Western blot(蛋白印跡)是科研研究中最為平常的實驗,但卻蘊含了很多知識。儘管我們在接觸該實驗時都會被虐的體無完膚,但卻秉承著「WB虐我千百遍,我卻待它如初戀」的精神一直和WB鬥智鬥勇。現在就把各位前輩做WB的各種經驗總結起來,希望對大家能有所幫助。
WB的一般流程
一、 蛋白的提取
經驗總結:
1:提取蛋白質過程中,應在低溫環境下進行,以抑制蛋白酶的水解作用(可加入適合的蛋白酶抑制劑)。
2:蛋白樣品建議分裝後冷凍乾燥或直接以液體態置-80℃中保存,不要反覆凍融。
3:蛋白濃度低時,可使用超濾膜濃縮或者用真空凍幹機將蛋白凍幹。
二、電泳
經驗總結:
1:配膠時各種試劑一定要混合均勻。
2:APS在-20℃可以長期保存,在4℃保存不要超過一周。
3:上樣時:根據蛋白表達豐度調整蛋白上樣量,儘量保證每孔上樣量保持一致。
4:為了檢測整個實驗系統或校準實驗結果,需要設置內參(一般指由管家基因編碼表達的蛋白)。
三 、轉膜
用於western blot的雜交膜主要有兩種:NC膜和PVDF膜,可依據目的蛋白與膜的結合能力及膜的孔徑來挑選不同的轉移膜。轉膜方法分為溼轉法和半乾轉法,兩種方法各有利弊。溼轉轉膜效率最佳,但浪費試劑和溶液且費時;半乾轉省時、省試劑但更適合轉印分子量較小的蛋白。下圖是半乾轉的模擬圖。
經驗總結:
1:膠在負極,膜靠近正極;濾紙不要大過膜,防止短路。
2:夾好膜和凝膠後,確定在凝膠、膜和濾紙之間沒有氣泡存在,否則會導致轉膜不完全。
四、封閉
常見的封閉液有5%脫脂奶粉、BSA和Western Blot膜封閉液(生物試劑公司提供)。封閉液的選取可結合實驗室具體情況而定。
五、抗體孵育
一抗的孵育是WB實驗過程中的核心步驟。抗體的使用是一種藝術,一種抗體一個脾氣。選擇抗體時,一方面需要考慮所選抗體是否能識別凝膠電泳後轉印至膜上的蛋白,另一方面需要考慮所選抗體是否會引起交叉反應條帶,以免出現非特異性條帶。一抗通常4℃孵育過夜,二抗通常1:5000-1:10000稀釋,室溫孵育1-1.5h,洗膜通常選用TBST,洗滌時間一般為10min,洗滌3次。
六 、底物顯色
將NC膜或PVDF膜置於保鮮膜上,加入適量的發光液,在暗室曝光或者移入凝膠分析儀中顯影。
七 、WB結果定量分析
WB做完後,可採用圖像處理軟體ImageJ對結果進行灰度分析。
八 、WB示例解析
如下圖所示,目的條帶單一,內參均一就是理想中的WB結果。