論道醫藥專利|醫藥化工領域利用化學結構檢索專利的技巧

2021-01-10 知產力

作者 | 吳雪健 王玉姣 陳彬 江蘇瑞途律師事務所

(本文系知產力獨家首發的稿件,轉載須徵得作者本人同意,並在顯要位置註明文章來源。)

(本文3250字,閱讀約需7分鐘)

摘要:在進行專利信息的檢索和調研的過程中,化學結構式的數位化檢索是醫藥化工領域專利信息檢索重要手段。由於具有化學結構檢索的商業資料庫價格較高,使得許多企業不能及時有效地進行化學結構的專利檢索。本文篩選出幾種具有化學結構檢索功能的免費資料庫,為採用化學結構檢索醫藥化工專利提供幫助和參考。

關鍵詞:化學結構;專利檢索;資料庫;免費

01 化學結構信息檢索的重要性

專利信息的檢索和利用在醫藥化工領域技術調研、新產品開發和實施專利保護中有著重要的作用;醫藥化學領域行業,對專利信息的檢索和利用已關乎到企業發展的戰略層面。在進行專利信息的檢索和調研的過程中,一般領域專利檢索常採用關鍵詞和分類號進行檢索,而醫藥化工領域的專利檢索除了採用關鍵詞和分類號進行檢索,還可以採用化學結構信息進行專利的檢索。化學結構式的電子化檢索逐漸成為醫藥化工領域專利信息檢索的重要手段。

隨著化學專利數量不斷增加且化學物質的命名不唯一,而且很多新合成或者新發現的化學物質必須以化學結構的方式進行描述,再加之專利撰寫過程中語言表達的多樣性和複雜性,因此在檢索的過程中很難用關鍵詞進行充分描述。而化學結構信息作為化學物質結構組成的特有表現形式,化學結構與化學物質具有唯一的對應性,採用化學結構式進行檢索可以大大提高檢索的準確性和檢索效率。因此,化學結構信息在醫藥化工領域專利檢索中表現出尤為特殊的重要性。

02 化學結構式檢索的困境

化學結構式是一種特殊圖形信息,採用化學物質的結構進行信息檢索,是以化學結構圖形進行匹配檢索。需要檢索系統對化學結構信息作深加工處理,才能實現以化學結構式進行專利檢索,一般的檢索系統往往難以實現化學結構的檢索。當然,現有的資料庫也已經能對結構式進行檢索,例如Scifinder、ISI chemserver等,但是這些數據對專利的檢索功能較差。對於專利數據來說,現有的部分商業專利資料庫已經實現了化學結構的檢索(例如DWPI等)。

由於具有化學結構檢索的專利資料庫往往需要較高的開發費用,具有化學結構檢索的商業資料庫價格較高,大大增加了國內企業的檢索和研發成本,使得很多資金薄弱的初創企業對價格高昂的檢索資料庫望而卻步。而一般免費專利資料庫,由於沒有對複雜化學結構信息進行處理的手段,往往無法採用化學結構信息進行專利檢索。使得檢索人員渴望進行化學結構檢索時,往往沒有合適、免費的檢索工具。如何利用免費資料庫,實現醫藥化工專利的化學結構檢索成為了檢索人員的困境。

筆者通過對大量免費資料庫的篩選,選擇出幾種具有化學結構檢索的免費資料庫,並對資料庫功能進行介紹和說明,希望為檢索人員採用化學結構檢索醫藥化工專利提供一定的參考和幫助。

03 檢索化學結構的免費專利資料庫

3.1 PATENTSCOPE資料庫

世界智慧財產權組織的PATENTSCOPE資料庫可以對《專利合作條約》和部分國家和地區專利局的專利文獻進行檢索,檢索欄位包括關鍵字檢索、號碼檢索、名稱檢索和分類檢索等。2016年10月PATENTSCOPE推出了化學結構檢索功能,為用戶提供了在PATENTSCOPE中對專利文件中的化學結構信息進行檢索的途徑。PATENTSCOPE結構式檢索目前可用於英文和德文(自1978年起)公布的PCT申請和美國(自1979年起)的資料庫。

