科學網—建立微擬球藻資料庫支撐「綠色重生」計劃

2020-11-25 科學網
中科院青島生物能源與過程研究所等
建立微擬球藻資料庫支撐「綠色重生」計劃

 

本報訊（記者廖洋 通訊員劉佳）為了促進全球微擬球藻研究群體的資源共享和合作、加速工業產油微藻合成生物學和分子育種技術的進展，中科院青島生物能源與過程研究所單細胞中心聯合來自韓國、德國、美國、法國等國的14個實驗室，發布了「微擬球藻設計與合成資料庫」（NanDeSyn）。該工作近日發表於《植物學期刊》。

工業產油微藻能夠規模化地利用光能將二氧化碳和水轉化為油脂，因此是人類社會糧食、營養和燃料可持續供應的潛在解決方案之一。記者了解到，微擬球藻的單倍體核基因組較少、DNA轉化簡易可靠、基因組編輯效率高，而且基因表達調控技術靈活多樣。

該資料庫系統地收集和整合了包括微擬球藻屬內所有種的最新基因組序列、基因注釋、轉錄組、蛋白組、小RNA等的功能基因組學和表觀遺傳學數據。同時，資料庫通過網站提供了基因信息搜索、基因組比對、共線性分析、基因富集分析、代謝通路分析、基因組瀏覽器等在線數據挖掘工具。此外，研究人員還結合文獻調研，展示了每個基因的研究現狀，以及相應的基因突變載體和突變株等信息，以支撐這些研究材料的無償共享。

據悉，在NanDeSyn資料庫的基礎上，相關國際合作研究網絡將不斷拓展，共同推動以微擬球藻為底盤的光碟機固碳合成生物學技術，即「綠色重生」研究計劃的實施。

相關論文信息：

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/tpj.15025

《中國科學報》 (2020-11-11 第4版 綜合)

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