量較大等原因而給予購貨方的價格優惠（如購買5件，銷售價格折扣10％，購買10件，折扣20％等）。由於折扣是在實現銷售時同時發生的，因此，稅法規定，如果銷售額和折扣額在同一張發票上分別註明的，可按折扣後的餘額作為銷售額計算增值稅；如果將折扣額另開發票，不論其在財務上如何處理，均不得從銷售額中減除折扣額。這裡需要做幾點解釋：第一，折扣銷售不同於銷售折扣。銷售折扣是指銷貨方在銷售貨物或應稅勞務後，為了鼓勵購貨方及早償還貨款而協議許諾給予購貨方的一種折扣優待（如：10天內付款，貨款折扣2％；20天內付款，折扣1％；30天內全價付款）。銷售折扣發生在銷貨之後，是一種融資性質的理財費用，因此，銷售折扣不得從銷售額中減除。企業在確定銷售額時應把折扣銷售與銷售折扣嚴格區分開。另外，銷售折扣又不同於銷售折讓。銷售折讓是指貨物銷售後，由於其品種、質量等原因購貨方未予退貨，但銷貨方需給予購貨方的一種價格折讓。銷售折讓與銷售折扣相比較，雖然都是在貨物銷售後發生的，但因為銷售折讓是由於貨物的品種和質量引起銷售額的減少，因此，對銷售折讓可以折讓後的貨款為銷售額。第二，折扣銷售僅限於貨物價格的折扣，如果銷貨者將自產、委託加工和購買的貨物用於實物折扣的，則該實物款額不能從貨物銷售額中減除，且該實物應按增值稅條例「視同銷售貨物」中的「贈送他人」計算徵收增值稅。第三，對摺扣銷售之所以規定銷售額與折扣額須在同一張發票上註明，是從保證增值稅徵稅、扣稅相一致的角度考慮的。如果允許對銷售額開一張銷貨發票，對摺扣額再開一張退款紅字發票，就可能造成銷貨方按減除折扣額後的銷售額計算銷項稅額，而購貨方卻按未減除折扣額的銷售額及其進項稅額進行抵扣的問題。這種造成增值稅計算徵收混亂的做法是不允許的。
2.採取以舊換新方式銷售
以舊換新是指納稅人在銷售自己的貨物時，有償收回舊貨物的行為。根據稅法規定，採取以舊換新方式銷售貨物的，應按新貨物的同期銷售價格確定銷售額，不得扣減舊貨物的收購價格。所以這樣規定，既是因為銷售貨物與收購貨物是兩個不同的業務活動，銷售額與收購額不能相互抵減，也是為了嚴格增值稅的計算徵收，防止出現銷售額不實、減少納稅的現象。考慮到金銀首飾以舊換新業務的特殊情況，對金銀首飾以舊換新業務、可以按銷售方實際收取的不含增值稅的全部價款徵收增值稅。
3.採取還本銷售方式銷售
還本銷售是指納稅人在銷售貨物後，到一定期限由銷售方一次或分次退還給購貨方全部或部分價款。這種方式實際上是一種籌集資金，是以貨物換取資金的使用價值，到期還本不付息的方法。稅法規定，採取還本銷售方式銷售貨物，其銷售額就是貨物的銷售價格，不得從銷售額中減除還本支出。
4.採取以物易物方式銷售
以物易物是一種較為特殊的購銷活動，是指購銷雙方不是以貨幣結算，而是以同等價款的貨物相互結算，實現貨物購銷的一種方式。在實務中，有的納稅人以為以物易物不是購銷行為，銷貨方收到購貨方抵頂貨款的貨物，認為自己不是購貨；購貨方發出抵頂貨款的貨物，認為自己不是銷貨。這兩種認識都是錯誤的。正確的方法應當是：以物易物雙方都應作購銷處理，以各自發出的貨物核算銷售額並計算銷項稅額，以各自收到的貨物按規定核算購貨額並計算進項稅額。應注意的是：在以物易物活動中，應分別開具合法的票據，如收到的貨物不能取得相應的增值稅專用發票或其他合法票據的，不能抵扣進項稅額。
5.包裝物押金是否計入銷售額
