國家基因庫成GISAID中國首個授權機構,助病毒數據共享

2020-12-06 澎湃新聞

澎湃新聞記者從國內基因測序龍頭華大集團處獲悉,3月16日,深圳國家基因庫(下稱「國家基因庫」)與全球共享流感數據倡議組織(GISAID)達成戰略性合作,國家基因庫生命大數據平臺(CNGBdb)成為GISAID的中國首個正式授權平臺。

華大方面稱,本次戰略合作將幫助中國科研工作者獲得一站式病毒數據資源訪問服務和更加豐富的分析工具,也標誌著我國科研機構在合規合法、保護數據生產者和提交者權利的前提下,促進全球範圍新型冠狀病毒及流感數據共享方面邁出重要一步。

華大方面表示,為共同助力全球呼吸道傳染病相關病毒研究,國家基因庫與GISAID達成戰略性合作,雙方將圍繞呼吸道傳染病相關病毒的基因數據管理、共享、分析等方面展開全面合作,促進病毒數據的全球共享。

GISAID是目前全球最大的流感及新型冠狀病毒數據平臺,總部位於德國慕尼黑,於2008年5月第61屆世界衛生大會期間啟動,是由全世界一組權威的醫學科學家組建,該組織致力於改善流感數據的共享。

GISAID的數據來源於全球14000名研究人員和1500個機構,其獨特的數據共享機制可以促進相關研究取得快速進展,例如推動對COVID-19的認知和相關醫療對策的研發。GISAID針對新型冠狀病毒開發的EpiCoV資料庫,目前已收錄656條新型冠狀病毒序列數據(截至3月13日),已超越傳統的數據平臺。

同時,傳統數據平臺(比如公有領域的資料庫)因允許匿名訪問而導致數據所有者權益不受保護、數據使用不透明的問題,這些在GISAID的數據共享機制中並不存在。

國家基因庫是中國首個國家級綜合性基因庫,也是國家重大科技基礎設施之一。2011年由國家發展改革委員會、財政部、工業和信息化部、衛生健康委員會(原衛生部)四部委批覆建設,並在以國家發展改革委員會和深圳市政府為聯合理事長單位的理事會指導下,由深圳華大生命科學研究院(原深圳華大基因研究院)組建及運營。

作為國內最大的生物大數據中心之一,國家基因庫生命大數據平臺匯集了國家基因庫及全球其他重要數據源的公開數據,在本次新型冠狀病毒疫情中,該平臺已經匯總了國家基因庫歸檔及NCBI的病毒序列數據資源159條(截至3月13日),助力研究人員快速發現、檢索和分析病毒。

華大方面稱,CNGBdb作為GISAID正式授權平臺,秉承GISAID數據共享理念,維護數據生產者和數據提交者的權利,為國內科技成果發布搭建便捷通道,並與GISAID共同推進全球病毒基因組序列和相關信息資源可信共享機制的建設。

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