適宜用作有機生態型無土栽培的基質很多，如草炭、椰子殼、棉籽殼、樹皮、鋸末、葵花稈蔗渣、爐渣、河沙、珍珠巖、鋸木屑、菌糠、沼渣、酒糟、各種作物獵及各種畜禽類肥等。這些基質中含有豐富的營養成分，是供給植物養分的重要來源。
有機生態型基質是一個穩定的緩衝性較強、具有良好根系生長環境的系統。其微量元素含量豐富，一般不必考慮添加。對有機生態型無土栽培技術進行了大量的研究和應用，證實了有機生態型基質栽培確實能生產出無汙染、品質和風味好的產品。通過研究還獲得了一些實用技術。目前該技術已廣泛應用於生產中。
傳統無土栽培是以各種無機化肥配製成一定濃度的營養液，且需要定期配製，所用元素和使用濃度要求十分嚴格.需要有一定文化水平的人才能完成。有機生態型無土栽培則是以各種有機肥或無機肥的固體形態直接混施於基質中，可以就地取材，操作方便，人們一學就會。
它採用有機基質和有機肥，不僅各種營養元素齊全，尤其微量元素豐富。因此，管理上只需要著重考慮氮、磷、鉀三要素的供應量及其平衡狀況，無需嚴格考慮各種元素在施肥時的配製比例，大大簡化了操作管理過程，一般的人員就可完成。
有機生態基質的原料在我國廣大農村可以就地取材，如玉米，向日葵，秸稈，椰殼，鋸末，樹皮等。都可以按一定配比混合後作為基質使用。為了調整基質的物理性能，也可以加入一定量的無機物質。如蛭石，珍珠巖，爐渣，沙子等。無土栽培生產者應根據當地的具體情況，就地取材，選擇適合本地區需要的基質。