包裝物是指納稅人包裝本單位貨物的各種物品。納稅人銷售貨物時另收取包裝物押金，目的是促使購貨方及早退回包裝物以便周轉使用。對包裝物的押金是否計人貨物銷售額呢？根據稅法規定，納稅人為銷售貨物而出租出借包裝物收取的押金，單獨記帳核算的，時間在1年以內，又未過期的，不併入銷售額徵稅；但對因逾期未收回包裝物不再退還的押金，應按所包裝貨物的適用稅率計算銷項稅額。這其中，「逾期」是指按合同約定實際逾期或以1年為期限，對收取1年以上的押金，無論是否退還均併入銷售額徵稅。當然，在將包裝物押金併入銷售額徵稅時，需要先將該押金換算為不含稅價，再並人銷售額徵稅。對於個別包裝物周轉使用期限較長的，報經稅務機關確定後，可適當放寬逾期期限。另外，包裝物押金不應混同於包裝物租金，包裝物租金在銷貨時作為價外費用併入銷售額計算銷項稅額。國家稅務總局國稅發[1995]192號文件規定，從1995年6月1日起，對銷售除啤酒、黃酒外的其他酒類產品而收取的包裝物押金，無論是否返還以及會計上如何核算，均應併入當期銷售額徵稅。對銷售啤酒、黃酒所收取的押金，按上述一般押金的規定處理。
6.舊貨、舊機動車的銷售
根據財稅[2002]29號通知規定，自2002年1月1日起，納稅人銷售舊貨（包括舊貨經營單位銷售舊貨和納稅人銷售自己使用過的應稅固定資產），無論其是增值稅一般納稅人或小規模納稅人，也無論其是否為批准認定的舊貨調劑試點單位，一律按4％的徵收率計算稅額後再減半徵收增值稅，不得抵扣進項稅額。
納稅人銷售自己使用過的屬於徵收消費稅的機動車、摩託車、遊艇，售價超過原值的，按照4％的徵收率計算稅額後再減半徵收增值稅；售價未超過原值的，免徵增值稅。舊機動車經營單位銷售舊機動車、摩託車、遊艇，按照4％的徵收率計算稅額後再減半徵收增值稅。
7.對視同銷售貨物行為的銷售額的確定
在本章第一節「徵稅範圍」中已列明了單位和個體經營者8種視同銷售貨物行為，如：將貨物交付他人代銷，將自產、委託加工或購買的貨物無償贈送他人等。這8種視同銷售行為中某些行為由於不是以資金的形式反映出來，會出現無銷售額的現象。因此，稅法規定，對視同銷售徵稅而無銷售額的按下列順序確定其銷售額：
（1）按納稅人當月同類貨物的平均銷售價格確定；
（2）按納稅人最近時期同類貨物的平均銷售價格確定；
（3）按組成計稅價格確定。組成計稅價格的公式為：
組成計稅價格＝成本×（1＋成本利潤率）
徵收增值稅的貨物，同時又徵收消費稅的，其組成計稅價格中應加計消費稅稅額。其組成計稅價格公式為：
組成計稅價格＝成本×（1＋成本利潤率）＋消費稅稅額
或：組成計稅價格＝成本×（1＋成本利潤率）÷（1—消費稅稅率）
公式中的成本，是指銷售自產貨物的為實際生產成本，銷售外購貨物的為實際採購成本。公式中的成本利潤率按1993年12月28日國家稅務總局頒發的《增值稅若干具體問題的規定》確定為10％。但屬於應從價定率徵收消費稅的貨物，其組成計稅價格公式中的成本利潤率，為《消費稅若干具體問題的規定》中規定的成本利潤率（詳見第三章第四節三、組成計稅價格及稅額的計算）。
（三）含稅銷售額的換算
為了符合增值稅作為價外稅的要求，納稅人在填寫進銷貨及納稅憑證、進行
帳務處理時，應分項記錄不含稅銷售額、銷項稅額和進項稅額，以正確計算應納增值稅額。然而，在實際工作中，常常會出現一般納稅人將銷售貨物或者應稅勞務採用銷售額和銷項稅額合併定價收取的方法，這樣，就會形成含稅銷售額。在計算應納稅額時，如果不將含稅銷售額換算為不含稅銷售額，就會導致增值稅計稅環節出現重複納稅的現象，甚至出現物價非正常上漲的局面。因此，一般納稅人銷售貨物或者應稅勞務取得的含稅銷售額在計算銷項稅額時，必須將其換算為不含稅的銷售額。
