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基因研究新突破:科學家揭開DNA甲基化之謎
甲基化是由一種叫做甲基轉移酶的酶來完成的,這種酶以特定的模式用甲基修飾DNA,在DNA上形成表觀遺傳層。 到目前為止,科學家們還沒有努力分辨出哪種酶負責哪種模式。但在最近發表在《自然通訊》(Nature Communications)雜誌上的一項新研究中,丹麥技術大學(Technical University of danish)諾和諾德基金會生物可持續性中心(Novo Nordisk Foundation Center for Biosustainability, DTU Biosustainability)的科學家們將酶與兩種細菌的特定甲基化模式結合起來
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美國科學家發現引發癌症的關鍵——DNA甲基化不平衡的特定位點
近日,美國的研究人員通過DNA修飾測序,發現了引發癌症和其他疾病的關鍵:DNA甲基化不平衡的特定位點。在全基因組掃描中,我們往往很難定位與癌症關係最密切的基因變異。近日,美國科學家研究發現,通過放大多個正常組織和癌症組織中與DNA甲基化失衡相關的關鍵基因位點,能夠在更廣泛的統計信號下發現引發癌症的新線索。
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研究發現植物DNA主動去甲基化新機制
該研究發現了植物DNA主動去甲基化的完整調控途徑,詳細闡述了植物DNA主動去甲基化的最新機制。同時,該研究揭示了擬南芥SWR1複合體通過識別常染色(組蛋白乙醯化)和異染色(DNA甲基化)標記物而被招募到染色質上的靶向機制。 DNA甲基化修飾發生於胞嘧啶的第五位碳原子上,是一種很重要的、保守的表觀遺傳學標記。DNA甲基化與DNA去甲基化決定了生物體內的甲基化水平和圖譜。
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Tet雙加氧酶介導的DNA氧化去甲基化
DNA去甲基化還會在特定時期發生在基因組特定的位點,參與調控局部的基因表達。 在哺乳動物中,DNA的甲基化主要由DNMT蛋白家族催化完成。其中DNMT3a/3b主要負責起始性DNA甲基化,而DNMT1則主要負責在DNA複製過程中甲基化狀態的維持。DNA的去甲基化可以分為主動去甲基化與被動去甲基化。
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揭示DNA去甲基化與DNA損傷修復之間的調控作用—新聞—科學網
中科院昆明動物所
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科學家發現免疫細胞完全喪失戰鬥力原因,與DNA甲基化有關
科學家發現免疫細胞完全喪失戰鬥力原因,與DNA甲基化有關 在與病毒或癌細胞的長期對抗中,機體免疫細胞會陷入疲勞,其中有些細胞完全喪失戰鬥力且難以恢復。
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DNA甲基化 |「雙面間諜」或將為癌症治療帶來新思路!
毫無疑問,胞嘧啶甲基化的缺陷與發育異常、遺傳疾病以及癌症有關。最新的一項研究中,La Jolla免疫研究所的研究人員揭示了DNA的甲基化和去甲基化之間的平衡是如何阻止基因組不穩定性,進而阻止癌症發展的。
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上海生科院合作揭示受精卵DNA去甲基化重要機制
DNA主動和被動去甲基化,並且DNA雙加氧酶Tet3介導了主動去甲基化的發生,而糖苷酶TDG並不參與該過程。受精後,精子和卵細胞都會經歷一系列DNA甲基化組的重編程,從而建立起早期胚胎的發育全能性。傳統觀念認為受精後父源基因組DNA會經歷大規模的主動去甲基化,而母源基因組DNA會伴隨著卵裂的進行發生被動去甲基化。
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研究發現DNA甲基化的不完全重置
Babraham研究所的科學家們揭示了生殖細胞(卵子和精子)發育時DNA重置的機制。
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生物物理所等發現SALL4A蛋白調節增強子上的DNA去甲基化
哺乳動物DNA的胞嘧啶甲基化修飾被認為是最穩定的表觀遺傳修飾,在維持性DNA甲基轉移酶的作用下,親代細胞基因組的DNA甲基化信息經過有絲分裂以半保留複製的方式傳遞給子代細胞。近年來的研究發現,TET家族蛋白能夠將5mC逐步氧化成5-羥甲基胞嘧啶(5hmC)、5-醛基胞嘧啶(5fC)和5-羧基胞嘧啶(5caC),並走向最終的去甲基化。
