Nature Vol.526 No.7574, 22 October 2015
Non-coding recurrent mutations in chronic lymphocytic leukaemia
慢性淋巴細胞白血病中的非編碼頻發突變
Xose S. Puente, Silvia Beà, Rafael Valdés-Mas, Neus Villamor, Jesús Gutiérrez-Abril+ et al.
http://www.nature.com/nature/journal/v526/n7574/full/nature14666.html
研究對500餘名患者進行基因組學研究以拓展驅動慢性淋巴細胞白血病發生的所知突變數量,並且鑑定出了新型的非編碼區頻發突變,其中包括PAX5的增強子區域和NOTCH1的3』非翻譯區,這些突變導致剪接異常,提高了NOTCH1蛋白的穩定性和活性,進而造成不良的臨床結果。
Mutations driving CLL and their evolution in progression and relapse
慢性淋巴細胞白血病發展和復發過程中的突變驅動及其演化
Dan A. Landau, Eugen Tausch, Amaro N. Taylor-Weiner, Chip Stewart, Johannes G. Reiter+ et al.
http://www.nature.com/nature/journal/v526/n7574/full/nature15395.html
該研究報導了來自538個慢性淋巴細胞白血病(CLL)患者樣本的外顯子組測序結果,其中278個患者的數據採集也作為一項前瞻性臨床試驗的一部分。測序鑑定了頻發突變的基因,揭示了CLL的相關通路,以及在疾病發展和復發過程中這些突變的演化過程。
Single cell activity reveals direct electron transfer in methanotrophic consortia
單細胞的活性顯示甲烷氧化菌群間的直接電子轉移
Shawn E. McGlynn, Grayson L. Chadwick, Christopher P. Kempes & Victoria J. Orphan
http://www.nature.com/nature/journal/v526/n7574/full/nature15512.html
海洋沉積物中的甲烷厭氧氧化是由甲烷氧化古細菌群和硫酸鹽還原菌群協同完成的。該研究通過檢測種群間空間定位對單細胞活性的影響,表明種間電子轉移並不需要空間位置上的靠近,ANME-2基因組中的大型多血紅素細胞色素和還原活性電鏡染色也支持這一假說。
Structural basis for gene regulation by a B12-dependent photoreceptor
維生素B12依賴感光受體的基因調控與結構基礎
Marco Jost, Jésus Fernández-Zapata, María Carmen Polanco, Juan Manuel Ortiz-Guerrero, Percival Yang-Ting Chen+ et al.
http://www.nature.com/nature/journal/v526/n7574/full/nature14950.html
嗜熱棲熱菌(Thermusthermophilus)CarH是一種依賴於維生素B12衍生物的感光受體,該研究成功解析了CarH在黑暗中處於自由態,或與操縱子DNA結合,以及光照後這三種相關狀態下的晶體結構。
Flows of X-ray gas reveal the disruption of a star by a massive black hole
X射線氣體的流動揭示了恆星被一個巨型黑洞破壞的過程
http://www.nature.com/nature/journal/v526/n7574/full/nature15708.html
高解析度的X光射線光譜顯示了在PGC 043234星系中一個黑洞附近的名為ASASSN-14li的潮汐破壞事件周圍存在高度離子化X射線氣體流動。
A disintegrating minor planet transiting a white dwarf
解體中的小行星經過白矮星
Jon M. Miller, Jelle S. Kaastra, M. Coleman Miller, Mark T. Reynolds, Gregory Brown+ et al.
http://www.nature.com/nature/journal/v526/n7574/full/nature15527.html
白矮星的大氣層通常包含比氦更重的元素,一般來說人們認為這些元素會落到恆星的內部,然而對白矮星WD1145+017的觀察顯示其附近的軌道上存在解體的巖石物體,也許這些物體在為白矮星的大氣層提供重元素。
The rise of fully turbulent flow
完全湍流的起因
Dwight Barkley, Baofang Song, Vasudevan Mukund, Grégoire Lemoult, Marc Avila+ et al.
http://www.nature.com/nature/journal/v526/n7574/full/nature15701.html
實驗、漸進理論和含邊界壁剪切流動的電腦模擬揭示了管道中的流體存在兩種不同的流動方式,這一發現揭示了局部湍流是如何轉化成完全湍流的。
Observation of non-Hermitian degeneracies in a chaotic exciton-polariton billiard
對無序的激子-極化激元中的非厄米特退化的觀察
T. Gao, E. Estrecho, K. Y. Bliokh, T. C. H. Liew, M. D. Fraser+ et al.
http://www.nature.com/nature/journal/v526/n7574/full/nature15522.html
在非厄米特系統中,光譜退化會導致非同尋常而且反直覺的效果。半導體微腔中的激子-極化激元-光與物質的混合體顆粒顯示出一種此類系統中獨有的非平凡拓撲模型結構。
The vulnerability of Indo-Pacific mangrove forests to sea-level rise
印度-太平洋紅樹林對海平面上升的脆弱性
Catherine E. Lovelock, Donald R. Cahoon, Daniel A. Friess, Glenn R. Guntenspergen, Ken W. Krauss+ et al.
