最近一個世紀，是現代醫學飛速發展的一個世紀，在解剖學，分子生物學，遺傳學等分支領域的研究都有了長足的進步。並且，隨著社會的有序化，居住環境漸優，日常飲食漸潔，由細菌、病毒、寄生蟲、意外傷害等客觀因素引發的外源性疾病已大大減少。天花，肺結核，B型肝炎等曾經的「絕症」，現在都有了成熟的療法。
然而，人們是否因此變得更健康了？ 答案是 ： 並沒有。
外源性疾病減少，取而代之的是癌症、糖尿病、高血壓、通風、冠心病等內源性疾病的爆發式增長，發病人數逐年走高，發病患者逐漸低齡化。而對現代醫學而言，這些疾病幾乎沒有哪個是可以徹底治癒的。很多醫務工作者慨嘆：「醫療技術越來越發達，能治好的病卻越來越少。」
究其原因，並非醫療技術發展不夠快，而是醫學發展的理念所致。傳統臨床醫學的理念，當一個組織或器官的功能出現異常，不能發揮原有作用時，並不是想辦法讓它恢復功能，重回崗位，而是為它找一個替代者，將原有的工作讓這個替代者來幹，並不斷為這個替代者升級換代，讓它幹得更快更多，所以就有了層出不窮的各種新型藥品，而器官移植和人造器官技術，幾乎將這個理念發展到了極致。
在一段時間內，藥品確實可以替代人體某些器官的功能，但同時會引起原有器官的進一步衰退。同時，藥品的各種副作用，會給人體其他組織器官（尤其是肝腎）帶來很大的壓力。當壓力不斷累積，使多個組織器官功能失衡時，生命將不可逆轉地走向終結。
美國著名量子化學家，兩屆諾貝爾獎得主，萊納斯·鮑林博士提出： 給予身體正確的分子（適量的氧、水及各種營養），大部分疾病就會得到根除。鮑林博士認為：一切疾病的發生，都是由細胞功能障礙引起的，而治療疾病，也應從改善細胞營養，修復細胞功能入手。並以此為理論基礎，創立了「分子矯正醫學」，這正是現代功能醫學的前身。
佛門有偈語：「菩薩畏因，眾生畏果」。這句話指的是，普羅大眾，做事常常不計後果，當不好的結果降臨時，再施展各種手段，來試圖彌補和迴避這個結果。而菩薩（泛指有智慧的人）在意的是，是什麼原因導致這個結果，如何通過改變源頭上的「因」，來獲得更好更圓滿的「果」。
這句話反映到人們對健康的態度上，人們害怕疾病，害怕疾病帶來的痛苦，於是開發出各種壓制症狀，緩解病痛的藥物，各種療程短見效快的手術，來消除眼前的痛苦。但很少探究導致疾病的原因，分析這些原因中哪些不可抗拒，哪些可以改善，如何改善。
而功能醫學正是一門研究病因的科學，功能醫學的研究方向，是如何維持人體各系統功能的平衡，對已經失衡的系統，如何通過營養幹預，飲食限制等方法讓它回到正軌。從與臨床醫學不同的另一個角度，達到消除病患的目的。
每一個人，無論出身貴賤，財富多寡，地位高低，都有享受生命和健康的權利。正是人們對生命的仰望，對健康的追求，促成了功能醫學的誕生。在現代醫學大廈中，它將為不懈求知的人們開啟一座新的殿堂。