動物所等建立衰老生物學多組學資料庫

2020-11-24 光明網

隨著人口老齡化程度加劇，實現健康老齡化是目前亟待解決的社會問題和科學問題。近年來，隨著衰老相關研究成果的不斷增多以及高通量測序技術的日益發展，衰老相關多組學數據層出疊見。然而，目前尚缺乏綜合性的整合衰老生物學多組學數據的數據資源庫。

中國科學院動物研究所劉光慧研究組、曲靜研究組，與北京基因組研究所（國家生物信息中心）鮑一明研究組、張維綺研究組合作建立了Aging Atlas資料庫（https://bigd.big.ac.cn/aging/index）。該資料庫從常規轉錄組、單細胞轉錄組、表觀基因組、蛋白質組及藥物基因組等不同層面整合了衰老相關數據集（圖1），實現了不同條件下基因表達調控隨衰老變化趨勢的匯聚融合。在該資料庫中，用戶可實現對不同層次組學數據的交互查詢和聯合分析等功能，同時，資料庫還將不斷完善建立多層次組學間的整合分析和數據呈現，並形成升級版本。此外，資料庫提供了歸屬不同通路的衰老相關基因集，使得用戶可以更深入全面地了解特定基因和通路在衰老生物學中的意義。作為面向全球持續更新的網站，Aging Atlas提供開放的數據共享平臺，用戶可在上傳界面進行科學數據的上傳操作，為實現全球數據共享提供便利。Aging Atlas的建立旨在為國際範圍內衰老相關大數據的統一匯交、集中存儲、安全管理、開放共享以及前沿交叉研究和轉化應用提供助力。近日，相關研究成果以Aging Atlas: a multi-omics database for aging biology為題，在線發表在Nucleic Acids Research上。

Aging Atlas資料庫實現了對與衰老相關的不同層次的多組學數據的收錄和整合。該資料庫對用戶免費開放，相關運維團隊將對該資料庫進行定期維護，實時更新，助力於推動衰老相關的基礎研究和臨床轉化應用的不斷發展。Aging Atlas希望在廣大科學工作者的支持下，不斷吸納更多高質量的衰老研究數據，以更好地服務於衰老生物學和老年醫學的發展。

該資料庫由中科院動物研究所、幹細胞與再生醫學創新研究院、幹細胞與再生醫學科學數據中心、北京基因組研究所，以及首都醫科大學宣武醫院國家老年疾病臨床研究中心等機構合作完成。動物所研究員劉光慧、北京基因組所研究員鮑一明、動物所研究員曲靜和北京基因組所研究員張維綺為論文的共同通訊作者。資料庫建設得到動物所研究員宋默識、周兵與副研究員馮桂海，北京基因組所研究員楊運桂、慈維敏、任捷、韓大力，生物物理所研究員陳暢，北京大學教授湯富酬、趙揚，浙江大學教授郭國驥，以及同濟大學教授尹曉磊的指導和支持。研究工作獲得科技部、國家自然科學基金委員會、中科院和北京市等的資助。

Aging Atlas資料庫

來源： 動物研究所

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