將含稅銷售額換算為不含稅銷售額的計算公式為：
不含稅銷售額＝含稅銷售額÷（1＋稅率）
公式中的稅率為銷售的貨物或者應稅勞務按《增值稅暫行條例》規定所適用的稅率。
二、進項稅額的計算
納稅人購進貨物或者接受應稅勞務所支付或者負擔的增值稅額為進項稅額。進項稅額是與銷項稅額相對應的另一個概念。在開具增值稅專用發票的情況下，它們之間的對應關係是，銷售方收取的銷項稅額，就是購買方支付的進項稅額。對於任何一個一般納稅人而言，由於其在經營活動中，既會發生銷售貨物或提供應稅勞務，又會發生購進貨物或接受應稅勞務，因此，每一個一般納稅人都會有收取的銷項稅額和支付的進項稅額。增值稅的核心就是用納稅人收取的銷項稅額抵扣其支付的進項稅額，其餘額為納稅人實際應繳納的增值稅稅額。這樣，進項稅額作為可抵扣的部分，對於納稅人實際納稅多少就產生了舉足輕重的作用。然而，需要注意的是，並不是納稅人支付的所有進項稅額都可以從銷項稅額中抵扣。當納稅人購進的貨物或接受的應稅勞務不是用於增值稅應稅項目，而是用於非應稅項目、免稅項目或用於集體福利、個人消費等情況時，其支付的進項稅額就不能從銷項稅額中抵扣。稅法對不能抵扣進項稅額的項目作了嚴格的規定，如果違反稅法規定，隨意抵扣進項稅額就將以偷稅論處。因此，嚴格把握哪些進項稅額可以抵扣，哪些進項稅額不能抵扣是＋分重要的，這些方面也是納稅人在繳納增值稅實務中差錯出現最多的地方。
（一）準予從銷項稅額中抵扣的進項稅額
根據稅法的規定，準予從銷項稅額中抵扣的進項稅額，限於下列增值稅扣稅憑證上註明的增值稅稅額和按規定的扣除率計算的進項稅額。
1.從銷售方取得的增值稅專用發票上註明的增值稅額。
2.從海關取得的完稅憑證上註明的增值稅額。
上述規定說明，納稅人在進行增值稅帳務處理時，每抵扣一筆進項稅額，就要有一份記錄該進項稅額的法定扣稅憑證與之相對應；沒有從銷售方或海關取得註明增值稅稅額的法定扣稅憑證，就不能抵扣進項稅額。
3.增值稅一般納稅人購進農業生產者銷售的農業產品，或者向小規模納稅人購買的農產品，從2002年1月1日起，準予按照買價和13％的扣除率計算進項稅額，從當期銷項稅額中扣除。其進項稅額的計算公式為：
準予抵扣的進項稅額＝買價×扣除率
對這項規定需要解釋的是：
（1）所謂「農業產品」是指直接從事植物的種植、收割和動物的飼養、捕撈的單位和個人銷售的自產農業產品，免徵增值稅；農業產品所包括的具體品目按照1995年6月財政部、國家稅務總局印發的《農業產品徵稅範圍注釋》執行。
（2）購買農業產品的買價，僅限於經主管稅務機關批准使用的收購憑證上註明的價款；購買農業產品的單位在收購價格之外按規定繳納並負擔的農業特產稅，準予併入農業產品的買價，計算進項稅額。
4.增值稅一般納稅人外購貨物（固定資產除外）所支付的運輸費用，以及一般納稅人銷售貨物所支付的運輸費用（本章本節「一」所述不併入銷售額的代墊運費除外），根據運費結算單據（普通發票）所列運費金額依7％的扣除率計算進項稅額準予扣除，但隨同運費支付的裝卸費、保險費等其他雜費不得計算扣除進項稅額。
準予抵扣的進項稅額＝運費×扣除率對這項規定需要解釋的是：
（1）外購固定資產，因其自身的進項稅額不得抵扣，因此，所支付的運輸費用也不得計算進項稅額抵扣；另外，購買或銷售免稅貨物（購進免稅農業產品除外）所發生的運輸費用，也不得計算進項稅額抵扣。
（2）準予作為抵扣憑證的運費結算單據（普通發票），是指國營鐵路、民用航空、公路和水上運輸單位開具的貨票，以及從事貨物運輸的非國有運輸單位開具的套印全國統一發票監製章的貨票。