(1)PATENTSCOPE化學結構檢索

登錄PATENTSCOPE後點選「Chemical compounds」模塊進行化學結構的檢索,具體見下圖。

採用PATENTSCOPE進行化學結構式檢索時,具有2種方式:

(1)可以通過上傳結構式進行檢索,接受的格式包括結構式文件(文件類型MOL)或者圖片格式(文件類型png、gif、tiff和jpeg等);具體如下圖所示:

(2)採用結構編輯器繪製或編輯結構,以非常直觀的方式繪製化學結構、反應和片段;具體如下圖所示:

除此之外,近期PATENTSCOPE資料庫對化學結構檢索進行了進一步的優化,檢索人員可以進行化學亞結構檢索,並在大約1000萬個結構中查找含有某個特定片段的結構。此前的化學品檢索功能只能通過名稱或完整結構圖進行檢索,而新工具使研究人員得以查看更大範圍的結果,使得檢索人員更容易查到哪些分子含有其尋求的片段。

例如,在檢索模塊中輸入阿託品化合物某種亞結構,以阿託品化合物某種亞結構進行檢索,檢索結果如上圖所示。含有亞結構的相關內容都會在檢索結果中輸出,同時還以特殊的顏色進行標註,大大提高了檢索人員的閱讀效率。

3.2 國家知識產權局專利檢索系統

國家知識產權局專利檢索系統於2011年4月26日上線,收錄了103個國家、地區和組織的專利數據,其中包括文摘數據、全文數據、引文及法律狀態數據等,文獻數量達1億3000萬條;具有常規檢索、表格檢索、概要瀏覽、詳細瀏覽、批量下載等功能。隨著國家知識產權局對專利檢索系統的不斷優化,並且增加了化學結構檢索模塊。

在登錄國家知識產權局專利檢索系統時,檢索人員可以通過國家知識產權局進入檢索系統;進入檢索系統後,可以點擊「藥物檢索」進入藥物檢索界面,具體界面如下圖所示:

而後在藥物檢索界面中選擇「結構式檢索」,並在其中輸入化學結構式即可進行化學結構信息的檢索,而且在輸入結構式的過程中檢索系統提供了結構式的核查功能,檢索人員可以對結構式進行校核。繪製結構式後再生成檢索式即可進行專利檢索。

採用該檢索系統進行化學結構檢索的過程中,檢索人員可以根據需要進行精確結構、子結構和相似性檢索(相似性係數範圍為0.4~0.99),從而可以根據檢索需要選擇不同的檢索模式。

3.3 北京市智慧財產權公共信息服務平臺

北京市智慧財產權公共信息服務平臺涵蓋103個國家和地區的文獻數據近1億條,該平臺除了包括智能檢索、關鍵字檢索、號碼檢索、分類檢索、同義詞檢索和企業關聯檢索;而且也開發了化學結構式檢索,可以通過檢索界面中的「化學結構式檢索」進入。

北京市智慧財產權公共信息服務平臺在進行相似結構檢索時,可以選定檢索的相似度;輸入的化學結構可以與其他34個欄位進行組配檢索,例如可以在下圖的空白區域中繪製化學結構式,從而進行化學結構式檢索;化學結構檢索可以進行化學結構的準確結構檢索、子結構檢索,還可以進行相似結構的檢索。

北京市智慧財產權公共信息服務平臺利用化學結構檢索可以在一定程度上解決現有檢索系統在檢索化學、藥物專利時難以檢全、檢準的問題。不足之處在於:該平臺的化學結構式檢索還處於試用階段,化學結構數據僅1萬條左右。

