流式細胞儀仍然是無與倫比的單細胞分析技術,分析數百萬甚至更多細胞上的多個螢光參數的能力,使得流式能夠幫助人類深入理解複雜的生物過程。然而,常規流式在發展過程中,漸漸表現出一些缺陷,主要表現為螢光染料的限制,即使方案經過精心設計,也無法避免光譜滲漏、自發螢光等問題,使用的螢光染料的數量越多,這些問題就越大。
為了克服這個問題,先是出現了質譜流式。質譜流式的基礎原理是飛行時間質譜(TOF-MS),TOF-MS是一種非常精確和穩健的方法,用於測量離子的質荷比。在TOF分析中,所有離子通過已知強度的電場加速,並且測量這些離子在已知距離上到達檢測器所花費的時間。離子越重,到達探測器所需的時間越長。
在質譜流式中,選擇的標記是高度純化的穩定同位素。
為了進行質譜流式檢測,需要將同位素引入TOF並且避免細胞汙染儀器,這就需要將細胞氣化,僅留下同位素,為此,在進行TOF之前,需先將引入電感耦合等離子體(ICP)使細胞氣化,將剩餘的金屬離子引入TOF檢測。
所以,通過穩定同位素抗體的標記,經過ICP的細胞氣化,最後通過TOF-MS檢測離子,三者合一,就是質譜流式。原理繪製成一張圖就是下面這樣:
質譜流式的優點:
可以使用傳統的標記技術,在方法學上改變很小
在質譜細胞計數中沒有「自發螢光」,因為細胞內部不含鑭系元素離子
無「補償」 或補償非常微小
方案設計更容易
但任何事物都有局限性,質譜流式的缺點:
與傳統的流式細胞儀相比,採集速度更慢,每秒一般最多約1000個事件
樣品製備必須比傳統流式更乾淨,因此在獲取時所有生物材料都會氣化,如果不乾淨可能導致碳積聚並降低靈敏度
商業標記抗體數量有限(不過目前越來越多廠家加入,使得這些目錄逐漸在完善)
複雜的數據結構,需要新的數據分析工具和方法
由於細胞被氣化,所以沒法進行FSC和SSC測量
光譜流式光譜流式是從另一條路解決螢光補償問題,就是光譜解析,解析原理見下圖,需要事先學習螢光素的光譜特徵,不同螢光素都有其獨特的光譜特徵,有點像人臉識別似的,只不過比人臉識別簡單多了。通過這種解析,就智能得消除了常規流式累死人的螢光滲漏影響:
但實際上在硬體上,光譜流式同時還大大降低了光路的複雜程度,使得儀器成本能夠大大降低。常規流式要做到12色,可能需要12~14個獨立檢測器和40多個濾光片,而光譜流式,不僅避免了這種複雜架構,而且實現同等參數檢測的儀器成本只有常規流式的五分之一。
光譜流式最開始是Purdue大學2004年ISAC會議上提出的,2007年10月9日獲得專利US7280204(http://www.cyto.purdue.edu/sites/default/files/manuscripts/US7280204-issued-patent.pdf),專利後來授權給了索尼,Purdue大學該頁面(http://www.cyto.purdue.edu/Spectral%20Flow%20Cytometry)還有幾個蠻有意思的聲明,在此不方便直接翻譯,不知道是否有知情人能解答一下?
對於光譜流式,同樣也有優點和缺點。優點是:
與常規流式在方法學一致,可直接拿來就用,過渡性好
能通過特異性光譜特徵,方便地去除「自發螢光」信號
即使以前發射波長相近的螢光素,例如GFP和FITC,由于波形不一樣,在光譜流式上也能解析開
方案設計更容易
缺點:目前在公開資料中未找到對光譜流式的缺點介紹,但事物都有兩面性,我個人雖然未用過光譜流式,但從光譜流式公司公開資料上的光譜流式與常規流式數據對比上看,可以看出在信號強度上,部分螢光素的強度整體是要弱於常規流式的,這可能對於某些微弱信號會有點麻煩,當然,這純屬個人猜測,請用過光譜流式的FLOWER能夠出來確認一下。
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參考文獻:
Introducing CyTOF: Cytometry of the Masses. https://bitesizebio.com/20066/introducing-cytof-cytometry-of-the-masses/ John P. Nolan and Danilo Condello. Spectral Flow Cytometry. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3556726/ https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/cyto.a.23779 J. Paul Robinson. Spectral flow cytometry—Quo vadimus?http://www.cyto.purdue.edu/Spectral%20Flow%20Cytometry
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