全球根系性狀資料庫GRooT

2021-02-28 植物表型資訊

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在將根系性狀數據廣泛整合到大規模分析時，為了克服概念和方法上的障礙，我們創建了全球根系性狀（GRooT）資料庫，植物表型資訊介紹如下。

性狀數據是植物形態和功能定量描述的基礎。儘管根系性狀反映了植物對環境條件變化的反應和對生態系統過程的影響，但很少被納入大規模的比較研究和全球模型中。例如，幾乎所有定義植物形態和功能的全球光譜研究也缺少根系特徵。因此，在將根系性狀數據廣泛整合到大規模分析時，為了克服概念和方法上的障礙，我們創建了全球根系性狀（GRooT）資料庫。

 

描述全球根性狀（GRooT）資料庫中包含的所有來自田間研究的地理參考數據地圖

GRooT通過將根系生態學家的專業知識與數據動員和管理相結合，提供隨時可用的數據。具體來說，我們（a）根據專家的評估，確定了一組與植物形態和功能描述相關的核心根系性狀，（b）通過性狀內部和性狀之間的數據標準化，最大限度地擴大物種覆蓋範圍，以及（c）實施數據質量檢查。

 

根系性狀在全球根系性狀（GRooT）中的系統發育覆蓋率

包含的主要變量類型：GRooT包含有關38個連續根性狀的114222個性狀記錄；

空間位置：來自荒蕪、大陸、極地、溫帶和熱帶生物群落獲得的數據覆蓋全球。根系性狀數據來源於試驗和田間研究；

時間周期：包括1911年至2019年的數據記錄；

主要類群和測量水平：GRooT包括可獲得其分類學信息的根系性狀數據。性狀記錄的生物分類解析度各不相同，其中亞種或變種的生物分類學解析度最高，而屬則最低。它包含有關184個亞種或變種，6,214種，1,967屬和254科的信息。由於數據源差異，資料庫中的特徵記錄既包括單個觀察值，也包括平均值。

軟體格式：GRooT包括兩個csv文件。GitHub存儲庫包含csv文件和R中用於查詢資料庫的腳本。

來源：

Guerrero‐Ramírez N R., Mommer L, Freschet G T., et al. Global root traits (GRooT) database. Global Ecol Biogeogr. https://doi.org/10.1111/geb.13179.

 

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