RNA控制核糖體基因的沉默

2021-01-09 科學網

 

美國華盛頓大學聖路易斯學院克雷格·皮卡爾德教授領導的研究小組12月4日表示,他們在核仁顯性(nucleolar dominance)現象的研究方面取得了突破性的進展,發現雜交植物或動物中整組親代核糖核酸RNA基因遭受沉默(被關閉)。由於核仁顯性的機理同癌症這類疾病失控的機制在某些方面相同,因此皮卡爾德的研究在醫學應用方面具有十分重要的意義。相關研究論文刊登在最新一期的《分子細胞》雜誌上。

 

核仁顯性是一種表觀遺傳現象,指基因表達發生改變但不涉及DNA序列的變化,可以由DNA甲基化之外的組蛋白編碼的改變引起。在這種現象中一套親代遺傳給雜合體子代的核糖體基因遭受沉默。當核仁在從單親那裡遺傳來的染色體上形成時,細胞核內就會發生核仁顯性現象。核糖核酸RNA基因的表達驅動了這些核仁的形成。兩種不同種類的植物或動物雜合後,總是選擇表達雜合中一特殊親代種類的核糖體RNA基因,而無論該特殊親代種類是母系還是父系。

 

核糖核酸RNA是核糖體的一個主要成分,而核糖體是細胞的蛋白生產基地。細胞在核糖核酸RNA基因充裕時,能利用核仁顯性來控制生物體中核糖體的量。皮卡爾德表示,如果人們能利用核仁顯性的沉默機理來限制核糖核酸RNA基因的表達,那麼就有望能減緩腫瘤細胞的生長率,從而減緩癌症這類疾病的發展。

 

在癌細胞中,核仁明顯較大,這是由於核糖核酸RNA轉錄時核仁急劇增多所造成的,而這反過來又導致細胞內核糖體大量地增加。核糖體活動的升級意味著細胞能以非正常的高速率合成蛋白,從而發生細胞增殖失控,這是疾病的典型表徵。

 

對癌症患者而言,完全讓所有的核糖體基因出現沉默並非可行的治理方法,因為人要生存,就離不開核糖體。不過,皮卡爾德和合作者的研究表明,小幹擾RNA能夠指揮核糖體基因發生沉默的時間和範圍,這比讓所有核糖體基因沉默或者不讓任何核糖體基因沉默的方法要複雜得多。(來源:科技日報 毛黎)

 

(《分子細胞》(

Molecular Cell

),doi:10.1016/j.molcel.2008.11.009,Sasha B. Preuss,Craig S. Pikaard)

 

更多閱讀(英文)

 

《分子細胞》發表論文摘要

 

