2020年4月1日訊/生物谷BIOON/---通過挖掘大量的遺傳數據,維吉尼亞大學醫學院的研究人員有望促進醫生治療癌症,預測患者預後並確定哪種治療方法最適合某類患者的能力。
研究人員已經確定了我們基因的遺傳變異,這些變異影響患者在診斷後和治療過程中的表現。有了這些信息,醫生將能夠檢查患者的基因組成,從而提供真正個性化的藥物。
「腫瘤學家可以根據腫瘤的等級,分期,患者的年齡,腫瘤的類型等來估計患者的表現。我們發現[添加單個遺傳預測因子]可以將我們的預測能力提高5%達到10%」,UVA的MBBS博士Anindya Dutta說道。 「許多癌症具有可預測結果的多種遺傳遺傳變化,因此,如果我們添加這些遺傳變化,而不是增加10%,我們可能會準確預測患者如何使用當前療法的能力增加30% 。」
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UVA的生物化學和分子遺傳學系主任Dutta認為,回顧患者的遺傳遺傳組成可以為預測結果和選擇從糖尿病到心臟疾病的許多其他疾病提供類似的益處。因此,該方法代表了醫生努力根據患者的需求和基因組成量身定製治療方法的重要一步。
為什麼有些病人的病情比其他病人好?這項研究為長期困擾醫生的問題提供了答案。Dutta說:「每位臨床醫生都有這樣的經驗:兩名患者完全相同的癌症-相同的等級,相同的階段,接受了相同的治療。其中一名患者表現很好,而另一名則沒有。」 「一直以來,我們一直以為我們不了解這兩者之間的某些關聯,例如,可能有一個患者有某些腫瘤特異性突變,而另一位患者沒有。但是在我們看來,有了所有這些基因組數據,我們可以檢驗另一個假設。」
為了確定患者的遺傳差異是否是答案,Dutta和他的同事深入研究了「癌症基因組圖集」,這是由美國國立衛生研究院國家癌症研究所收集的大量遺傳信息庫。研究人員試圖將遺傳遺傳變異與患者預後相關聯。
Dutta回憶說:「實驗室中一位非常聰明的博士生Ajay Chatrath在UVA的雲計算服務的幫助下,設法下載了所有這些基因組測序數據,並確定了所謂的種系變異-不僅是腫瘤特異性突變,而且是從父母那裡繼承並存在於所有細胞中的突變病人。」
研究人員開始時規模很小,但很快就意識到這項工作可以完成得很快,並且可以帶來多大的收益。Dutta說:「一旦我們意識到這是一件非常容易的事,我們就繼續進行了所有33種癌症和所有10,000名患者的治療,這又花了六個月的時間。
Dutta渴望分享他的發現,希望找到合作者,並激發研究人員和私營企業開始為其他條件挖掘數據。他說:「這是非常容易實現的結果,不僅可以應用於癌症,而且可以應用於所有類型的疾病,並且它們可以預測對所有類型療法的反應性。」(生物谷 Bioon.com)
資訊出處:Resarchers find way to improve cancer outcomes by examining patients' genesAjay Chatrath et al,
The pan-cancer landscape of prognostic germline variants in 10,582 patients, Genome Medicine(2020). DOI: 10.1186/s13073-020-0718-7