科學家合作建立衰老研究多組學資料庫

2020-11-01 BioArt

伴隨著全球人口老齡化程度加劇，實現健康老齡化是目前亟待解決的重大社會問題和科學問題。近年來，隨著衰老相關研究成果的不斷增多以及高通量測序技術的日益發展，衰老相關多組學數據層出疊見。然而，目前尚缺乏一個綜合性的整合衰老生物學多組學數據的數據資源庫。


2020年10月29日，中國科學院動物研究所劉光慧研究組、曲靜研究組和北京基因組研究所（國家生物信息中心）鮑一明研究組、張維綺研究組合作在Nucleic Acids Research雜誌上發表文章Aging Atlas: a multi-omics database for aging biology，建立了Aging Atlas資料庫（https://bigd.big.ac.cn/aging/index）。



該資料庫從常規轉錄組、單細胞轉錄組、表觀基因組、蛋白質組及藥物基因組等不同層面整合了衰老相關數據集（下圖），實現了不同條件下基因表達調控隨衰老變化趨勢的匯聚融合。在該資料庫中，用戶可實現對不同層次組學數據的交互查詢和聯合分析等功能，同時資料庫還將不斷完善建立多層次組學間的整合分析和數據呈現，並形成升級版本。此外，資料庫提供了歸屬不同通路的衰老相關基因集，使得用戶可以更加深入全面地了解特定基因和通路在衰老生物學中的意義。值得一提的是，作為一個面向全球持續更新的網站，Aging Atlas提供開放的數據共享平臺，用戶可以在上傳界面進行科學數據的上傳操作，為實現全球數據共享提供便利。Aging Atlas的建立旨在為國際範圍內衰老相關大數據的統一匯交、集中存儲、安全管理、開放共享以及前沿交叉研究和轉化應用提供助力。



Aging Atlas資料庫首次實現了對與衰老相關的不同層次的多組學數據的收錄和整合。該資料庫對用戶免費開放，相關運維團隊也將對該資料庫進行定期維護，實時更新，助力於推動衰老相關的基礎研究和臨床轉化應用的不斷發展。Aging Atlas希望在廣大科學工作者的支持下，不斷吸納更多高質量的衰老研究數據，以更好地服務於衰老生物學和老年醫學的發展。


據悉，該資料庫由中科院動物所、中科院幹細胞與再生醫學創新研究院、中科院幹細胞與再生醫學科學數據中心、中科院北京基因組所（國家生物信息中心）、首都醫科大學宣武醫院國家老年疾病臨床研究中心等機構合作完成。中科院動物所劉光慧研究員、中科院北京基因組研究所（國家生物信息中心）鮑一明研究員、中科院動物所曲靜研究員和中科院北京基因組研究所（國家生物信息中心）張維綺研究員為共同通訊作者。資料庫的建設得到了中科院動物所宋默識研究員、周兵研究員、馮桂海副研究員，中科院北京基因組研究所（國家生物信息中心）楊運桂研究員、慈維敏研究員、任捷研究員、韓大力研究員，中科院生物物理所陳暢研究員，北京大學湯富酬教授、趙揚教授，浙江大學郭國驥教授，以及同濟大學尹曉磊教授的指導和支持。


原文連結：

https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkaa894/5943197

資料庫連結：

https://bigd.big.ac.cn/aging/index

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