DNA抽提實驗是科研工作中經常用到的,比如基因模式小鼠的基因型鑑定需要抽提DNA,螢光素酶報告實驗等需要抽提質粒。目前市面上也不斷出現許多DNA抽提試劑盒,價格相對昂貴,抽提次數有時不適用於大規模樣品。或者偶爾進行一兩次實驗時,造成不必要的浪費。正如前段時間網上討論火熱的「2塊錢的Vc與200塊錢的Vc」,其補充成分或含量都是相近的。DNA抽提實驗也有許多簡單易行質量好的操作方法,今天為大家介紹兩種DNA抽提實驗的原理與方法。
一、鹼式裂解法:
常用於基因模式小鼠的基因型鑑定,優點是簡易快捷,經濟實惠。
1.實驗原理:
通過加入NaOH,使組織裂解,釋放DNA。
2.實驗方法:
1)小鼠出生7天左右時,剪區小鼠腳趾約 0.5 釐米,放入無菌的1.5ml EP管內,同時對小鼠進行編號;
2)加入200ul 50mmol NaOH,放入85℃水浴鍋中進行加熱50min,直至組織消化,肉眼可以絮狀物質;
3)加入20ul PH 8.0 Tris HCl終止反應,並進行充分的斡旋震蕩;
4)12000rpm離心5分鐘,取2ul上清液即可直接進行基因鑑定的PCR反應。
二:熱酚法提取樣品DNA
1.實驗原理:
苯酚、氯仿、異戊醇抽提DNA的原理是通過有機溶劑抽提,去除蛋白、多糖、酚類等雜質,再加入乙醇沉澱即可使核酸分離出來。該方法可以獲得純度較高的DNA。其中:
(1)使用苯酚抽提細胞 DNA 時,苯酚的作用是使蛋白質變性,同時抑制了 DNase 的降解作用。用苯酚處理勻漿液時,由於蛋白與 DNA 聯結鍵已斷,蛋白分子表面又含有很多極性基團與苯酚相似相溶。蛋白分子溶於酚相,而 DNA 溶於水相。
(2)氯仿的作用是加速有機相與液相分層。最後用氯仿抽提:酚易溶於氯仿中,去除核酸溶液中的酚。
(3)用酚-氯仿抽提細胞基因組 DNA 時,通常要在酚-氯仿中加少許異戊醇,因為異戊醇可以減少蛋白質變性操作過程中產生的氣泡。異戊醇可以降低表面張力,從而減少氣泡產生。另外,異戊醇有助於分相,使離心後的上層含 DNA 的水相、中間的變性蛋白相及下層有機溶劑相維持穩定。
(4)用乙醇沉澱DNA,加入單價陽離子,如NaAC,Na+可以和DNA分子上的負電荷,減少DNA分子間的同性電荷相斥力,易於聚集沉澱。
2.實驗方法:
(1)將組織加入50ul裂解液(裂解液內加入PK,10ng/ul,2ul),60度水浴消化過夜。
(2)12000rpm離心5分鐘,吸取上清液至新的EP管中。
(3)加入等量酚氯仿,上下輕輕顛倒混勻6-8次,12000rpm離心10分鐘。
(4)離心後可見液體分層,小心吸取上層液體到新的EP管中,加入2倍體積預冷的100%乙醇,再加入1/10體積3M NaAC,-20度靜置30分鐘。
(5)12000rpm離心10分鐘,棄掉上清液。
(6)加入70%乙醇,輕輕吹打,可見到DNA薄片,保證薄片在液體中,12000rpm離心10分鐘,棄上清液。
(7)將EP管放回離心機瞬時離心,儘量吸棄剩餘乙醇。
(8)開蓋靜置10分鐘,使多餘乙醇揮發。
(9)加入適量超純水,斡旋,測濃度。
附:裂解液配製方法
(1)100mMTris HCl: 維持細胞破裂後 PH穩定性。
(2)0.5M EDTA: 溶解細胞膜。
(3)20%SDS:去垢劑,溶解細胞膜。
(4)5M NaCL:維持一定離子濃度和滲透壓。
好了,今天就介紹到這裡,以上兩種DNA抽提方法你學會了嗎?