成都生物所發現一種單核苷酸多態性新型檢測方法

2020-12-06 中國科學院

單核苷酸多態性（SNP）是指在基因組水平上，由於單個核苷酸的轉換、顛換、插入或缺失等引起DNA序列的多態性，它與許多疾病直接相關。因此，快速、準確、廉價的SNP檢測技術的開發，對藥物研究、個體化醫療、臨床試驗和分子診斷等至關重要，而目前大多數的SNP檢測方法均需要複雜的探針標記，並依靠高成本的檢測設備。中國科學院成都生物研究所唐卓研究員課題組，以有機化學、核酸化學及化學生物學為研究方向，一直致力於基於核酶開發核酸檢測生物傳感器的研究，最近報導了一種新型的基於DNAzyme和Gap-LCR的SNP檢測技術。

唐卓課題組向Gap-LCR探針中引入了一條短的功能DNA序列（DNAzyme），進而避免了對探針的化學修飾；然後利用兩種核酸外切酶依次降解體系中沒有發生連接反應的磷酸化探針和釋放Gap-LCR擴增產物中的DNAzyme序列；最後利用DNAzyme與卟啉鐵（hemin）或者卟啉鐵類似物的結合物具有類似於過氧化物酶活性的性質，催化H202氧化底物（ABTS，鹽酸酪胺等）成有色或者能產生螢光信號的物質，直接在室溫下通過顏色或者螢光信號變化來進行檢測。最終，研究人員獲得了一種具有高靈敏度和專一性的SNP檢測技術，檢測限達到1000分子，同時能夠從100000個幹擾分子中檢測到一個目標分子。

此研究驗證了方法的靈敏度、專一性以及通用性。研究人員成功地將檢測技術應用到血液DNA樣本中新生兒耳聾基因最常見的突變位點GJB2 235delC位點的檢測。

相關研究結果發表在期刊Biosensors and Bioelectronics. 

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