原理不同:螢光定量PCR實時監測與DNA結合的螢光染料激發的螢光;普通pcr通過檢測插入dna中螢光染色劑來看是否有目的片段。
應要求:螢光定量對擴增片段有較高的要求,一般為100-300bp;普通PCR可以擴增長點的片段。螢光定量可以不進行電泳就對產物進行定量分析,普通PCR必須電泳。
結果:螢光定量可以實現精確定量,普通PCR則不行。螢光定量體現可以看到整個擴增過程,可以看到擴增效率,溶解溫度,直接得到的標準曲線等,這些是普通PCR無法實現的
RT-PCR有兩種:實時螢光定量PCR (Real-Time PCR)和反轉錄PCR(Reverse Transcription PCR),都屬於Q-PCR (Quantitative PCR, 定量PCR),以RNA或cDNA為模板,以cDNA序列設計引物,測量RNA水平的表達。
螢光定量PCR,加螢光,必需在定量PCR上做,一般片段較短(80-120bp),有固定程序,可以根據對照精確計算不同樣品間的表達差異。
反轉錄PCR,不加螢光,一般的PCR儀即可,循環數在15-25之間,片段可選120-500bp,表達差異可以由跑電泳膠顯示。
Real-time PCR通常用的方法是SYBR Green,這種方法引物在RT-PCR的基礎上需要注意:
1.退火溫度同內參;
2.片段長度不要超過200;
real-time PCR的引物可以跑RT-PCR,反之不一定。
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