黃檗根圍叢枝菌根真菌菌群組成

2021-01-17 生物谷

菌物學報 15 July 2009, 28(4):512～520

黃檗根圍叢枝菌根真菌菌群組成

蔡柏巖1,2   葛菁萍1   接偉光2   閻秀峰3﹡

1黑龍江大學生命科學學院 黑龍江省普通高等學校微生物重點實驗室 哈爾濱 150080

2黑龍江東方學院食品與環境工程學部 哈爾濱 150086

3東北林業大學生命科學學院 哈爾濱 150040

摘  要：從東北林業大學林場採集黃檗Phellodendron amurense根系及根圍土壤，採用Nested-PCR技術擴增黃檗菌根及根圍土壤AM真菌18S rDNA NS31/Glol區域，利用該產物進行DGGE分析，並結合DNA測序、系統發育分析及DGGE圖譜分析技術對黃檗AM真菌菌群組成進行分析。結果表明：Nested-PCR技術具有較高的靈敏性，可有效地從微量DNA中擴增出約230bp的目的片段；黃檗根系及根圍土壤具有不同的DGGE指紋圖譜特徵，DGGE帶譜在條帶的數量、亮度、優勢度等方面均存在較大差異，全部序列可分為3類菌群，即球囊黴屬Glomus、盾孢囊黴屬Scutellospora及植物病原菌黃楊亞赤殼Hyponectria buxi，其中Glomus sp.（EF177624）和Glomus sp.（DQ085205）分別為黃檗根系和根圍土壤樣品中最具優勢的AM真菌。

關鍵詞：18S rDNA，Nested-PCR技術，變性梯度凝膠電泳，系統發育分析

The community composition of the arbuscular mycorrhizal fungi in the rhizosphere of Phellodendron amurense

CAI Bai-Yan1, 2   GE Jing-Ping1   JIE Wei-Guang2   YAN Xiu-Feng3*

1Key Laboratory of Microbiology, College of Life Sciences, Heilongjiang University, Harbin 150080, China

2Insitute of Food and Environment Engineering, Heilongjiang Oriental College, Harbin 150086, China

3College of Life Sciences, Northeast Forestry University, Harbin 150040, China

Abstract: The rhizospheric soil and root samples of Phellodendron amurense were collected in the Logging Station of Northeast Forestry University. Nested-PCR was conducted to specifically amplify NS31/Glol domain sequences of the small-subunit (18S) rDNA from the AM fungi in the root and rhizospheric soil samples of P. amurense, respectively. The Nested-PCR products were applied to denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) analysis. Then, the community composition of the AM fungi was analyzed by DGGE, sequencing, and phylogenetic analysis. The result indicated that the targeted product (230bp) was successfully amplified from trace DNA by Nested-PCR. There were differences in DGGE profiles such as band numbers, densities and dominance between the rhizospheric soil and root samples. All sequences were divided into three groups, viz. Glomus, Scutellospora and Hyponectria buxi. Glomus sp. (EF177624) and Glomus sp. (DQ085205) were the prevalent AM fungi in the root and rhizospheric soil, respectively.

Key words: 18S rDNA, Nested-PCR, denaturing gradient gel electrophoresis, phylogenetic analysis

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