3.4 PubChem資料庫

PubChem是世界上免費獲取的化學信息的最大集合,是一種化學模組的資料庫,其是美國國家健康研究院( US National Institutes of Health,NIH)的開放資料庫,並由美國國家生物技術信息中心負責維護。PubChem自2004年開放以來,已成為科研工作者、學生和公眾的重要化學信息資源。檢索的過程中,PubChem可以按名稱、分子式、結構和其他標識符進行化學物質的檢索和搜索。值得說明的是,PubChem可以查找化學和物理性質、生物活性、安全性和毒性信息;而且PubChem資料庫還與專利、論文資料庫相關聯,進而實現利用化學結構檢索相關專利。進入PubChem資料庫後的界面如下圖所示:

進入PubChem資料庫後,點擊繪製結構後即可進入化學結構編輯界面,如下圖所示;並可以在繪製框中繪製出所需的化學結構圖。檢索的過程中可以對相似結構、子結構進行檢索。

最重要的是PubChem資料庫與專利資料庫相關聯,可以通過化學結構的信息檢索到相應的或者相關的專利,並且可以直接連結到相應的專利資料庫。從而提高檢索人員的檢索效率。如下圖所示。

此外,值得稱讚的是PubChem資料庫還對檢索得到的相關專利的IPC分類進行了加工、標引和排序,使得檢索人員對檢索得到的相關專利的IPC進行快速、有效地梳理。

04 結束語

由於醫藥化工領域專利檢索的特殊性,在進行醫藥化工領域的專利檢索時,務必重視化學結構信息的利用。本文為基於化學結構信息進行專利檢索提供了部分解決途徑,上述資料庫化學結構檢索的準確性和全面性可能與商業資料庫還有一定的差距,但是在一定程度解決了利用化學結構進行專利檢索的困境,擴展了檢索人員的檢索途徑,為企業及時、準確掌握國內外相關專利的保護情況和新產品的發展動態提供了支持。

參考文獻(略)