（3）準予計算進項稅額抵扣的貨物運費金額是指在運輸單位開具的貨票上註明的運費和建設基金。
（4）從2003年11月1日起，公路、內河貨物運輸業（以下簡稱貨物運輸業）發票的印製、領購、開具、取得、保管、繳銷均由地方稅務局管理和監督。凡已委託給其他部門管理的，必須依法收回。
從2003年11月1日起，提供貨物運輸勞務的納稅人必須經主管地方稅務局認定方可開具貨物運輸業發票。凡未經地方稅務局認定的納稅人開具的貨物運輸業發票不得作為記帳憑證和增值稅抵扣憑證。
（5）從2003年12月1日起，國家稅務局將對增值稅一般納稅人申請抵扣的所有運輸發票與營業稅納稅人開具的貨物運輸業發票進行比對。凡比對不符的，一律不予抵扣。對比對異常情況進行核查，並對違反有關法律法規開具或取得貨物運輸業發票的單位進行處罰。
（6）增值稅一般納稅人在申報抵扣2003年11月1日起取得的運輸發票增值稅進項稅額時，應向主管國家稅務局填報《增值稅運輸發票抵扣清單》紙制文件及電子信息，未報送的其進項稅額不得抵扣。
（7）納稅人取得的2003年10月31日以後開具的運輸發票，應當自開票之日起90天內向主管國家稅務局申報抵扣，超過90天的不得予以抵扣。納稅人取得的2003年10月31日以前開具的運輸發票，必須在2004年1月31日前抵扣完畢，逾期不再抵扣。納稅人辦理時，應附抵扣發票清單。
5.生產企業一般納稅人購入廢舊物資回收經營單位銷售的免稅廢舊物資，可按照廢舊物資回收經營單位開具的由稅務機關監製的普通發票上註明的金額，按10％計算抵扣進項稅額。
稅法對一般納稅人的上述3、4、5項特殊業務所以作出準予從收購額或運費中計算進項稅額抵扣的特殊規定，是因為這些特殊業務在企業的營業支出中佔較大份額，且無論是收購農業產品、購入廢舊物資，還是支付運費都不能取得作為進項稅額抵扣憑據的增值稅專用發票，如果對這些業務支出不能計算進項稅額抵扣，將加重企業的稅收負擔。因此，需要作特殊照顧處理。但納稅人在運用上述三項特殊規定時，要注意嚴格執行規定中限定的條件，例如：不能隨意擴大收購價、運費的範圍，抵扣進項稅額必須持有經稅務機關批准使用的收購憑證，如果使用未經稅務機關批准的收購憑證，以及不按稅務機關的要求使用、保管收購憑證的，不得計算進項稅額抵扣。
（二）不得從銷項稅額中抵扣的進項稅額
按《增值稅暫行條例》規定，下列項目的進項稅額不得從銷項稅額中抵扣：
1.購進固定資產；
2.用於非應稅項目的購進貨物或者應稅勞務；
3.用於免稅項目的購進貨物或者應稅勞務；
4.用於集體福利或者個人消費的購進貨物或者應稅勞務；
5.非正常損失的購進貨物；
6.非正常損失的在產品、產成品所耗用的購進貨物或者應稅勞務；
7.納稅人購進貨物或者應稅勞務，未按照規定取得並保存增值稅扣稅憑證，或者增值稅扣稅憑證上未按照規定註明增值稅額及其他有關事項的，其進項稅額不得從銷項稅額中抵扣。
對上述不得抵扣進項稅額的各項目需要解釋的是：
第1項所稱固定資產是指：
（1）使用期限超過1年的機器、機械、運輸工具，以及其他與生產經營有關的設備、工具、器具；
（2）單位價值在2000元以上，並且使用年限超過2年的不屬於生產經營主要設備的物品。
《增值稅暫行條例》規定不得抵扣進項稅額的購進固定資產的範圍比《企業財務通則》和《企業會計準則》規定的固定資產的範圍要小一些，主要是不包括房屋、建築物等不動產，因為銷售房屋、建築物繳納營業稅，不繳納增值稅；另外，對「購進固定資產」，應正確理解為，無論是從國內購人的，還是進口的，或是接受捐贈的，即使取得了扣稅憑證，其進項稅額也不能從銷項稅額中抵扣。