相關焦點

  • 核糖體RNA及其大小
    核糖體
  • 揭示基因沉默跨代傳遞機制
    在這篇論文中,他們描述了他們的研究結果以及他們的研究工作可能影響人們研究基因沉默的方式。圖片來自Nature, 2020, doi:10.1038/d41586-020-01417-2。人們還發現,小RNA可以從一代傳到下一代,這揭示了一種非基於DNA的可遺傳基因沉默形式。但是在此之前,這種機制如何實現還不為人所知。在這項新的研究中,這些研究人員發現,它是通過一種稱為pUG化(pUGylation,添加pUG尾巴)的過程實現的。之前的研究工作已表明,小RNA通過附著在Argonaute/Piwi蛋白上,然後控制mRNA切割,從而啟動mRNA沉默。
  • 核糖體RNA基因拷貝數變異和表達調控方面獲進展
    真核生物的核糖體,主要由4種核糖體 RNA(rRNA)和80多種核糖體蛋白組成。其中,45S rRNA基因位點通過轉錄加工可以產生18S、5.8S和25S rRNA;而5SrRNA基因位點行使5S rRNA的轉錄。隨後,25S、5.8S以及5S RNA結合核糖體蛋白形成核糖體大亞基,同時18S RNA與其他核糖體蛋白形成核糖體小亞基,最終組裝成細胞中的「蛋白加工工廠」。
  • RNA參與基因調控嗎?
    它是DNA和製造蛋白質核糖體的機器之間的信使。mRNA轉錄在DNA所在的細胞核中進行,然後轉移到核糖體所在的細胞質中。讀取mRNA和製造蛋白質的過程稱為轉錄,這是蛋白質合成的第二步。在細胞質中兩個主要RNA是細胞核糖體RNA(rRNA)和tRNA的下。rRNA,顧名思義,是核糖體的一部分。
  • 非編碼RNA研究園地 | 一種大環肽與腫瘤發生的自然通訊
    m6A的生物學重要性m6A依賴m6A一個控制mRNA命運和功能的讀者。然而,仍未探討m6A的額外監管亞基是否存在。一位讀者參與了m6A。m6A對RNA的認識。在這裡我們發現長的非編碼RNA(IncRNA)LINC 00266-1編碼71個胺基酸肽.
  • 植物內源基因RNA沉默機制研究獲進展
    在植物中,誘發高效的RNA沉默還包括siRNA和甲基化在靶序列上的漂移、沉默信號在細胞間和整株植物的擴散並產生由信號誘導的RNA沉默(非自主性沉默)。植物中對報告基因(如GFP)以及植物非編碼基因沉默的分子機制和參與沉默的組分已十分清楚。但是,對植物如何調控和避免內源蛋白編碼基因的RNA沉默卻所知甚少。
  • 核仁RNA聚合酶II促進核糖體生物發生
    核仁RNA聚合酶II促進核糖體生物發生 作者:小柯機器人 發布時間:2020/7/16 16:48:37 加拿大多倫多大學Karim Mekhail及其研究組發現核仁RNA聚合酶II促進核糖體形成。
  • Nature |介導Xist定位與基因沉默的高階蛋白質複合物
    localization and gene silencing,發現Xist通過招募多種RNA結合蛋白組成的異質性凝聚物(Condensates)促進可遺傳的基因沉默也就是說儘管Xist結合的蛋白比如PTBP1、MATR3、TDP-43或者是CELF1在XCI過程中具有一定的功能,但是當X染色體失活相關的基因沉默狀態形成後(去除這些RNA結合蛋白)並不影響X染色體失活的狀態。
  • 揭示核仁RNA聚合酶II促進核糖體合成
    2020年7月22日訊/生物谷BIOON/---在一項新的研究中,來自加拿大多倫多大學的研究人員發現一種名為RNA聚合酶(Pol)II的酶促進核糖體構成單元(building block)的產生,其中核糖體是根據遺傳密碼製造細胞內所有蛋白的分子機器。
  • 沉默HIV病毒儲存庫新進展!
    治療HIV-1感染的策略之一是沉默和殺滅策略,它可以逆轉HIV-1的潛伏期,暴露HIV-1感染的細胞進行免疫清除。 為了防止全身毒性,一種理想的潛伏逆轉劑應該逆轉HIV-1潛伏,而不引起整體T細胞活化。廣泛的小分子化合物庫篩選已經確定了潛伏期逆轉劑,它們可以在體內重新激活HIV-1。
  • 核仁與某種RNA的合成以及核糖體的形成有啥關係?
