在進項稅額轉出方面，轉出額的計算是重點和難點，具體計算方法如下：
（1）若原外購項目全部成本按增值稅專用發票全額抵扣了進項稅額，則按照需要轉出進項稅額的外購貨物帳面成本×外購貨物適用增值稅稅率計算轉出。
（2）若原外購項目全部成本按支付價款乘以抵扣率抵扣了進項稅額，則按照需要轉出進項稅額的外購貨物的帳面成本÷（1-抵扣率）×抵扣率計算轉出。
（3）若原外購項目是根據多種憑證抵扣的進項稅額，為了最大限度地體現公平，可按照需要轉出進項稅額的外購貨物的帳面成本×綜合抵扣率計算結轉進項稅額轉出。其中，綜合抵扣率=本期外購貨物全部進項稅額÷本期外購貨物全部成本×100%。
（4）在產品、產成品發生非正常損失，可按以下辦法計算結轉進項稅額轉出。結轉進項稅額=非正常損失的在產品或產成品成本×（本期在產品、產成品當中外購貨物成本÷本期在產品、產成品全部成本）×外購貨物或應稅勞務綜合抵扣率。
（5）無法區分不得抵扣進項稅額的處理。針對房地產企業而言，一般納稅人銷售自行開發的房地產項目，兼有一般計稅方法計稅、簡易計稅方法計稅、免徵增值稅的房地產項目而無法劃分不得抵扣的進項稅額的，應以建築工程施工許可證註明的「建設規模」為依據進行劃分。