第2項所稱非應稅項目是指提供非應稅勞務（即營業稅條例規定的屬於交通運輸業、建築業、金融保險業、郵電通信業、文化體育業、娛樂業、服務業稅目徵收範圍的勞務）、轉讓無形資產、銷售不動產和固定資產在建工程等。納稅人新建、改建、擴建、修繕、裝飾建築物，無論會計制度規定如何核算，均屬於固定資產在建工程。在購進貨物或者應稅勞務用於非應稅勞務不得抵扣進項稅額中，有兩種特殊情況應排除在外，當納稅人做出應確定為徵收增值稅的混合銷售行為或兼營非應稅勞務行為時，其混合銷售或兼營行為中用於非應稅勞務的購進貨物或者應稅勞務的進項稅額，就可以在計算增值稅時從銷項稅額中抵扣。
第3項所稱免稅項目是指：
（1）農業生產者銷售的自產農業產品，是指直接從事種植業、養殖業、林業、牧業、水產業的單位和個人銷售自產的屬於稅法規定範圍的農業產品；
（2）避孕藥品和用具；
（3）古舊圖書，是指向社會收購的古書和舊書；
（4）直接用於科學研究、科學試驗和教學的進口儀器、設備；
（5）外國政府、國際組織無償援助的進口物資和設備；
（6）對符合國家產業政策要求的國內
投資項目，在投資總額內進口的自用設備（特殊規定不予免稅的少數商品除外）；
（7）由殘疾人組織直接進口供殘疾人專用的物品；
（8）銷售自己使用過的物品，是指個人（不包括個體經營者）銷售自己使用過的除遊艇、摩託車、汽車以外的貨物。
除上述《增值稅暫行條例》規定的免稅項目（其中第6小項為1998年起執行的補充規定）外，財政部、國家稅務總局報經國務院批准，對少數貨物或應稅勞務作了免稅規定，如：供殘疾人專用的假肢、輪椅、矯形器，對國家定點企業生產和經銷單位經銷的專供少數民族飲用的邊銷茶，均免徵增值稅。凡是稅法規定為免稅項目的，對用於免稅項目的購進貨物或應稅勞務的進項稅額都不能抵扣。
第4項所稱集體福利或者個人消費是指，企業內部設置的供職工使用的食堂、浴室、理髮室、宿舍、幼兒園等福利設施及其設備、物品等或者以福利、獎勵、津貼等形式發放給職工個人的物品。
納稅人凡購進貨物或應稅勞務是用於集體福利、個人消費的，由於其已改變了生產、經營需要的用途，成為了最終消費品，因此，其進項稅額不能抵扣。
第5、6項所稱非正常損失，是指生產經營過程中正常損耗外的損失，包括：
（1）自然災害損失；
（2）因管理不善造成貨物被盜竊、發生黴爛變質等損失；
（3）其他非正常損失。
稅法對非正常損失的購進貨物的進項稅額和非正常損失的在產品、產成品所耗用的購進貨物或應稅勞務的進項稅額不準予從銷項稅額中抵扣，是考慮到納稅人的這部分損失與其生產經營活動沒有直接的關係，這部分非正常損失中的進項稅額不應由國家承擔。
上述不得將進項稅額從銷項稅額中抵扣的各項目，納稅人須認真掌握，並在計稅時嚴格執行。
三、應納稅額的計算
在計算出銷項稅額和進項稅額後就可以得出實際應納稅額。納稅人銷售貨物或提供應稅勞務，其應納稅額為當期銷項稅額抵扣當期進項稅額後的餘額。基本計算公式為：
應納稅額＝當期銷項稅額—當期進項稅額
增值稅應納稅額計算公式直觀地反映了增值稅僅對商品流通環節產生的增值額徵稅的原理，同時，也簡潔、明了地解釋了增值稅的主要內容和計稅方法。為了使這個公式得以正確運用，需要掌握以下幾個重要規定：
（一）計算應納稅額的時間限定
