同治皇帝的死因如今一直成為我們津津樂道的話題，才19歲就去世，正史裡記載是死於天花，但是遭到很多人的懷疑，甚至宮廷太醫也懷疑，因為同治和慈禧太后鬥氣，經常去尋花問柳，所以就有了同治是染上梅毒才死亡的，也有說是得了疥瘡而死，究竟是什麼原因，到現在也是一個謎。
一：其實很多人懷疑同治是染上梅毒死亡的，也不是無中生有，空穴來風。
首先：這是常識，如果同治得的是天花，雖然當時沒有更好的藥物治理天花，但是絕對不至於死亡，除非是沒錢治病，民間都把天花叫做「天花之喜」，如果宮廷太醫調理得當的話還是可以恢復的，只是臉上會有麻子而已，據一個宮廷女官德玲稱：「同治便來就是一個體格強健的人，並不是那種弱不禁風的男子」。
其次：從同治皇帝的日常行為懷疑他染上梅毒，這是為什麼，因為同治自從和慈禧太后鬧翻，慈禧逼迫他和不喜歡的女子在一起，同治覺得沒意思，於是經常尋花問柳，怕去有名的青樓會遇見其他官員，於是經常去那些不知名的地方，很多太監和宮女都看見同治經常晚歸。沒多久就傳出同治得了天花的事情。
最後：這也是最有力的證據，那就是李德立的後代李鎮，他寫了一篇文章《同治究竟死於何病》？這上面記載了他的曾祖父李德立奉旨前去幫同治看病，當時他和另外一個太醫張本仁兩個人會診之後，一致肯定就是得的梅毒梅大瘡，但是當時為了自保，以及皇室的顏面，於是就謊稱是得了天花，於是就用了治療天花的藥物，但是同治最終還是去世了。這主要是因為慈禧太后擋著同治得面暴打他的皇后阿魯特氏，同治氣的直接從床上掉了下來，一直昏闕，到了第二天就病故了。
二：也有人說就是得了天花
第一：從發病開始，一般天花發病比較急，也同時伴隨著高燒，這些症狀同治都有，正史記載同治連續高燒七天不退，經常嘔吐，從這裡可以看出，是天花無疑。
第二：就是從《萬歲爺天花喜進藥用藥底簿》的用藥記錄來看，也就是天花，同治伴有天花的頭痛、背痛、發冷等一系列症狀，而梅毒是沒有這些症狀的，還有太醫開的藥，後來經過醫學家分析，這些全都是控制天花的藥物。
第三：醫學家根據同治皮疹的部位以及轉化的規律得出結論，同治的病情和天花的發病過程全部符合，同治是皰疹，而梅毒是斑疹。
那這裡就有人問了，同治有那麼多太醫看著，怎麼還會死於天花呢？據說是因為同治在患病的後期皮膚被感染了，越來越多的併發症導致同治喪失抵抗力，最後發展成了「壞疽性口炎」，一般到了這種地步，基本上就宣告死亡了。
這樣看來，同治是死於天花的可能性更大，因為梅毒這個說法大多來源於小說和野史。