Nature:新冠病毒抑制劑高通量篩選工具(FRET)

2021-01-16 達科為生物城

新型冠狀病毒的複製離不開主蛋白酶的參與，病毒在入侵細胞後，利用細胞內的物質合成兩條超長複製酶多肽（pp1a和pp1ab），這兩條多肽是病毒自身複製必需的。但是不能直接發揮作用，需要被精準的剪切成RNA依賴的RNA聚合酶、解旋酶等才能啟動複製。執行這項精準的剪切任務的就是主蛋白酶，他在病毒複製過程中起到至關重要的作用，因此主蛋白酶就成為一個抗新冠病毒的關鍵藥靶。

2020年4月9日，上海科技大學饒子和/楊海濤團隊與合作者組成的「抗新冠病毒攻關聯盟」在Nature上發表了名為「Structure of Mprofrom COVID-19 virus and discovery of its inhibitors」研究成果。通過基於結構的虛擬和高通量篩選相結合，測定了10,000多種作為主蛋白酶抑制劑的化合物（包括已批准的藥物、臨床試驗中的候選藥物和其他藥理活性化合物），並發現這些化合物中有六個具有抑制主蛋白酶的作用，最大抑制濃度值的一般介於0.67至21.4μM之間。文中的高通量方法是基於FRET原理，設計併合成了螢光標記的底物Mca–AVLQ↓SGFRK（Dnp）K，該底物來源於病毒蛋白酶的N端。目前新冠病毒肆虐，這項工作的偉大不言而喻。

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