來源:來源網絡 2006-12-18 21:53
RNA抽提指南(TRIZOL法)
注意事項:
* 全程佩戴一次性手套。皮膚經常帶有細菌和黴菌,可能汙染RNA的抽提
並成為RNA酶的來源。培養良好的微生物實驗操作習慣預防微生物汙染。
* 使用滅菌的,一次性的塑料器皿和自動吸管抽提RNA,避免使用公共儀
器所導致的RNA酶交叉汙染。例如,使用RNA探針的實驗室可能用RNA酶
A 或T1來降低濾紙上的背景,因而某些非一次性的物品(如自動吸管)可
能富含RNA酶。
* 在TRIZOL 中,RNA 是隔離在RNA 酶汙染之外的。而對樣品的後續操
作會要求用無RNA 酶的非一次性的玻璃器皿或塑料器皿。玻璃器皿可以在
150°C 的烘箱中烘烤4 小時。塑料器皿可以在0.5 M NaOH 中浸泡10 分鐘,
用水徹底漂洗乾淨後高壓滅菌備用。
抽提步驟:
1.勻漿化作用
通過離心來沉澱細胞後,棄上清,用移液管加TRIZOL試劑反覆吹打來裂解細胞至均一通亮的液態後,將勻漿樣品在15—30°C 條件下孵育5 分鐘以使核蛋白體完全分解。
(每5—10×106的動物細胞,植物或酵母菌細胞或每1×107 細菌加1ml的TRIZOL。在加入TRIZOL前應避免洗滌細胞因為那樣會增加mRNA降解的可能性。)
2.分離階段
每1 mlTRIZOL 加0.2 ml 氯仿。蓋緊樣品管蓋,用手用力搖晃試管15 秒並將其在30°C 下孵育2—3 分鐘。在2—8°C 下以不超過12,000×g 的離心力高速冷凍離心15 分鐘。離心後混合物分成三層:下層紅色的苯酚-氯仿層,中間層,上層無色的水樣層。RNA 無一例外地存在於水樣層當中。水樣層的容量大約為所加TRIZOL 容量的60%
3.RNA的沉澱
將水樣層轉移到一乾淨的試管中,通過將水樣層和異丙醇混合來沉澱RNA。最初均化時的每1 mlTRIZOL 對應0.5 ml 異丙醇。將混合的樣品在 15—30°C 條件下孵育10 分鐘並在2—8°C 下以不超過12,000×g 的離心力高速冷凍離心10 分鐘。RNA沉澱在離心前通常不可見,形成一膠狀片狀沉澱附著於試管壁和管底。
(如果希望分離DNA 和蛋白,有機層同樣要予以保留。在除去水樣層後,樣品中的DNA 和蛋白也能相繼以沉澱的方式還原。乙醇沉澱能析出中間層的DNA,在有機層中加入異丙醇能沉澱出蛋白。共純化DNA 對於樣品間標準化RNA 的產量十分有用。)
4.RNA的洗脫
移去上層懸液。用75%的乙醇洗滌RNA 沉澱一次,每1 ml 的TRIZOL 至
少加1 ml 的75%乙醇。旋渦振蕩混合樣品並在2—8°C 下以不超過7,500×g
的離心力高速冷凍離心5 分鐘。
5.RNA的再溶解
在操作的最後,簡單幹燥RNA沉澱。尤為重要的是,不能讓RNA沉澱完全乾燥那
樣會極大地降低它的可溶性。部分溶解的RNA樣品其A260/280 比值< 1.6。用移液管尖分幾次移取無RNA酶的水或0.5% SDS溶液來溶解RNA,並在55—60°C下孵育10 分鐘。
TRIzol法抽提總RNA
組織100mg
↓
加1mlTRIzol
↓
勻漿(要徹底,後轉至EP管)
(組織勻漿量>100mg時分裝1ml/每EP管)
↓
顛倒混勻10下,室溫5分鐘(30°C孵育)
↓
加氯仿1/5體積(0.2ml)(必須按總體積的1/5)
↓
顛倒混勻15S,室溫2-5分鐘(30°C孵育)
↓
4℃,離心12000g,15分鐘
↓
轉上層水相(約400μl)於另一1.5mlEP管中
↓
加等體積異丙醇(約400 -500μl),混勻室溫10分鐘
↓
4℃,離心12000g,10分鐘(30°C孵育)
↓
棄上清
↓
加冰預冷的75%乙醇(用DEPC水配)1ml
↓
4℃離心7500g,5分鐘
↓
棄上清,空氣乾燥5-10分鐘(不能完全乾燥)
↓
溶於DEPC水中至20μl(10μl-20μl)
(可在55-60℃水中,<10分鐘助溶)
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