http://www.nature.com/nature/journal/v526/n7574/full/nature15538.html
一份對於印度-太平洋沿海地區的地表高度變化的評估顯示,幾乎70%的區域缺乏足夠的沉積物來抵消預期的海平面上漲。模型顯示這樣的區域最早在2070年就會被海水淹沒。
Kidney organoids from human iPS cells contain multiple lineages and model human nephrogenesis
人類誘導多能幹細胞(iPS)形成的腎臟類器官含有多種細胞譜系,可用作人類腎形成的模型
Minoru Takasato, Pei X. Er, Han S. Chiu, Barbara Maier, Gregory J. Baillie+ et al.
http://www.nature.com/nature/journal/v526/n7574/full/nature15695.html
腎臟是由兩種前體細胞分化形成的,該研究探明了使人類誘導多能幹細胞(iPS cell)分化形成集合管和功能性腎單位所需要的信號通路環境,並且形成了具有腎臟功能分區的類器官。
A comprehensive phylogeny of birds (Aves) using targeted next-generation DNA sequencing
利用二代DNA靶向測序得到全面的鳥類發展史(鳥綱)
Richard O. Prum, Jacob S. Berv, Alex Dornburg, Daniel J. Field, Jeffrey P. Townsend+ et al.
http://www.nature.com/nature/journal/v526/n7574/full/nature15697.html
鳥類的發展史通過對代表了所有主要的鳥類譜系的198種現存鳥類進行靶向基因組測序得以呈現;結果發現存在五大主要分支,可形成連續的姐妹群至新鳥綱的其餘譜系,但這並不支持最近提出新鳥綱主要由Columbea和Passerea的兩個分支組成的理論。
Biodiversity increases the resistance of ecosystem productivity to climate extremes
生物多樣性可提高生態系統生產力對極端氣候的抵抗能力
Forest Isbell, Dylan Craven, John Connolly, Michel Loreau, Bernhard Schmid+ et al.
http://www.nature.com/nature/journal/v526/n7574/full/nature15374.html
歐洲及北美地區的草地生物多樣性實驗數據顯示,儘管在極端氣候中生態系統會喪失恢復力,但生物多樣性可提高生態系統對極端氣候的抵抗能力。
Hedgehog actively maintains adult lung quiescence and regulates repair and regeneration
Hedgehog積極維持成人肺部靜息並調節其修復和再生
Tien Peng, David B. Frank, Rachel S. Kadzik, Michael P. Morley, Komal S. Rathi+ et al.
http://www.nature.com/nature/journal/v526/n7574/full/nature14984.html
通常認為組織靜息狀態是不需要刻意維持的,只是代表了增殖信號缺失時的一種狀態。而該研究中作者發現在成年小鼠的肺部,細胞的靜息狀態需要由上皮細胞旁分泌的hedgehog信號主動維持。在損傷修復和重建過程中,機體對Hedgehog信號進行動態調控以促使傷後更好地恢復組織穩態。
RAF inhibitors that evade paradoxical MAPK pathway activation
RAF抑制劑可逃避相悖的MAPK通路活化
Chao Zhang, Wayne Spevak, Ying Zhang, Elizabeth A. Burton, Yan Ma+ et al.
http://www.nature.com/nature/journal/v526/n7574/full/nature14982.html
在RAS突變的細胞中,RAF二代抑制劑可以抑制原癌基因BRAF,並且不會誘導相悖信號通路的激活,該發現可能實現更安全持久的藥效作用。
Intercellular wiring enables electron transfer between methanotrophicarchaea and bacteria
細胞間聯繫促成甲烷古菌和細菌之間的電子轉移
Gunter Wegener, Viola Krukenberg, Dietmar Riedel, Halina E. Tegetmeyer & Antje Boetius
http://www.nature.com/nature/journal/v526/n7574/full/nature15733.html
海洋厭氧甲烷古菌和硫酸鹽還原菌通過類似菌毛的納米線連接,這表明直接的種間電子交換可以作為甲烷厭氧氧化的一種基本機制。
Dynamic m6A mRNA methylation directs translational control of heat shock response
m6A信使RNA的動態甲基化過程指示熱休克反應中的翻譯控制
Jun Zhou, Ji Wan, Xiangwei Gao, Xingqian Zhang, Samie R. Jaffrey+ et al.
http://www.nature.com/nature/journal/v526/n7574/full/nature15377.html
在熱休克等應激反應中,在誘導的信使RNA(mRNA)的5』非翻譯區會主要積累N6-甲基腺嘌呤(m6A)修飾,該過程由m6A相互作用蛋白YTHD2移位進入細胞核內介導,致使5』帽非依賴的mRNA翻譯。這為脅迫應答基因可被優先表達提供了一種可能的機制。
(來自Nature.com。翻譯:史靜雯、張雪、馬宏、胡家僖;審校:史靜雯、魏若妍、楊柳。)
轉載請先聯繫
newmedia@huanqiukexue.com,
給雜誌社打電話也行。
這裡是「科學美國人」中文版《環球科學》服務科研人的微信號「科研圈」。想知道我們都幹些啥,可點擊閱讀原文查看歷史消息。