清華大學和臺灣大學兩所學校都屬於國內知名大學，相對來講國人更熟悉清華大學，而不太了解臺灣大學，事實上就是位於臺灣省臺北市的一所綜合性大學。臺灣大學整體實力較強，但是相對清華大學來講，還是弱了一些，畢竟清華大學項目引進和師資力量方面要更強一些。
臺灣大學創建於1928年，當時還是日本殖民時期，時名臺北帝國大學。臺灣大學初期主要涉及文、理、農、林四個領域，建校七年之後才設立醫學部。1945年臺灣光復之後，改名為臺灣大學。1949年國民黨退守臺灣，臺灣大學由此備受重視，可以說是臺灣省第一高校，此後逐漸成長為一所綜合性大學，涉及文、理、商、工、醫、農等多個學科門類。
臺灣大學雖然學科門類較多，但是其整體還是偏工科方向的高校，在電子、機械、土木、化工、材料、計算機方面實力比較突出，財務、金融、基本理學實力也還算不錯。臺灣大學在上個世紀六七十年代屬於鼎盛時期，成果顯著，學術地位突出，不過近些年有趨於下降的趨勢，一方面是因為臺灣經濟發展緩慢，另一方面臺灣優質生源外流的緣故。臺灣大學知名校友很多，如馬英九、蔡英文等人都畢業於這所學校。
清華大學雖然早期被定位理工科高校，但是上個世紀八十年代逐漸向綜合性大學發展，目前已經基本完成綜合性大學的布局，而且各方面均有成果。清華大學在國家科技三大獎方面絕對屬於「大拿」型，目前已經擁有近600項，實力冠絕全國。綜合來看，清華大學的實力完勝臺灣大學，這其實是各方共識，不僅僅國內如此認為，事實上國際教育機構也如此認為，無論是歐美教育機構，還是亞洲教育機構均如此認定！