臨床醫務人員是公眾健康的「守門人」，是疾病監測的前哨和法定傳染病的責任人報告人，突發公共衛生事件發生時由於多數病人到醫療機構求醫而發現的，因此在應對突發公共衛生事件中有著不可替代的作用。
1、參與傳染病疫情和突發公共衛生事件風險管理：
在疾病預防控制機構和其他專業機構指導下，協助開展突發公共衛生事件風險排查，收集和提供風險信息，參與風險評估和應急預案制（修）定。
2、有效履行突發公共衛生事件的發現和登記職責：
醫療機構是監測突發公共衛生事件的哨點。如果在短時間內發現3例以上症狀相似的不明原因疾病的病例，經過初步了解發現病例間存在內在關聯，需要考慮存在不明原因疾病的突發，建議開展報病。如懷疑為突發公共衛生事件時，按要求填寫《突發公共衛生事件相關信息報告卡》，如果臨床醫生未報病時，作為護理人員，需要及時提醒醫生報病。
3、按照突發公共衛生事件報告程序進行報告和訂正、補報：
具備網絡直報條件的機構，在規定時間內進行突發公共衛生事件相關信息的網絡直報；不具備網絡直報條件的，按相關要求通過電話、傳真等方式進行報告，同時向轄區縣級疾病預防控制機構報《突發公共衛生事件相關信息報告卡》。發現報告錯誤，或報告病例轉歸或診斷情況發生變化時，應及時對《突發公共衛生事件相關信息報告卡》等進行訂正，對漏報突發公共衛生事件，應及時進行補報。
4、參與事件的處理
（1）按照有關規範要求，對突發公共衛生事件傷者與病人進行急救，及時轉診，書寫醫學記錄及其他有關資料並妥善保管。
（2）協助對本轄區突發公共衛生事件開展流行病學調查，收集和提供病人、密切接觸者、其他健康危害暴露人員的相關信息。協助對傳染病接觸者或其他健康危害暴露人員的追蹤、查找，對集中或居家醫學觀察者提供必要的基本醫療和預防服務。
（3）做好醫療機構內現場的消毒隔離、個人防護、醫療垃圾和汙水的處理工作。協助對被汙染的場所進行衛生處理，開展殺蟲、滅鼠等工作。
（4）協助開展應急接種、預防性服藥、應急藥品和防護用品分發等工作，並提供指導。
（5）根據轄區傳染病和突發公共衛生事件的性質和特點，開展相關知識技能和法律法規的宣傳教育。