螢光閾值 threshold
以PCR反應的前15個循環的螢光信號作為螢光本底信號,一般螢光域值定義為3-15個循環的螢光信號的標準偏差的10倍。
Ct值
Ct值:也稱循環閾值。是指在PCR循環過程中,螢光信號開始由本底進入指數增長階段的拐點所對應的循環次數。在實際操作中,這個時刻也就是每個反應管內的螢光信號到達設定的域值的時刻,Ct值取決於閾值。
Ct值與起始模板的關係:
研究表明,在指數擴增期,每個模板的Ct值與該模板的起始拷貝數成反比。
螢光定量檢測常用的檢測模式有TaqMan 探針和SYBR Green I檢測模式。
(1)TaqMan 探針法作用原理
本方法的原理主要是利用 Taq 酶的5 ′→3 ′外切核酸酶活性,並在PCR反應體系中,加入一個螢光標記探針。
TaqMan 探針根據其 3′端標記的螢光猝滅基團的不同分為兩種: 常 TaqMan 探針和 TaqMan MGB 探針。
(2)SYBR Green I 螢光染料法作用原理
SYBR Green I 是一種只與雙鏈 DNA 特異結合的染料 ,當它與 DNA 雙鏈結合時 ,發出螢光 ;從 DNA 雙鏈上釋放出來時 ,螢光信號急劇減弱。因此 ,在一個體系內 ,其信號強度代表了雙鏈 DNA 分子的數量。
雙鏈DNA結合螢光染料的優點:實驗設計簡單,不需要設計探針,僅需要1對引物,檢驗反應特異性,可進行曲線分析。