概述
RT- PCR(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction)即逆轉錄PCR,是將RNA的逆轉錄(RT)和cDNA的聚合酶鏈式擴增反應(PCR)相結合的技術。RT-PCR技術靈敏而且用途廣泛,可用於檢測細胞/組織中基因表達水平,細胞中RNA病毒的含量和直接克隆特定基因的cDNA序列等。
目的
檢測目的基因的轉錄產物mRNA的水平
原理
提取組織或細胞中的總RNA,以其中的mRNA作為模板,採用Oligo(dT)或隨機引物利用逆轉錄酶反轉錄成cDNA。再以cDNA為模板進行PCR擴增,從而獲得目的基因或檢測基因的表達。
步驟
1.總RNA的提取(以細胞為例)
1.1棄去培液,PBS洗2遍,加入1ml Trizol,輕輕吹打,直至細胞脫落,吸入1.5 ml EP管內,靜置5 min。(Trizol量根據細胞密度可適當調整,建議:6孔板細胞長滿~1ml Trizol)
1.2 加入200μl氯仿(三氯甲烷),用手劇烈震蕩15秒,室溫靜置2-3分鐘。(氯仿量為1/5 Trizol)
1.3 12000g,4℃,離心15min。
1.4 仔細轉移上層水相到1個新EP管中,不能貪多,約400-500μl。
1.5加等體積異丙醇,輕柔混合4~5次,室溫放置10分鐘。
1.6 12000g,4℃,離心10min。
1.7輕輕倒去上清,用20 μl槍輕輕吸去殘液,沉澱用1ml 75%乙醇(0.75ml無水乙醇+0.25ml DEPC水,現配)洗1~2次,渦旋混勻。
1.8吸去上清,5-10分鐘空氣乾燥RNA。(肉眼不能明顯看到水分即可)
1.9加15-20μl DEPC水,吹打數次,測濃度。
注釋:
1.mRNA不穩定,很容易講解,因此mRNA提取過程中要儘量避免RNA酶汙染。
2.RT:(參照商品化試劑盒說明書)
3.PCR:(參照商品化試劑盒說明書)
4.電泳鑑定:行瓊脂糖凝膠電泳,紫外燈下觀察結果。
5.密度掃描、結果分析:採用凝膠圖像分析系統,對電泳條帶進行密度掃描。