相關焦點

  • 江蘇:中國專利檢索技能大賽 智慧碰撞亮點頻出
    「因為我在檢索的過程中注意到,有些冰箱涉及到『化霜』這一關鍵詞,我想『化霜』和『除霜』是一個含義,所以之前存在漏檢,因此進行了補充檢索。」在第二屆中國專利檢索技能大賽決賽答辯環節嚴肅、緊張的氛圍下,臺上選手與臺下專家不斷碰撞出思維的火花。
  • 百餘專利檢索高手 將來寧論劍
    本報訊(記者 毛慶) 由江蘇省專利信息服務中心等單位主辦的全國首場專利爭霸賽——首屆中國專利檢索技能大賽本月20日將在寧拉開帷幕,在選拔賽中脫穎而出的120名專利檢索高手進行一場歷時8小時的「華山論劍」。  全國目前有1萬多專職專利審查員,加上企業裡負責專利審查的人員,共有10萬多人,而江蘇就有2萬人左右。
  • 免費又好用的PATENTSCOPE 專利檢索系統,你會用麼?
    Patentscop檢索系統PATENTSCOPE 檢索系統是世界智慧財產權組織(產權組織)免費提供的專利檢索系統,可以查閱 數百萬份專利文獻。截止2018年4月11日,其可以檢索到包括中國在內的56個國家組織或者地區的專利數據。
  • 超200個化學化工網站!文獻專利資料庫全部免費!
    1、查詢物質結構性質等的網站:http://chemexper.com/;   2、查詢物質結構性質等的網站http://chem.sis.nlm.nih.gov/chemidplus/chemidlite.jsp;3、查詢物質結構性質等的網站:http://sp.chemindex.com
  • 皓元醫藥新專利助力囊性纖維化治療藥物研發
    來源:時刻頭條近日,上海皓元醫藥股份有限公司(以下簡稱皓元醫藥)一項發明專利獲得國家知識產權局授權,目前已在國家知識產權局官網掛網公布。皓元醫藥是一家專注於小分子藥物研發服務與產業化應用的平臺型高新技術企業,主要業務包括小分子藥物發現領域的分子砌塊和工具化合物的研發,以及小分子藥物原料藥、中間體的工藝開發和生產技術改進,為全球醫藥企業和科研機構提供從藥物發現到原料藥和醫藥中間體的規模化生產的相關產品和技術服務,目前正在申請科創板上市。
  • 京法巡迴講堂|生物醫藥領域中實驗數據該不該補充? 聽專利法官如何說
    50餘名審查員帶來了「司法審判中對化學領域專利申請的效果實驗數據的考量」專題講座。口碑爆棚的現實主義題材佳作《我不是藥神》的上映,讓觀眾對醫藥行業有了更多的關注。業內有個說法,如果沒有專利制度,絕大多數的藥品都不會出現。可見專利保護對於激發、保持藥企的創新積極性極為重要。但是你知道麼?在生物醫藥領域的專利中,與實驗數據相關的問題特別重要。
  • 專利英文檢索技巧
    專利英文檢索是很多從業者檢索能力薄弱的一個環節,相信一定會有一部分人對專利英文檢索存在一些困惑,在表達英文關鍵詞時總是讓人感覺很混亂。·有什麼好用的翻譯軟體可以幫助更全面拓展英文關鍵詞?·如何用一兩個形式全面表達英文單詞的諸多詞形變換?·當雙引號「」遇到通配符(*?$)時怎麼辦?
  • 國家知識產權局官方微信上線 可在線檢索專利
    央廣網北京4月27日消息(記者車麗)27日,國家知識產權局在京舉辦智慧財產權宣傳周開放日活動,並發布2014年度專利覆審無效十大案件評選活動。  國家知識產權局保護協調司司長黃慶告訴記者,我國企業現在是走出去的過程中,智慧財產權的意識明顯提升,但是仍然遇到了各種各樣的智慧財產權的問題,這裡面最重要的原因就是,企業獲取海外智慧財產權的信息非常不足。
  • 我國自主研發的世界傳統藥物專利資料庫接入WIPO官網_部門政務...
    據世界智慧財產權組織(WIPO)官網消息,世界傳統藥物專利資料庫(WTMPD)於近日正式接入世界智慧財產權組織官網,並被納入該組織專業化專利信息查詢(ASPI)計劃,為該組織158個成員國或地區提供專業化信息服務。
  • 專業的專利檢索網站,值得收藏!
    不管是作為科研人員,還是企業專利相關法務,抑或是專利代理人或專利律師,其基本功之一便是專利檢索。通過專利檢索,我們可以快速了解我們想獲取的專利技術;也可以學習優秀的專利是如何撰寫的;專利律師也可以通過專業的檢索來獲取客戶所需要的相關技術領域的專利分布情況等,可謂是用處頗多。
  • 以分子砌塊和工具化合物打造科創企業 皓元醫藥陷產品專利之爭
