中國首個國家基因庫深圳開業運營,打造國民「生命銀行」

2020-11-25 獵雲網

【獵雲網(微信號:ilieyun)北京】9月22日報導(文/竹子)

今天,位於深圳市的國家基因庫正式運營。這是中國首個獲批籌建的國家基因庫,更是目前全世界最大的綜合性基因庫,由華大基因承建運營。

我國基因庫承建較晚,5年前由國家發展改革委、財政部、工業和信息化部、原衛生部聯合批覆,是繼美國國家生物技術信息中心(NCBI)、歐洲生物信息研究所(EBI)、日本DNA資料庫(DDBJ)之後的全球第四個國家級基因庫。

國家基因庫坐落於被稱為深圳大鵬半島,國家基因庫執行主任、華大基因研究院院長徐訊介紹說,即將投入使用的Ⅰ期建築面積4.75萬平方米。Ⅰ期建成後,綜合能力世界第一,包括可訪問數據量和數據存儲能力是世界第一,可訪問樣本量和樣本存儲能力也是世界第一。

基因庫裡放什麼

國家基因庫一期工程主要是 「三庫兩平臺」建設,即基因信息資料庫(幹庫)、生物樣本資源庫(溼庫)、生物活體庫(活庫)、數位化平臺、基因編輯平臺。

溼庫裡,在動物資源方面,基因庫主要保存珍稀動物及具有重要經濟價值的動物組織、細胞等。人類資源方面主要保存血液樣本、組織樣本、細胞系、細胞和尿液等,為重大疾病的前瞻性研究提供樣本資源支撐,為疾病診斷與預測及個性化醫療等奠定基礎。此外,溼庫裡還將存儲植物資源、海洋資源和微生物資源。

而幹庫則儲存基因、蛋白、分子、影像等多組學生物信息。

目前基因庫擁有四十多個資料庫,已完成近千種動物、植物、微生物基因組的數據收集和整理工作,佔全球已完成大型基因組數量的80%以上,包括基因組、轉錄組、蛋白質組、表觀組等多組學數據。

為什麼要建基因庫

在國家基因庫建成前,我國每年產出的大量基因數據都存在國際三大資料庫——NCBI、EBI、DDBJ中,在基因數據日益重要的今天,如果不能將我國獨特的基因數據保存在國內,未來將面臨巨大風險。

國家基因庫除了作為一個「國庫」來收集、保存生物樣本資源和生物信息數據,還將對樣本進行數位化,然後對數據進行解讀、分析,並部分開放。

基因庫開放性平臺包括存儲生物基因數據;提供生物信息檢索,為開放性、公益性科研平臺,向用戶提供生物信息檢索、比較、分析等服務;服務生命科學研究,向各科研機構提供生命科學研究平臺。

「我們希望搭建起基因資源挖掘的基礎性支撐平臺,形成生命密碼的存、讀、懂、寫、用能力於一體,聚焦生物醫藥、生物農業、微生物和海洋生物等領域,極大地縮短基礎科研到科技成果轉化應用周期。」梅永紅說。

數據顯示,當下已經實現對基因信息數據總量達60PB的訪問支持,1000萬份可溯源性生物樣本的存儲能力。目前我國基因庫已和100多家科研機構建立合作。

華大基因董事長汪建說,每個人一生中所有關鍵階段的標本都應該永久保存起來:從出生時的幹細胞,到20歲時的免疫細胞,到30歲時的生殖細胞……而國家基因庫,就是儲存這些樣本和數據的地方,像我們的「生命銀行」。

據悉,目前該基因庫自主研發的基因測序儀,已經將基因測序的成本降低,未來的普及目標將是1000元。

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