    根據「與核糖體的形成相關」不難推出,「某種RNA」應該是rRNA,也就是核糖體RNA。在FC和DFC的交界處,有若干紅色線條,這表示的就是rDNA,即轉錄rRNA的基因。神麼?核仁中也有DNA?不是說好核DNA都在染色體上的嗎?橋得麻袋,關於這部分DNA,核仁只有使用權而已。
  • 通過CRISPR / Cas9去沉默沉默的基因
    控制細胞中基因表達的能力使科學家能夠理解基因功能並操縱細胞命運。最近,科學家開發了一種名為CRIPSR / Cas9的革命性基因編輯工具,該工具採用細菌自然使用的系統來防禦病毒。該工具允許科學家精確添加,刪除或替換DNA的特定部分。CRISPR / Cas9是迄今為止最有效,最便宜和最簡單的基因編輯工具。然而,科學家尚未設法有效地利用它來激活細胞中的基因。
  • miRNA如何沉默基因
    具體來說,研究人員針對超過19000種人類基因和1864種miRNA設計了慢病毒庫,最亮的0.5%被挑出來認為這些細胞的基因沉默過程是有缺陷的,這些基因背後就是miRNA-mRNA相互作用的磷酸化機制。
  • 真核生物核糖體蛋白基因的轉錄調控
    在前基因組時期,構建基因調控網絡是最重要的問題之一然而,一個物種中包含有成千上萬的基因,因此構建基因調控網絡難度不言而喻。基於對核糖體蛋白(RP)基因近50年的研究,所以我們就可以通過這些基因更好地來理解和構建調控網絡。 RP基因的早期研究是在大腸肝菌中開始的,RP基因在原核生物中形成操縱子,一些RP蛋白還能夠結合到翻譯成這些蛋白的mRNA上,引起翻譯的終止,在翻譯水平形成一種RP基因的調控反饋網絡。
  • 光壽紅課題組在《PNAS》上揭示反義核糖體小幹擾RNA新功能
    核糖體RNA作為一類重要的非編碼RNA,是細胞內含量最高的RNA組分,同時也是細胞內蛋白質翻譯機器的主要組成成分。近日,中國科學技術大學光壽紅教授課題組首次揭示了反義核糖體小幹擾RNA(risiRNA)參與核糖體RNA代謝調控和穩態維持:即細胞內錯誤加工的核糖體RNA片段除了被代謝降解之外,還可以激活細胞內的RNA幹擾通路,合成risiRNA,並通過細胞核RNA幹擾通路對核糖體RNA在轉錄水平進行調控。
  • 研究人員發現了調節神經發生的特定環狀RNA
    正確的時間和神經元分化的精細控制對神經系統功能的發展至關重要。這些事件在幹細胞生長/分裂的能力和神經元祖細胞最終退出細胞周期並成為成熟神經元之間建立了一個微調的平衡。多種基因在分化時上調或下調,產生神經元特異性蛋白和核糖核酸(RNAs),包括環狀rna (circRNAs)。這類環狀rna直到最近才逃脫了常規檢測,儘管這些分子在哺乳動物大腦中高度表達。
  • 植保所科學家揭示病毒抑制RNA沉默新機制
    他們利用遺傳學和分子生物學等技術手段,以系統翔實的實驗證據揭示了雙生病毒編碼的一個致病因子通過調控植物內源基因沉默抑制子抵禦寄主防衛反應的新機制。基因沉默(RNA沉默)是植物抵禦病毒侵染的重要防衛機制。目前已知植物病毒均編碼一個或多個RNA沉默抑制子,以抵抗寄主植物RNA沉默介導的防衛反應,但國際科學界對這些抑制子的作用機制了解甚少。
  • 基因治療又現曙光:FDA批准首個可沉默 RNA的基因藥物
    RNA 幹擾背後的想法是可以開發小分子來中和這些 RNA 信使,有效地沉默那些可能導致有害健康影響的某些基因的表達。這些破壞性分子被稱為小幹擾 RNA(siRNA)。近日,據外媒報導美國食品和藥物管理局(FDA)批准了第一種利用這種方法進行成人臨床治療的藥物。這種藥物用於遺傳性轉甲狀腺素蛋白澱粉樣變性 (hATTR) 患者。
  • 什麼是RNA?
    據麻薩諸塞州大學稱,一種稱為信使RNA(mRNA)的RNA利用這種複製功能將遺傳數據從DNA傳遞到核糖體(核糖體,細胞的蛋白質生產成分)。核糖體「讀取」 mRNA序列,以確定蛋白質亞基(胺基酸)應加入生長中的蛋白質分子的順序。
  • Molecular Cell:反義RNA新機制 核糖體競爭mRNA起始位點
    生物谷援引華文生技網報導:Uppsala大學研究人員最近發現了一種全新RNA抑制途徑,即反義RNA與核糖體競爭mRNA的起始位點,從而達到抑制或影響RNA轉錄的作用。文章發表於近日出版的Molecular Cell上。      以往人們一直認為反義RNA通過與mRNA結合,從而抑制核糖體閱讀目標基因,抑制了mRNA轉錄。