近年來，新疆維吾爾自治區在灌區積極推行農民用水戶協會建設，截止2006年底，己成立農民用水戶協會1487個，其中在民政部門登記註冊816個。農民用水戶協會在增強農民民主管理意識、密切供用水雙方關係、加強田間灌溉管理、促進節約用水、提高水費收取率、減輕農民負擔、降低農業生產成本、促進農民增收等方面發揮了積極作用，深受廣大農牧民的歡迎和支持。
為進一步推進灌區管理體制改革，規範和加強農民用水戶協會建設，新疆維吾爾自治區水利廳、發改委、民政廳近期聯合下發了《關於加強和規範農民用水戶協會工作的通知》（新水建管［2006］161號）,以加強和規範用水戶協會的建設和管理，進一步推動農民用水戶協會健康發展，充分發揮農民用水戶在田間工程管理方面的積極作用。
一、規範農民用水戶協會組建工作。
成立農民用水戶協會，要按照協會組建程序運作，做到成熟一個，成立一個；條件不具備的灌區，末級水利工程仍由原渠道管理。
（一）做好宣傳發動工作。通過報紙、電視、廣播、宣傳單以及對村民進行培訓等各種手段，廣泛宣傳成立農民用水戶協會的意義、作用以及所帶來的好處，做到家喻戶曉。
（二）做好成立農民用水戶協會的各項籌備工作。一是必須堅持自願組織、自願參加、民主議事、民主決策、互利互惠的原則，避免行政管理機構強迫命令；二是按照水文邊界或行政區域確立協會的管轄範圍；三是成立農民用水戶協會籌備組，轄區農戶按照自願原則參加協會，成為協會會員；四是劃分用水小組，由每個用水小組推選一位會員代表；五是由籌備組擬定協會章程，由會員代表推薦協會執委會成員候選人，確立協會活動場所；六是召開會員代表大會，成立農民用水戶協會，選舉執委會成員，通過協會章程；七是在民政部門進行登記註冊；八是制定協會各種制度。
二、農民用水戶協會應嚴格按照章程及制度進行運作
（一）堅持會員代表大會制度。農民用水戶協會是實行"一事一議"政策的重要載體，會員代表大會則是落實的具體形式。協會每年至少要在年初和年末各召開一次會員代表大會。
在年初大會上通過由執委會制定的當年協會工作計劃。一是當年水利工程維修、改造和管理計劃；二是當年協會運行經費預算及財務管理情況；三是當年供用水計劃。
在年末大會上對全年協會工作進行總結。一是對工程維修、改造及管理情況進行總結；二是向大會報告財務收支決算情況、審計情況；三是對本年度用水計劃執行情況及節約用水情況進行核算、分析；四是對表現突出的會員或用水小組進行獎勵；五是分析總結協會其他工作；六是聽取會員代表對協會工作的意見，以便促進協會更好的開展工作。
（二）強化對末級水利工程的管理工作。將末級水利工程交由農民用水戶協會管理,必須由當地政府與農民用水戶協會籤訂資產移交協議，明確資產權屬及相應責任。對末級水利工程的管理既要體現農民的參與，又要體現對末級水利工程的強化管理，做到末級水利工程資產保值增值。對於協會轄區末級水利工程，以臨近會員承包土地為原則，並賦予相應的責、權、利。對管理工作做得好的給予獎勵，對工程沒有管好且造成損失的，要給予處罰。對於轄區較大的水利工程維護、改造項目，在做好規劃的前提下，按照年度工作計劃，由協會統一負責組織實施。
（三）做好供用水管理工作。農民用水戶協會承擔支渠以下的供用水管理及供水到戶工作，做好供用水管理及供水到戶工作的關鍵是量化和透明。一是要不斷增加和完善灌區量測水系統；二是要充分利用現有量水設施，準確計量水量。
（四）切實加強協會財務管理工作。農民用水戶協會是實行獨立核算的法人單位，條件成熟的協會要建立自己的財務、配備財務人員，必須單另設置帳戶，財務管理不能與村委會財務混為一體，協會應建立財務管理制度，形成文件並嚴格執行；尚不具備獨立建立財務條件的協會，末級水費由上一級水管單位代管，代管單位不得挪用、截留，不得增加額外開支。各種收支應手續齊全，協會財務必須執行相關政策、規定和制度。定期編制財務報告和進行審計，向會員代表大會報告。
價格和水行政主管部門及審計部門要加強對農民用水戶協會財務管理工作的檢查和監督。
三、各級政府應加大對農民用水戶協會的扶持和監督力度，儘快改善末級水利工程現狀
各級政府和水行政主管部門不能借成立農民用水戶協會之機，把破爛不勘的末級水利工程當作包袱甩給協會。協會成立初期，需要加強監管和扶持，尤其要加大扶持力度，要幫助協會積極融資，制定和完善水利投融資機制。採取以獎代補和項目帶動的辦法，加快末級水利工程的節水改造步伐；農民用水戶協會可以充分發揮政府與農民群眾、灌區與用水戶之間的橋梁和紐帶作用，通過"一事一議"制度，民主議事、籌集資金，組織農民群眾對轄區的末級水利工程進行維修和改造。
四、加快推進末級水價改革
末級水費是農民用水戶協會的主要經費來源，加快末級水價改革，首先要做好末級水價成本核算，理順從水源到農戶的供水價格關係和執行渠道。實行從水源到農戶的最終水價結算制度，可以有效杜絕搭車收費及亂收費現象的發生。農民用水戶協會統一向農戶收取水費，然後按水價構成，向水管單位交納骨幹工程的水費。末級水費必須嚴格按照規定進行管理和使用，末級水費只能用於末級水利工程的維護和日常管理方面的開支。
做好末級水價核算，首先要對末級水利工程資產進行清產核資，摸清灌區末級水利工程的資產現狀。可以通過在典型灌區或局部工程的試點基礎上，逐步擴展到全灌區的末級水價。在上報價格主管部門審批時，必須載明末級水價部分，便於以後執行。
五、以水為媒，拓寬水利經濟平臺，促進協會良性發展
農民用水戶協會在管好末級水利工程的同時，可以水為媒開展多種經營，走"以水養水"的道路，大力開展水利旅遊業、養殖業、種植業等多種經營，不斷增強協會經濟實力，促進協會良性發展。
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