在 RNA 加工過程中,II 類內含子的自我剪接取決於它們的催化結構,並受到許多因素的影響,這些因素通過直接結合促進該結構的形成。
本研究報導了 c-to-u 在兩個 nad7內含子特定位置的編輯對剪接是必不可少的,這也意味著非功能基團 II 內含子的催化活性可以通過編輯修復。
我們鑑定了一個玉米突變體,Dek24,具有有缺陷的籽粒表型,Dek24編碼一個僅定位於線粒體的 PPR-DYW 蛋白。
對線粒體轉錄體編碼區的分析沒有發現突變體和野生型玉米在 RNA 編輯方面的差異,但表明突變體中 nad7內含子3和4的剪接嚴重減少。
此外,在第5結構域(D5-C22)的第22個核苷酸上,兩個內含子的編輯在第24結構域被刪除。
本研究用內含子3的內含子 D5與太平洋假單胞菌(p.li.lsu2)的內含子 D5交換,構建了嵌合內含子。
體外剪接實驗表明,含有 D5-U22的嵌合內含子可以自我剪接,而含有 D5-C22的嵌合內含子不能自我剪接。 這些結果表明,DEK24參與了兩個內含子 D5-C22的 c-to-u 編輯,這一位置的 u 鹼基對內含子剪接至關重要。
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https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111/tpj.14862
CORRESPONDING AUTHOR
Key Laboratory of Plant Development and Environmental Adaptation Biology, Ministry of Education, School of Life Sciences, Shandong University, Qingdao Campus, Qingdao, 266237 China