大腦的邊緣系統在非語言行為表達中扮演者重要的角色。大腦在控制人體的所有行為，這種控制有時是自覺的，而有時則是一種潛意識的。這個前提是了解所有非語言行為的基石。從簡單的一個撓頭的動作到作一首交響曲，你所做的一切都是受大腦控制或指導的。
為什麼我們將重點放在大腦的邊緣系統呢？這是因為它對我們周圍世界的反應是條件式的，是不加考慮的。它對來自環境中的信息所做出的的反應也是最真實的。邊緣系統是唯一一個負責我們生存的大腦部位，它從不休息，一直處於「運行」狀態。另外，邊緣系統也是我們的情感中心。各種信號從這裡出發，前往大腦的其他部位，而這些部位各自管理著我們的行為，有的與情感有關，有的則與我們的生死攸關。當這些行為通過我們的手腳、軀幹、四肢和面部表情表達出來時，我們就可以對其盡心觀察和解密了。這些反應發生時不摻雜任何思考和語言，它們是最真實的。所以，邊緣系統也被稱作是「最誠實的大腦」。
由於我們的大腦的邊緣部分是不為人知所左右的，所以了解行為的產生對非語言行為的解譯工作尤為重要。你可以試著用你的思想來掩飾你真正的情感，但是邊緣系統總會進行自我調節，然後洩露一些線索，並堅信它們是誠實和有意義的。這種觀察和信任有時候甚至能夠挽救生命。
相對來說，我們大腦的第三部分加入顱頂的時間較晚，因此被稱作新皮質，即新大腦。這部分大腦負責高級認知和記憶，因此也被稱為「思考大腦」。正是這部分大腦將我們登上了月球。不過，它也是大腦中最不誠實的部分，因此它被稱為「愛說謊的大腦」。我們的這部分大腦會行騙，而且經常行騙。就像緊張的神色和汗水正是大腦對巨大壓力固有的反應方式。
在我們遇到危險時，邊緣系統會調整我們的行為。這種危險可能是一名史前人遇到一頭異常 兇猛的野獸，也可以是現代的一名公司職工遇到了一個鐵石心腸的老闆。在這一過程中，邊緣系統還會產生一定的非語言信息。幾千年來，擁有這些邊緣反應能力的人生存了下來，因此，這些行為也像電腦硬體一樣植入了我們的神經系統。