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H3K4去甲基化作用機制研究獲進展
,為解析H3K4去甲基化作用機制提供了結構基礎,將有助於進一步分析植物莖生長的去甲基化作用機理。其中組蛋白H3賴氨酸4三甲基化(H3K4me3)就是一種重要的組蛋白標記,能通過與起始因子TFIID之類的效應因子相互作用,召集激活基因,促進轉錄,在植物發育調控和應激適應的基因表達過程中扮演了重要的角色。
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植物DNA去甲基化的機理和功能
這篇文章概述了最新的植物中DNA去甲基化的調控機理,以及其在模式植物和作物中的生物學功能。DNA甲基化修飾主要指5-甲基胞嘧啶(5mC),它是一種可逆的表觀遺傳修飾。在植物中,基因組上的5mC 可以由ROS1 家族蛋白介導切掉,之後再由鹼基修復機制合成非甲基化胞嘧啶,從而造成基因組的DNA去甲基化。
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CCS Chemistry | DNA去甲基化新通路:5-羧基胞嘧啶直接脫羧基
但是,為了保證基因在適當的發育階段進行程序性表達,生物體內也會發生DNA去甲基化(demethylation)的現象來調節DNA甲基化程度。DNA甲基化和去甲基化的動態平衡控制著生物體內基因表達的強度。DNA去甲基化是指5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5m C)被胞嘧啶取代。
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PNAS:揭示DNA甲基化對番茄果實成熟的重要作用
該研究利用CRISPR/Cas 9技術獲得了番茄sldml2 的突變體植株,發現了番茄SlDML2 調節的DNA去甲基化不僅可以激活成熟需要的基因,同時還可以抑制成熟不需要的基因,在調節番茄果實成熟的過程中發揮了重要作用。DNA甲基化是一種保守的表觀遺傳學標記,在生物發育和環境應答的過程中具有重要的調控作用。
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Alpha助力DNA甲基化表型調控新發現
DNA甲基化(DNA methylation)是指在DNA甲基化轉移酶的作用下,在基因組CpG二核苷酸的胞嘧啶5'碳位共價鍵結合一個甲基基團。作者發現了一個有趣的現象:塔頓布朗拉赫曼症候群(Tatton–
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DNA甲基化
在DNA共價修飾中,最主要的就是DNA甲基化。在DNA鹼基上增加甲基基團的化學修飾稱為DNA甲基化(DNA methylation)。DNA甲基化在除酵母以外的所有真核生物中普遍存在,多發生於胞嘧啶的第5位碳原子上,形成5′-甲基胞嘧啶(5mC)。在哺乳動物中,5mC大多發生於CpG二核苷酸中,而CpG常常在基因5′-端的調控區成簇串聯排列,構成CpG島,大小為300〜3 000 bp。
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PNAS:華人科學家參與組蛋白去甲基化研究
H3K36多肽底物的複合結晶結構,加深了對組蛋白去甲基化的機制及特異性的了解。 組蛋白甲基化是表觀遺傳修飾方式中的一種,參與了異染色質的形成、基因印記、染色體失活和基因轉錄調控等,其中jumonji C (JmjC)位點是介導組蛋白賴氨酸去甲基化的一個催化位點。
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...衣藻中去甲基化酶CMD1催化以維生素C為底物的5mC去甲基化修飾機制
DNA甲基化能夠在不改變DNA序列的前提下改變遺傳表現,是表觀遺傳學的核心研究領域之一。目前的研究表明,DNA甲基化與基因組印記、X染色體失活、轉座因子抑制、衰老和癌症發生等密切相關,因此是表觀遺傳學研究的重點和熱點之一。CpG二核苷酸中的胞嘧啶上第5位碳原子在甲基化轉移酶(DNMTs)的催化下,發生甲基化的形成5mC。目前發現5mC廣泛分布於原核與真核生物中。
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【新發現】DNA甲基化會加速人體衰老,降低人體抵抗力
他們發現,在超過35萬個位點的老化雙胞胎的表觀基因組中,血液DNA甲基化的個體差異在晚年部分可遺傳,而在69歲到79歲的十年間則是縱向遺傳的。這些發現可以幫助科學家更好地理解基因和環境對老化過程中甲基化的穩定性和動力學的影響,並為未來在不同人群中的研究奠定基礎。
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朱健康等揭示DNA甲基化對番茄果實成熟作用—新聞—科學網
中科院上海植物逆境生物學中心