第一，訴訟時效適用於請求權，請求權是請求他人為一定行為或者不為一定行為的權利。除斥期間適用於形成權。
第二，訴訟時效的適用範圍無需事事由法律特別規定，只需符合法院受案範圍的請求權，均可援用訴訟時效。除斥期間需由法律明確規定，法律未做特別規定的，當事人不能援用除斥期間。
第三，訴訟時效有中止、中斷、延長的制度，除斥期間則無，是固定不變的，故除斥期間又有不變期間之稱。
第四，訴訟時效屆滿，消滅的是勝訴權，當事人的請求權依然存在，只不過是被請求權人產生時效屆滿的抗辯權，可以據此對抗請求權人的請求。除斥期間屆滿，當事人消滅的是實體權利，該權利喪失，不能再行使。
主張撤銷權時效是訴訟時效的觀點認為，撤銷權是請求權，即請求撤銷合同的權利，不是形成權，債權人不可以自行撤銷合同，故撤銷權的時效應為訴訟時效。主張撤銷權是除斥期間的觀點認為，債務人、第三人有詐害行為的，債權人應當及時行使撤銷權，因此撤銷權時效，屬除斥期間。本條規定撤銷權的期間為一年和五年。債權人知道撤銷原因的，自知道之日起，為一年。債權人不知道撤銷原因的，自詐害行為發生之日起，為五年。期間屆滿，當事人撤銷權消滅。
二、保證期間與除斥期間的區別
附帶指出，保證期間也不是除斥期間，理由如下：
1.保證期間首先允許約定，而除斥期間為法定期間，只有解除權可以約定除斥期間(合同法第九十五條第一款)。
2.保證期間屆滿，消滅的是債權。而除斥期間屆滿，消滅的是形成權。
3.在保證期間內，債權人請求保證人承擔保證債務，保證人若無抗辯權的行使，保證期間功成身退，訴訟時效期間取而代之。除斥期間不存在這個現象。
4.保證期間的起算點的確定如同上述，除斥期間的起算點則比較複雜。我國合同法規定，在可撤銷的合同場合，撤銷權的除斥期間自撤銷權人知道或者應當知道撤銷事由時起算(第五十五條第一款)。
在效力未定的合同場合，追認權的除斥期間自相對人催告確定的開始追認的時間起算(第四十七條第二款及其司法解釋、第四十八條第二款及其司法解釋);相對人的撤銷權在除斥期間的長短方面不確定，只有最後限定，即追認權行使之前，起算點應為合同成立之時(第四十七條第二款及其司法解釋、第四十八條第二款及其司法解釋)。在債權人撤銷權的情況下，撤銷權的除斥期間自債權人知道或者應當知道撤銷事由之日起算，在債權人不知道也不應當知道撤銷事由的情況下，自債務人的行為發生之日起算(第七十五條)。在合同解除的情況下，解除權的除斥期間自法律規定或者當事人約定的起算之日開始計算，無此規定或者約定的，自債務人催告確定的開始之日起算(第九十五條)。