為了保證計算應納稅額的合理、準確性，納稅人必須嚴格把握當期進項稅額從當期銷項稅額中抵扣這個要點。「當期」是個重要的時間限定，具體是指稅務機關依照稅法規定對納稅人確定的納稅期限；只有在納稅期限內實際發生的銷項稅額、進項稅額，才是法定的當期銷項稅額或當期進項稅額。目前，有些納稅人為了達到逃避納稅的目的，把當期實現的銷售額隱瞞不記帳或滯後記帳，以減少當期銷項稅額，或者把不是當期實際發生的進項稅額（上期結轉的進項稅額除外）也充作當期進項稅額，以加大進項稅額，少納稅甚至不納稅，這是違反稅法規定的行為。為了制止這種違法行為，稅法首先對銷售貨物或應稅勞務應計入當期銷項稅額的時間加以限定，如：採取直接收款方式銷售貨物，不論貨物是否發出，均為收到銷售額或取得索取銷售額的憑據，並將提貨單交給買方的當天；採取託收承付和委託
銀行收款方式銷售貨物，為發出貨物並辦妥託收手續的當天；納稅人發生本章第一節視同銷售貨物行為中第③至第⑧項的，為貨物移送的當天等，以保證準時、準確記錄和核算當期銷項稅額。同時，對計入當期進項稅額的時間也加以嚴格限定。1995年1月國家稅務總局頒發的《關於加強增值稅徵收管理工作的通知》明確規定，增值稅一般納稅人購進貨物或應稅勞務，除取得防偽稅控系統開具的增值稅專用發票外（國稅發[2003]17號），其進項稅額申報抵扣的時間，按以下規定執行：
1.工業生產企業購進貨物（包括外購貨物所支付的運輸費用），必須在購進的貨物已經驗收入庫後，才能申報抵扣進項稅額，對貨物尚未到達企業或尚未驗收入庫的，其進項稅額不得作為納稅人當期進項稅額予以抵扣。
2.商業企業購進貨物（包括外購貨物所支付的運輸費用），必須在購進的貨物付款後（包括採用分期付款方式的，也應以所有款項支付完畢後）才能申報抵扣進項稅額，尚未付款或未開出承兌商業匯票的，或分期付款，所有款項未支付完畢的，其進項稅額不得作為納稅人當期進項稅額予以抵扣。
商業企業接受投資、捐贈或分配的貨物，則以收到增值稅專用發票的時間為申報抵扣進項稅額的時限；申報抵扣時，應提供投資、捐贈、分配貨物的合同或證明材料。
對增值稅一般納稅人在商品交易所通過期貨交易購進貨物，其通過商品交易所轉付貨款可視同向銷貨單位支付貨款，對其取得的合法增值稅專用發票允許抵扣。
3.一般納稅人購進應稅勞務，必須在勞務費用支付後，才能申報抵扣進項稅額；對接受應稅勞務，但尚未支付款項的，其進項稅額不得作為納稅人當期進項稅額予以抵扣。
增值稅一般納稅人違反上述規定的，按偷稅論處，稅務機關一經查出，則應從當期進項稅額中剔除，並在該進項發票上註明，以後不論其貨物到達或驗收入庫，或支付款項，均不得計入進項稅額申報抵扣。
（二）計算應納稅額時進項稅額不足抵扣的處理
由於增值稅實行購進扣稅法，有時企業當期購進的貨物很多，在計算應納稅額時會出現當期銷項稅額小於當期進項稅額不足抵扣的情況。根據稅法規定，當期進項稅額不足抵扣的部分可以結轉下期繼續抵扣。
（三）扣減發生期進項稅額的規定
由於增值稅實行以當期銷項稅額抵扣當期進項稅額的「購進扣稅法」，當期購進的貨物或應稅勞務如果事先並未確定將用於非生產經營項目，其進項稅額會在當期銷項稅額中予以抵扣。但已抵扣進項稅額的購進貨物或應稅勞務如果事後改變用途，發生《增值稅暫行條例》第＋條第（二）至（六）項所列情況的（即：用於非應稅項目、用於免稅項目、用於集體福利或者個人消費、購進貨物發生非正常損失、在產品或產成品發生非正常損失），將如何處理呢？根據稅法規定，應將該項購進貨物或應稅勞務的進項稅額從當期發生的進項稅額中扣減，無法準確確定該項進項稅額的，按當期實際成本計算應扣減的進項稅額。