    相比分子砌塊和工具化合物,中間體和原料藥則為更後期,主要用於臨床研究、上市藥物、仿製藥等後期,毛利率相對而言更低,九洲藥業等上市公司中間體和化學原料藥毛利率約為30%-40%。報告期內,皓元醫藥原料藥和中間體業務毛利率分別為38.44%、34.78%、38.83%,也在行業水平內。
  • 86個化學資源網站!文獻專利資料庫全部免費!
    2、查詢物質結構性質等的網站http://chem.sis.nlm.nih.gov/chemidplus/chemidlite.jsp;3、查詢物質結構性質等的網站:http://sp.chemindex.com/cn;4、化工資源網:http://www.jm126.com/fj/;5、上海楓林店:http://www.bio-equip.com
  • 諾獎得主漏報22億專利收入!日本醫藥圈到底發生了什麼?
    兩方的合作可以追溯至2003年,本庶佑發現了一種名為PD-1的免疫球蛋白受體,將其專利授權給了小野製藥,2007年美國醫藥巨頭BMS加入進來,將PD-1推向市場。事實上,在PD-1被發現的1992年,日本大學還沒有申請專利的知識和能力。直到2003年,小野製藥向本庶佑拋來橄欖枝,約定雙方按照1比1的分成比例申請了專利,但根據本庶佑對法院的敘述,其得到的分配比例不到1%。
  • 醫藥CMO與上下遊產業的關係分析
    1、上遊行業上遊行業為精細化工行業,其提供的基礎化學原料經過分類加工後可形成專用醫藥原料,逐漸加工形成原料藥起始物料、cGMP 中間體、原料藥和製劑。醫藥 CMO 行業的業務鏈一般是從專用醫藥原料開始。
  • 醫藥化工產業升級中的投資機會
    從農藥化肥、合成纖維,到橡膠塑料、汽油瀝青……我們的衣食住行都離不開化工產品。通俗點說,凡是運用化學方法改變物質組成、結構或合成新物質的,都屬於化工的範疇,所得產品就是化工產品。除了衣食住行,醫院藥店裡的藥品也是一種典型的化工產品——用化學工藝生產出來的。不管是原料藥、中間體的生產,還是新藥研發中全新分子的合成,廣義上說都是醫藥化工的範疇。
  • 醫藥化工廢水處理工藝探討
    北極星水處理網訊:隨著醫藥企業的迅猛發展,醫藥化工廢水排放量增大,對環境造成的負荷加劇。同時醫藥化工廢水具有高鹽度、難降解、成分複雜等特點,處理難度大。在治理過程中,採取單一常規治理辦法處理醫藥廢水,通常無法滿足治理標準。為此,針對醫藥化工廢水治理方法的使用問題,應進一步提出科學的解決措施,提升廢水治理水平。
  • 企業的標準制定與專利戰略的關係
    現行的標準GB T 3620.1-2007鈦及鈦合金牌號和化學成分,規定了82種鈦及鈦合金牌號和化學成分。本文以通過對所涉及鈦合金的公開的專利檢索,以專利數量最多的TC11和TC17兩種合金為例分析專利與標準的關係。
  • 2021國知局專利檢索諮詢中心專利檢索審查員招聘40人公告
    一、單位概況國家知識產權局專利檢索諮詢中心(以下簡稱檢索諮詢中心)是國家知識產權局直屬事業單位,是目前國內科技及智慧財產權領域提供高級信息檢索與諮詢服務的權威機構,是國家知識產權局和世界智慧財產權組織認定的技術與創新支持中心(TISC),擁有國內較早提供專利信息服務的綜合性網絡平臺—中國專利信息網(www.patent.com.cn),能夠為社會公眾和創新主體提供優質的專利信息檢索與諮詢等服務工作
  • 廣州幹細胞專利申請數全國第一!這個領域的大數據來了
    報告顯示,廣州生物醫藥產業規模、增速穩步上升,生物醫藥企業分布均衡,涉及醫藥領域較全面,基本覆蓋了生物醫藥產業各領域,生物醫藥研究平臺、創新平臺資源豐富,在腫瘤藥品研發、幹細胞、再生醫學等領域優勢明顯,充分體現廣州將生物醫藥產業列入重點發展的戰略性新興產業的決心和力度。
  • 化工業務穩定向好 積極打造醫藥工業
    在園區建設方面,全市已經形成了襄陽磷化工循環經濟產業園、餘家湖醫藥化工產業集群、宜城精細化工產業園、保康縣城周邊的熱法磷酸生產基地、保康縣馬橋鎮磷礦及加工基地,產業規模已初步形成,為今後優化產品結構、合理配置資源、建設環境友好型磷化工企業,奠定了良好的基礎。  尿素行業景氣度回升,公司尿素業務有望企穩向好  近年以來,尿素行業一直處於產能嚴重過剩狀態,價格持續下滑。