除了非洲之外的現代人裡有1%至4%的基因來源於尼安德特人，尼安德特人和智人是屬於亞種的關係？漸變種？還是獨立物種？還是同一物種？科學家遲遲沒有下定義。我想也許是詞窮了吧，下面我們透過現象看本質，看看科學家們為什麼如此為難。
我們需要了解兩件事：
（1）物種是什麼
（2）智人和尼安德特人（下面簡稱尼人）的演化路線
物種的本質
個體之間能不能繁殖可育後代，直接原因並不是「產沒產生生殖隔離」，「是不是同一物種」。物種、生殖隔離只是人類描述的概念。
物種的傳承靠的是基因的傳遞，物種的演化直接因素也是基因。物種多樣性，是基因多樣性的表達。基因多樣性的來源是基因突變、染色體變異和基因重組。
基因庫的改變導致生殖隔離
我們把同一種群包含的所有基因，叫做這個種群的基因庫。基因在種群中出現的頻率，叫做基因頻率。
當物種產生地理隔離，種群分居兩地。假設過了100億年，這兩個種群基因庫沒有太大差異，那麼它們還是同一物種，並不會出現生殖隔離。
重點：
基因庫沒有太大差異，不是單純指基因在100億年後沒有發生變異，分為兩種情況：
（1）基因庫不變，原來什麼樣，現在什麼樣。
（2）基因庫發生了微小的改變，比如：黑眼睛變藍眼睛；白皮膚變黑皮膚；
還有一種可能沒有導致生殖隔離：
（3）各自都演化出了新的物種，基因庫出現很大的差異，但是演化方向接近，並沒有產生絕對的生殖隔離。
生殖隔離
如果基因頻率改變了，物種肯定進化了，但是不一定會產生生殖隔離，形成新的物種。生殖隔離條件是大量的基因頻率改變的積累，促使基因庫差異非常大。這樣的結果就會形成新的物種，這是循序漸進的過程，需要足夠的時間。
基因頻率
上面說的黑眼睛還是藍眼睛、白皮膚還是黑皮膚是基因庫中個別的基因頻率的改變，導致的性狀改變。基因頻率的改變是可遺傳變異和基因重組自然選擇的結果。
這個有點繞，舉個粒子：
某種昆蟲種群裡突然變異出了一個外表顏色接近樹木顏色的個體，剛好這種變異還可以遺傳。由於這個顏色有利於保護自己不容易被發現，隨著一代代繁衍，種群全變成了這種顏色。那麼表現這個性狀的基因，基因頻率就由0變成了100%。
搞清楚這些事情，接下來我們開始說說尼人和智人是什麼情況。
直立人的出現
我們從3000萬年前講起吧，當時地殼運動，東非大裂谷形成，促使了裂谷東面的森林變成了草原。原本在樹上棲息的猿猴，因為棲息的樹木減少，不得不下地生活。由於環境突然的改變，下了地的猿猴為了適應地面、獲取食物、節約能量，從四肢行走慢慢演化成了直立行走。經過了南方古猿、能人、匠人等幾次演化後，在200萬年前，直立人誕生了。
走出非洲
晚期的直立人大腦容量達到了1200毫升左右，平均身高達到160釐米，已經很接近現代人了。直立人經過前面祖先的積累，已經點亮了很多技能，比如用火，製造石器，打獵採集什麼的更不在話下。這些技能大大提升了能量獲取的效率，也使得直立人具備了遷徙的能力。
非洲就像人才市場一樣，一代又一代，一邊演化著，一邊往外輸送人才，源源不斷。直立人兵分好幾路，走出非洲向外四處擴散。中國境內的北京人、藍田人、元謀人等等，就是直立人遷徙產生的。
智人和尼人的誕生
大約在60萬年前，直立人中出現了一個分支叫做海德堡人，海德堡人這個分支同樣也跟前輩們一樣向外遷徙，一部分在歐洲定居下來，叫做歐洲海德堡人。非洲也留下一部分繼續深造，叫做非洲海德堡人。
25萬年前，非洲海德堡人的演化出了早期智人。
23萬年前，歐洲海德堡人的後代，尼安德特人也出現了。
當然同期還有很多分支，只是在這倆面前就有點不夠看了。智人同樣想衝出非洲這個牢籠，但是當時的尼人是歐洲的統治者，守著出關要道。智人第一次出關被打了回來，只有少部分人突圍成功。大部分只能回爐再造，臥薪嘗膽。當智人第二次發起衝鋒時，勢如破竹，直接秒掉了所有競爭對手，殺的殺，吃的吃，同化的同化，最後全世界只剩下了智人，也就是我們。
現代科學家發現，除非洲以外，大多數現代人的基因中有至少1至4%源自尼安德特人。智人衝出非洲時，還有一部分智人留在了非洲，也就是現在的非洲人，大部分非洲人基因裡並沒有尼人的基因。也就是說只有衝出非洲的智人與尼人發生了一些不可告人的事情。
我們回過頭來看看智人與尼人的關係，首先他們有共同的祖先海德堡人，但是分隔兩地的海德堡人，在不同的氣候下沿著兩個不同的方向演化著。
觀點：
我認為之所以尼人並沒有與智人發生絕對的生殖隔離，很大一部分原因就是他們的共同祖先，海德堡人已經離成功人士非常很近了。
海德堡人男性的平均身高為1.72米 體重為62.5kg，擁有較大的腦容量，大約是1100到1400毫升，高於現代人類的平均值1350毫升。他們已經具備了製造、學習一些複雜事物的能力，具備了基本的原始形態的語言。
他們已經可以依靠製作外物去抵抗環境對他們的篩選，在演化方向上佔據了一定的主動。這種主動減弱了基因庫的改變，智人也是如此。與其說他們在進化，不如說他們是從一個初步懂得抵抗環境的狀態下分隔兩地，然後在不同的環境下，繼續抵抗，繼續精益求精。他們演化主要方向和基因基礎並沒有太大的區別。
結論
尼人與智人的關係就是上文所提到的基因庫變化（3），同一祖先，不同地域演化，沒有產生絕對的生殖隔離。大自然演化是錯綜複雜而又神奇的，而定義只是為了學習研究，人為約定的，只有了解本質才能看清答案。