疫情下的職業生涯急轉彎:面對疫情,行動起來

2020-09-29 BioArtReports

原文 | Robyn Kaake (舊金山加州大學細胞分子藥理學助理教授)

編譯 | XZ

責編 | 十一月


編者手記:針對全球的新冠疫情大流行的情況,對於身處博後以及學術生涯不同階段人們來說既是機遇也是挑戰,為了對疫情期間科學研究的走向以及職業生涯的安排進行了解,BioArt Reports編輯部對Cell上發表良師益友(Mentor)版塊中的文章In science, crisis is a call to action進行編譯,希望能給大家一些啟發!


對我來說,從博士後到助理教授的職業轉變發生在新冠病毒爆發的特殊的時期。早在去年我就在期待這種轉變,之後我選擇與加州大學的Nevan Krogan實驗室一起合作,以蛋白質組學為出發點來研究宿主與病原體的相互作用,這一選擇使得該轉變更加令人興奮。

我們的小組由Nevan Krogan教授所領導,是一個由40至50名具有不同的背景和專業知識研究人員組成的龐大團隊。此外,我們還是一個「靈活」的團體,善於與世界各地的研究團隊合作一起探索新的研究領域。對於我來說,從博後過渡到實驗室中的領導角色,就意味著扛下了指導學生、尋求資助以及合作夥伴的重擔。

一切都在有序的進行著,然而新冠肺炎的爆發打破了一切。


新世界,新形勢,新角色

回顧2019年12月,新冠肺炎開始在中國蔓延。當我們寒假結束回到實驗室時,SARS-CoV-2已成為我們實驗室新的研究領域。到2020年2月份的時候,病毒的傳播速度變得更快,使得課題組的一些研究人員不得不放棄手中的事情轉而研究新冠病毒。在3月中旬,世衛組織宣布新型冠狀病毒已經傳播到美國,包括我們所在的加州地區。這時候我們面臨著實驗室關閉的壓力,緊迫感也隨之產生。在實驗室關閉之前,我們以極快的速度對29種SARS-CoV-2編碼蛋白中的26種進行了質譜分析,而這在平常是需要幾個月或者幾年才能完成的任務。

在我正式成為助理教授兩天後,我們的數據也收集完了。這個時候Nevan召集了UCSF調查小組來領導QBI冠狀病毒研究小組,該小組致力於對我們實驗室關閉之前所收集的數據進行梳理與分析,目的是為了建立一個SARS-CoV-2病原體—宿主相互作用網絡,從而針對該網絡來預測藥物靶點,之後在細胞模型中進行藥物測試,進而啟動治療新冠肺炎的研究。

為了應對當前的危機並使臨床研究人員儘快的掌握我們所收集的數據,因此我們需要儘快的將相應的文章發表出去。但構建出完美的手稿則是個漫長的過程,它需要擁有相應的生物學知識以及對大量的文獻和資料庫進行研究。為了將這篇高質量的手稿發出來,我們團隊的成員沒日沒夜的工作,最終在最短的時間裡完成了。這是需要團隊合作的,單靠個人是根本不可能實現。

機遇與挑戰:COVID-19 是變革的催化劑

事實證明,在最短的時間內完成高質量工作的解決方案是資源管理。對我們來說,這意味著儀器管理和人員調配。這種蛋白質組學實驗需要準備進行質譜分析的樣品,之後對數據進行分析和評估,才能進一步理解其所代表的生物學意義。而完成這個過程,需要同時具備細胞和分子生物學、蛋白質組學和計算科學、化學和藥物開發以及病毒學的專業知識。

在COVID-19 這個項目中,我的任務就是對手稿進行補充以及進一步的數據擴展。但事實上,我所扮演的角色是對不同背景研究人員組成的團隊進行協調,這些人其實都未能謀面並且還分布在不同時區不同地方。

共同目標所帶來的緊迫感催促著我們全天候的工作,在這期間聊天工具和Google軟體起到了很大的作用,比如團隊可以即時性地交流進度和分配任務等。這兩款軟體在疫情隔離期間使我們團隊一直保持著相互協調相互配合的氛圍。如果有人需要幫助,但不知道該與誰聯繫,那麼可以直接通過群聊進行提問,之後就會有相應的團隊成員提供幫助;此外留言功能也解決了處於不同時區成員的交流障礙。就像簡訊改變了日常生活中的交流方式一樣,聊天工具也改變了我們科學界中交流的方式。

最重要的是,這種在線網絡打破了學術實驗室中存在的「等級制度」。因為聊天工具給學生、博士後、技術人員和教授提供了一個自由互動的虛擬場所。在這裡可以根據自己的時間和知識來提問和回答問題,而不需要考慮現實中所存在的「等級制度」。

COVID-19 危機改變我們科研的方式,即我們需要從「單打獨鬥」轉變為團體協作。

團隊協作帶來的好處

作為一名蛋白質組學家,我經常與世界上各大實驗室進行合作,而合作所帶來的好處就是你的合作夥伴會提出一些意想不到的好主意。

在團隊的共同努力下,我們創建了一個交互式SARS-CoV-2—宿主蛋白質相互作用網絡,其他科學家可以用它來理解我們的數據。在我成為一名研究生時,我的夢想就是開發出一種交互式網絡,而今天我們在不到一個月的時間裡就開發了出來!此刻我才體會到和一群具有不同研究背景的夥伴一起工作是多麼的快樂。

在這個項目中,我不僅了解到了科學學科之間的障礙,也發現了工業、技術和學術界之間存在的壁壘以及該如何組建具有各種專業知識、經驗和世界觀的多樣化團隊的方式。然而跨越這些無形障礙的一個關鍵點就是我們自身的創造力。

此外,這個針對SARS-CoV-2的項目也向我展示了各行各業科學家之間自由開放交流的好處。它教會了,作為科學家在面對這些生存的危機的時候,需要進行系統性變革並加強合作。變革總是艱難的,但如果我們採取強有力的行動並加以引導,這場危機的嚴峻考驗會讓我們變得比以前更加強大。


原文連結:http://crosstalk.cell.com/blog/crisis-is-a-call-to-action

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