這裡需要注意的是，所稱「從當期發生的進項稅額中扣減」，是指已抵扣進項稅額的購進貨物或應稅勞務是在哪一個時期發生上述五種情況的，就從這個發生期內納稅人的進項稅額中扣減，而無須追溯到這些購進貨物或應稅勞務抵扣進項稅額的那個時期。另外，對無法準確確定該項進項稅額的，「按當期實際成本計算應扣減的進項稅額」是指其扣減進項稅額的計算依據不是按該貨物或應稅勞務的原進價，而是按發生上述情況的當期該貨物或應稅勞務的實際成本，即進價＋運費＋保險費＋其他有關費用，按徵稅時該貨物或應稅勞務適用的稅率計算應扣減的進項稅額。前述實際成本的計算公式，如果屬於進口貨物是完全適用的；如果是國內購進的貨物，主要包括進價和運費兩大部分。
（四）銷貨退回或折讓的稅務處理
納稅人在貨物購銷活動中，因貨物質量、規格等原因常會發生銷貨退回或銷售折讓的情況。由於銷貨退回或折讓不僅涉及銷貨價款或折讓價款的退回，還涉及增值稅的退回，這樣，銷貨方和購貨方應相應對當期的銷項稅額或進項稅額進行調整。為此，稅法規定，一般納稅人因銷貨退回或折讓而退還給購買方的增值稅額，應從發生銷貨退回或折讓當期的銷項稅額中扣減；因進貨退出或折讓而收回的增值稅額，應從發生進貨退出或折讓當期的進項稅額中扣減（具體處理辦法詳見本章第＋一節八、開具專用發票後發後發生退貨或銷售折讓的處理）。
目前，一些企業在發生進貨退出或折讓並收回價款和增值稅額時，沒有相應減少當期進項稅額，造成進項稅額虛增、減少納稅的現象。這是稅法所不能允許的。對於納稅人進貨退出或折讓而不扣減當期進項稅額，造成不納稅或少納稅的，都將被認定為是偷稅行為，並按偷稅予以處罰。
（五）應納稅額計算實例
例1：：某生產企業為增值稅一般納稅人，適用增值稅稅率17%，2002年5月有關生產經營業務如下：
（1）銷售甲產品給某大商場，開具增值稅專用發票，取得不含稅銷售額80萬元；另外，開具普通發票，取得銷售甲產品的送貨運輸費收入5.85萬元。
（2）銷售乙產品，開具普通發票，取得含稅銷售額29.25萬元。
（3）將試製的一批應稅新產品用於本企業基建工程，成本價為20萬元，成本利潤率為10%，該產品無同類產品市場銷售價格。
（4）銷售使用地過的進口摩託車5輛，開具普通發票，每輛取得含稅銷售額1.04萬元；該摩託車原值每輛0.9萬元。
（5）購進貨物取得增值稅專用發票，註明支付的貨款60萬元，進項稅額10.2萬元，貨物驗收入庫；另外，支付購貨的運輸費用6萬元，取得運輸公司開具的普通發票。
（6）向農業生產者購進免稅農產品一批，支付收購價30萬元，支付給運輸單位的運費5萬元，取得相關的合法票據，農產品驗收入庫。本月下旬將購進的農產品的20％用於本企業職工福利。
計算該企業2002年5月應繳納的增值稅稅額。
（1）銷售甲產品的銷項稅額：
80×17％+ 5.85÷（1＋17％）×17％＝14.45（萬元）
（2）銷售乙產品的銷項稅額：
29.25÷（1＋17％）×17％＝4.25（萬元）
（3）自用新產品的銷項稅額：
20×（1＋10％）×17％＝3.74（萬元）
（4）銷售使用過的摩託車應納稅額：
1.04÷（1＋4％）×4％×50％×5＝0.1（萬元）
（5）外購貨物應抵扣的進項稅額：
10.2＋6×7％＝10.62（萬元）
（6）外購免稅農產品應抵扣的進項稅額：
（30×13％＋5×7％）×（1—20％）＝3，4（萬元）
（7）該企業5月份應繳納的增值稅額：
14.45＋4，25＋3.74＋0.1—10.62—3.4＝8.52（萬元）