細胞外基質( extracellular matrix , ECM )是由大分子構成的錯綜複雜的網絡。為細胞的生存及活動提供適宜的場所,並通過信號轉導系統影響細胞的形狀、代謝、功能、遷移、增殖和分化。
基質金屬蛋白酶(matrix metalloproteinase,MMP)可以降解細胞外基質成份,需要Ca2+、Zn2+等金屬離子作為輔助因子,是一組具有許多共同生化性質的可降解細胞外基質的酶。基質金屬蛋白酶2(MMP2)主要降解IV型膠原,基質金屬蛋白酶9(MMP9)可以降解彈性蛋白、膠原蛋白、明膠和纖維蛋白等細胞外基質的成分。基質金屬蛋白酶的失調是多種疾病發生、發展的重要機制之一。
明膠酶譜實驗可以檢測MMP2和MMP9的活性,是分子生物學的常用實驗技術之一。先將樣品進行SDS-聚丙烯醯胺(SDS-PAGE,含0.1%明膠)電泳分離,然後在有二價金屬離子存在的緩衝系統中使樣品中的MMP-2和MMP-9恢復活性,在各自的遷移位置水解凝膠裡的明膠,最後用考馬斯亮藍將凝膠染色,再脫色,在藍色背景下可出現白色條帶,條帶的強弱與MMP-2和MMP-9活性成正比。
實驗流程如下:
組織或細胞的蛋白樣品製備可用常規的方法,但需注意蛋白裂解液中不能加入EDTA,因為EDTA是金屬離子螯合劑,可以絡合Zn2+,抑制MMP的活性;也不能加入β-巰基乙醇或DTT,因為會導致蛋白的二硫鍵被打開,蛋白不能復性。推薦用PBS或Tris緩衝液(pH7.5)作為蛋白提取的緩衝液,可以加入0.5%的PMSF。
明膠母液配製後可在4℃保存,最好不超過1周。
2)電泳
4℃、常規電泳即可,可以適當延長電泳時間,至溴酚藍完全出膠。上樣量一般為50μg,可根據實驗的具體情況和預實驗結果調整。
①上樣緩衝液中不能加入β-巰基乙醇或DTT,原因同上。
②樣品與上樣緩衝液混合後直接上樣,樣品不要煮沸,高溫會導致蛋白不可逆的失活。
1)將凝膠置於洗脫液(2.5% Triton X-100,50mM Tris-HCl,5mM CaCl2,1μM ZnCl2,pH7. 6)中振蕩洗脫2次,每次40分鐘。
2)漂洗液(50mM Tris-HC,5mM CaCl2,1μM ZnCl2)漂洗2次,每次20分鐘。
3)凝膠置於孵育液(50mM Tris,pH7.5,150mM NaCl,10mM CaCl2,1μM ZnCl2,0.02% Brij-35)中37℃ 孵育42-48小時。
4)染色液(考馬斯亮藍染色液)染色3小時。
染色液配方表
5)脫色液A、B、C分別脫色(脫色液配方及時間見附表)。
脫色液配方及脫色時間