原創 生物世界 Bio生物世界 收錄於話題#HIV&愛滋病14個
撰文 | nagashi
編輯 | 王聰
排版 | 水成文
今天(12月1日)是世界愛滋病日,自1981年在美國首次發現愛滋病以來,全世界已有超過3600萬人感染愛滋病,超過1200萬人死於愛滋病,但人類從未停止與愛滋病的戰鬥。
愛滋病(AIDS)是一種由人類免疫缺陷病毒(HIV)引起的、危害性極大的傳染病。HIV作為一種RNA病毒,其基因組具有極高的突變率,且隨著HIV在人類世界的廣泛傳播,其衍生出來的亞型也越來越多,這也使得愛滋病的預防疫苗和治療藥物的開發變得十分困難。
鑑於全球HIV的多樣性是複雜和不斷變化的,因此,監測HIV的全球分子流行病學對於愛滋病毒疫苗的設計、測試和接種十分重要。
2019年2月,世界衛生組織和聯合國愛滋病規劃署等組成的國際團隊在國際頂尖醫學期刊《柳葉刀》子刊 The Lancet Infectious Disease 雜誌上發表題為:Global and regional molecular epidemiology of HIV-1, 1990-2015: a systematic review, global survey, and trend analysis 的綜述論文。
這篇綜述性研究對1990-2015年全球HIV-1的分子流行病學進行了系統性調查分析,共生成了2203個數據集,383519個樣本,覆蓋全球116個國家,結果表明HIV-1的流行亞型在不同的國家、區域和全球的分布會隨著時間的推移而不斷改變。
全球HIV/AIDS大流行仍然是一個重大的全球公共衛生問題,據WHO統計,截至2017年,就已有3690萬人感染愛滋病。更可怕的是,儘管抗逆轉錄病毒治療方案得到推廣,但在2017年,仍有94萬人死於愛滋病。
HIV/AIDS大流行之所以如此難以遏制,原因在於其非凡的全球遺傳多樣性。自從20世紀初愛滋病毒由非人類靈長類動物傳播給人類後,其在人類中衍生分化出許多不同的亞型,分別用字母A、B、C、D、F、G、H、J和K表示。不僅如此,亞型之間也形成了重組,即循環重組型(CRFs)或獨特重組型(URFs)。
HIV-1的全球遺傳多樣性是開發HIV疫苗的主要障礙。愛滋病毒疫苗的設計、測試和接種需要了解世界各地HIV-1亞型和重組型分布的最新和準確情況,因此,相關的調查分析研究就顯得十分重要。
在此項研究中,研究人員搜索了PubMed、EMBASE (Ovid)、CINAHL (Ebscohost)以及Global Health (Ovid)等資料庫,共獲得了覆蓋全球116個國家、包含2203個數據集的383519個HIV-1亞型樣本數據。時間跨度為1900年1月1日至2015年12月31日,並劃分為1990-1999年、2000-2004年、2005-2009年和2010-2015年四個時間段。
本研究的流程圖
整體而言,2010-2015年,在全球所有HIV-1感染患者中,C亞型佔46.6%,而B亞型佔12.1%,隨之是A亞型——佔10.3%,這三者佔據HIV-1亞型感染的前三名,總體接近愛滋病感染患者的70%。
緊接著是,CRF02_AG——7.7%,CRF01_AE——5.3%,G亞型——4.6%,以及D亞型——2.7%。此外,F、H、J和K亞型則合併佔據感染的0.9%。其他CRFs佔3.7%,這也使得所有CRFs的比例達到16.7%。而URFs則佔全球HIV-1感染總數的6.1%。
這意味著,HIV-1的重組亞型已佔所有HIV-1感染的22.8%。
2010-2015年,HIV-1不同亞型、CRFs和URFs的全球比例
不僅如此,研究人員還發現,HIV-1的不同亞型和重組型在國家、區域和全球的分布會隨著時間的變化而不斷改變。
總體而言,2005-2015年,在全球範圍內,B亞型感染佔據的比例在不斷增加,A和D亞型的感染比例較為穩定,而C、G亞型和CRF02_AG重組型則在不斷減少。但與此同時,CRF01_AE以及其他CRFs和URFs的增加,整體上導致全球HIV-1重組型的感染比例在隨時間持續增加。
1990-2015年,HIV-1不同亞型和重組型的統計數據
更重要的是,從研究的數據圖上看,2010-2015年,東亞地區HIV-1的感染類型主要為CRF01_AE、B亞型以及其他CRFs和URFs,重組型感染比例甚至可超過80%。
2010-2015年HIV-1亞型、CRFs和URFs的區域分布
總而言之,這項全球性調查是迄今關於HIV-1亞型和重組型的全球和區域分布和變化趨勢的最大一項研究,時間跨度為1990-2015年,覆蓋116個國家,涉及383519個樣本!
這項研究表明,在全球範圍內,HIV-1的ABC亞型感染比例仍佔據主要優勢,但與此同時,CRF02_AG等重組型的比例也在不斷上升,且在東亞和東南亞等地區,這一趨勢更為明顯。
HIV-1遺傳多樣性影響愛滋病預防和治療的方方面面,包括愛滋病疫苗開發/測試/接種、愛滋病毒診斷檢測、病毒載量檢測以及獻血者篩查管理等等。由此看來,實時監測全球HIV-1的不同亞型和重組型的變化趨勢,對遏制和終結全球HIV/AIDS大流行是至關重要的。相信未來也會有更多的相關研究去揭示這一點!
論文連結:
https://doi.org/10.1016/S1473-3099(18)30647-9
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