江蘇疾控部門發現新型環狀單鏈DNA病毒

2020-11-29 中國新聞網

江蘇疾控部門發現新型環狀單鏈DNA病毒

2016-12-16 19:06:34來源：中國新聞網作者：${中新記者姓名}責任編輯：

　　中新網南京12月16日電 (記者 申冉)16日，記者從江蘇省疾控中心獲悉，該中心從一例新加坡回國發熱病人送檢樣本中，首次鑑定出一種新型環狀單鏈DNA病毒。

　　根據該中心公布信息：此次新發現病毒是該中心病原所對今年9月27日江蘇出入境檢驗檢疫局送檢的一例從新加坡回國的發熱病人咽拭子樣本進行病原體檢測後所得。

　　病原所實驗室人員通過對送檢樣本用高通量測序技術檢測發現其中含有一種新型環狀單鏈DNA病毒片段，後根據高通量測序reads序列設計特異引物，對病人咽拭子樣本進行PCR擴增，產物經過sanger測序、序列組裝，於10月26日獲得該病毒全長基因序列3018nt。

　　據介紹，該病毒基因組含2種主要開放讀碼框(ORFs)，分別編碼複製酶蛋白Rep和衣殼蛋白Cap；有2個基因間隔區，其中大的間隔區含有環狀病毒特徵性莖環結構。與該病毒最相似的為豬糞相關的環狀病毒5(porcinestool-associatedcircularvirus5(PoSCV5)，isolateCP3)，編碼蛋白胺基酸序列相似性約為43%和50%，進化分析揭示這2種編碼蛋白分別與環狀病毒科及未分類的環狀單鏈DNA病毒聚為一類，疑似為一種新型病毒。

　　目前，該中心初步將該病毒命名為HumanPoSCV5-likecircularvirus(isolateMRJ)，基因組序列已遞交GenBank資料庫(Accessionno.KY052047)。

　　根據實驗室分析，在對病人的尿、血和唾液樣本進一步檢測中發現，唾液中可以檢測出該病毒，而尿和血液中檢測不到。

　　此前發現的豬糞相關的環狀病毒可引起豬腹瀉，人未見感染報導。其他種屬的環狀單鏈DNA病毒有在多發性硬化症病人的腦積液和血清、心包炎病人的心包液及腦炎病人的腦積液檢測出的報導，但是與疾病的聯繫均不能確立。所以，目前該新型環狀單鏈DNA病毒與病例所患疾病的關聯還不明確。

　　目前，實驗室正對樣本進行病毒分離培養，以便開展下一步的研究工作。(完)

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