研究要點
- 急性髓系細胞白血病(AML)的分子危險分層主要依賴遺傳標記物。然而,表觀遺傳學的改變(包括:DNA甲基化,基因表達失調)可能會對患者的預後產生影響;
- 大多數成年AML患者用現在的治療方案不能治癒,只有約40%的年輕患者和10%的老年患者能夠達到長期生存。尋找更有效的治療方案並確定新的治療靶點很重要;
- 檢測AML患者表觀遺傳學的改變和預後相關的基因信息對臨床治療具有重要的指導意義。
急性髓系細胞白血病(AML)的分子危險分層主要依賴遺傳標記物。然而,表觀遺傳學的改變(包括:DNA甲基化,基因表達失調)可能會對患者的預後產生影響。為此,來自俄亥俄州立大學的研究人員評估了整合DNA甲基化和基因相關信息對AML患者臨床預後是否有關係。該研究發表於2013年12月30日在線出版的《臨床腫瘤學雜誌》(Journal of Clinical Oncology)上。
利用二代測序技術研究人員檢測了AML患者的DNA甲基化水平並鑑定差異性甲基化區域(DMRs)對細胞遺傳學正常的老年AML患者(>60歲)預後的影響,該研究共納入134例患者。和預後顯著相關的啟動子DMRs基因以及表達水平被用於預後基因的加權匯總表達評分,該研究分為4個獨立的實驗組,共納入355例患者。
研究人員在訓練集檢測了7種基因(CD34,RHOC,SCRN1,F2RL1, FAM92A1,MIR155HG和VWA8)發現,啟動子DMRs和基因表達和總生存期(OS)相關。研究人員對7種基因進行加權匯總表達評分發現,評分較低和無疾病生存期、總生存期延長相關。該結果已經在多變量模型和其他實驗組中得到驗證。單獨考慮7種基因,越高表達的基因預後越好。年輕和老年患者沒有基因表達或者只有一種基因高表達預後最好。
檢測AML患者表觀遺傳學的改變和預後相關基因信息對臨床治療具有重要的指導意義。
研究背景
大多數成年AML患者用現在的治療方案不能治癒,只有約40%的年輕患者和10%的老年患者能夠達到長期生存。因此,目前的迫切任務是尋找更有效改善患者預後的治療方案並確定新的治療靶點。為了實現這一目標,研究人員近期把重點放在和臨床預後有關的分子標誌物上。並且,把它們運用到患者的危險分層和臨床指導上。迄今為止,AML的疾病分類和預後在很大程度上依賴細胞遺傳學和基因檢測,而像表觀遺傳學改變等因素沒有納入其中。
表觀遺傳學是研究基因的核苷酸序列不發生改變的情況下,基因表達了可遺傳的變化。異常的DNA甲基化是最能體現白血病的表觀遺傳學變化,有可能是白血病的治療靶點。然而,現有的關於AML異常DNA甲基化的研究大部分只是研究幾個基因的改變,很少分析全基因組DNA甲基化的變化。僅僅依靠DNA甲基化來判斷預後的研究已經有報導,但整合遺傳學和表觀遺傳學的信息對AML患者預後和治療效果進行預測的研究尚未報導。