太陽能電池在使用過程中確實具有無排放，無噪音，無能耗的清潔能源稱號，但當今主流卻忽略了太陽能電池光鮮表面背後生產過程中的高汙染、高能耗的問題。
一、高汙染
現太陽能電池90%為晶體矽電池，其原材料為多晶矽，由金屬矽(工業矽)提純而來，目前國內均採用化學法(改良西門子法)：先將金屬矽轉變為三氯氫矽，再進行分餾和精餾提純，得到高純度的三氯氫矽 (具有毒性、腐蝕性和易爆炸) 後，最終由氫氣還原而成；這一過程中只有約25%的三氯氫矽傳化成多晶矽，其餘基本直接排放；而汙染最嚴重的，則是在還原過程中產生的副產品——四氯化矽(一種腐蝕性極強、難以保存的有毒液體，具有急毒性。由於四氯化矽不能自然降解，如果將四氯化矽傾倒或掩埋，水體將會受到嚴重汙染，土地會變成不毛之地)。這還不包括大量氯氣等其它易燃易爆有毒氣體。
每生產1KW太陽能電池板需耗費10Kg多晶矽，產生80Kg以上四氯化矽。而國內能通過氫化還原閉環工藝循環減小四氯化矽排放的僅有一家；而即使通過氫化還原閉環工藝循環，四氯化矽的排放仍到達50%；四氯化矽雖然也是化工原料，但下遊的化工廠消化十分有限。國內絕大多數多晶矽生產廠家的四氯化矽少部分以低價賣給下遊廠家，一部分存儲，一部分則偷偷掩埋。
這還不包括矽片後期處理的其它輔料。如制絨過程中用到的各種強酸強鹼溶液、擴散使用的三氯氧磷、PECVD中使用的矽烷等，這些輔材的消耗不比主材料少。
由於太陽電池具有時效性，只有陽光照射才會產生電能；所以必須用蓄電池在有陽光時蓄電，無陽光時維持供電。而蓄電池又以鉛酸蓄電池為主，其汙染程度是相當大的。
二、高能耗
矽石冶煉為金屬矽、金屬矽提純為多晶矽、多晶矽片處理需要耗費大量的電能，主要集中在矽石冶煉、多晶矽的鑄錠和擴散這幾個流程；每生產1KW太陽能電池板需要耗費5800-6000度電(國內平均數)。我們可以這樣計算：按平均光照時間4小時/天，太陽能電池是壽命為15至20年(按20年)，1KW太陽能電池總的發電量為4x365x20=29200KW• h；與耗掉的6000度電相比，其電能再生比只有4.87，這還沒有算上光照效率以及逆變電源的損耗和控制電路的損耗；遠遠低於水電和風電。如果再加上超白玻璃、鋁合金、鋼材、電纜等輔件，其電能再生比是相當低的。
現國內生產的太陽能電池板90%以上用於出口，他國在享受著清潔能源，而我國卻飽受能耗和汙染之苦。我國的太陽能電池產量2003年為10MWp，2004年50 MWp，2005年200 MWp，2006年400 MWp，2007年1088 MWp，2008年2600 MWp，2009年4000 MWp；之所以會出現井噴的情況，只因為ZF的唯增長論和唯GDP值。而企業只照葫蘆畫瓢，而不做技術革新、監管的缺乏和環保意識的淡薄是造成高汙染和高能耗的另一重要原因。