有關蝙蝠的起源及其與老鼠的關係，我之前發文講過了，有讀者再次邀請我回答這個問題，我就再簡述一下。這篇沒有新內容，看過原文的不用再看了。原來的食肉目系統發育圖有個錯別字，這次重新製圖改過來了，需要的讀者可以拿走。
成群的狐蝠倒掛在樹上休息01蝙蝠的起源
蝙蝠的起源目前還不是十分清楚，主要是因為目前尚沒有發現蝙蝠直接祖先的化石，進化中最難解決的就是「缺失環節」問題。目前在恐龍滅絕前後的地層裡發現的真獸類化石都是一些旁系遠支，無法確定和現代真獸有直接關係。
蝙蝠以及所有真獸類的已知最近遠祖，是距今1.6億年前的中華侏羅獸，2009年出土於我國遼寧建昌髫髻山組侏羅紀地層中。由於人類也是有胎盤類（真獸），侏羅獸也是我們的先祖（至少是旁系近親），科學家親切地稱呼它為「來自侏羅紀的母親」。
中華侏羅獸復原圖侏羅獸的特徵概括來說有三。一是體型小，體長7-10釐米，僅重13克。二是樹棲，強烈彎曲的前爪顯示很擅長爬樹。三是以昆蟲為食。侏羅獸長相確實有些像老鼠，但總的來說其實更像鼩鼱。鼩鼱所屬的食蟲類（真盲缺類）是最接近真獸共同祖先的類型。
在恐龍時代，哺乳動物受到恐龍的生態鉗制，特別是真獸類一直沒有大的發展，以低豐度、低多樣性潛伏著，存在感很低。到恐龍滅絕，有一群原始真獸仍基本保留著祖先的面貌，還是體型很小，還是住在樹上，還是吃蟲子，還是夜間活動。這一夥原始真獸開枝散葉，就演化成蝙蝠、老鼠以及我們人類等今天種類繁多的有胎盤類。由於沒有發現化石，我們不知道這群真獸的樣子，猜測長相依然類似鼩鼱。
鼩鼱在距今5000多萬年前，已知最早的幾類蝙蝠開始在北方的天空中翱翔，它們是伊神蝠、爪蝠和古蝠。它們的前趾骨伸長，上面有皮膜覆蓋，證明它們已經會飛了。但同時表現出樹棲祖先的一些祖徵，如翅膀比較小，後腿和尾巴發達，適於攀援。它們有的已經會回聲定位功能了，如伊神蝠；有的還不會，如爪蝠。
這樣，蝙蝠起源的大致進程就勾勒出來了。在晚古新世，氣候極為溫暖，飛蟲非常繁盛，一群樹棲的、長得像鼩鼱的小獸為了取食日益繁盛的飛蟲，開始在樹與樹之間跳躍，漸漸演化出飛行能力，這就是最早的蝙蝠。而回聲定位能力，是在蝙蝠飛起來之後，為適應在夜間飛行發現獵物和躲避障礙物而演化出來的。蝙蝠從「非飛」到「飛」過渡狀態的化石目前尚未發現，這是個重大缺憾。
食指伊神蝠，生活在距今5250萬年前約5000萬年前，蝙蝠分化為兩支：陰翼手類和陽翼手類。陰翼手類後又分化為兩支：菊頭蝠超科和狐蝠科（果蝠）。陽翼手類就是普通的小型食蟲蝙蝠，以及吸血蝙蝠。最終演化成今天1200多種蝙蝠。
02蝙蝠和老鼠是什麼關係？
蝙蝠和老鼠都是真獸類，它們是平行演化的兩個分支，而不是祖先和後代的關係。它們長得像是遺傳自共同祖先的祖徵，鼩鼱也和它們長得挺像。那麼，大象、牛、老虎和人類這些有胎盤類為什麼就不長這樣子？實際上，生物演化是各自生活的環境對不同變異類型的定向選擇，有些動物在長相的演化上比較保守，如蝙蝠和老鼠，而其他真獸類的演化更為激進。
通俗地講，蝙蝠和老鼠的關係更像是兄弟，而不是父子。你的兄弟可能長得也和你很像，但你們不是父子關係。有遺傳兄弟中有的和父母長得比較像，有的差別較大。
哺乳綱冠群系統發育圖簡述一下真獸類關係。真獸類適應輻射的時間點是在恐龍滅絕以後，因為只有恐龍滅絕了，真獸才能大發展。真獸首先分為南北兩支，蝙蝠和老鼠都屬於北方獸群。
北方獸群分為兩支：統獸總目和勞亞獸總目。統獸總目包括嚙齒類（老鼠）和靈長類（統獸即作為統治者的有胎盤類，人類屬於靈長目）。勞亞獸總目包括真盲缺類（即食蟲目，鼩鼱）、鯨和有蹄類、猛獸和蝙蝠。