萬種脊椎動物基因測序拉開序幕

2020-11-26 科學網

 科學家打算對1萬種脊椎動物展開DNA測序研究。（圖片提供：SCIENCE）

拜基因組測序成本持續且迅速減少所賜，一個由基因組和博物館專家組成的研究小組日前宣布了一項雄心勃勃的計劃——破譯1萬種脊椎動物的基因組。但是這項在11月4日正式發布並於5日刊載於《遺傳雜誌》網絡版上的「基因組10K」計劃，卻依然有一些相關細節尚未透露，包括其研究經費來源於哪裡？將使用何種測序手段？以及如何處理和使用其所得到的相關數據？

 

但是這項計劃的支持者如今已經在全球範圍內開始行動，旨在搜集最終用來提供海量基因組數據從而與人類脫氧核糖核酸（DNA）進行對比的DNA數據。這種對比將有助於查明人類基因組中的重要區域，以及提供人類進化的信息。迄今為止，大約有60種脊椎動物的基因組得到了測定，或正在測序的過程中。如今，美國加利福尼亞大學聖克魯斯分校的David Haussler、美國馬裡蘭州弗雷德裡克市國家癌症研究所的Stephen O』Brien、美國加利福尼亞州聖地牙哥動物園的Oliver Ryder，以及其他來自全球的50餘位科學家，彙編了一份由16000個物種構成的名單，將由43個研究機構分別負責採集測序所需的DNA。

 

對於脊椎動物的基因組計劃來說，獲得好的DNA樣本有時候往往是一個問題。有些DNA樣本並不適合用現有的技術進行測序，因為對其進行測序往往過於耗費時間且花費高昂。O』Brien、Haussler和Ryder希望每個物種的基因組測序成本能夠下降到2500美元——這大約相當於現有成本的1/100，甚至更低。經過幾年對更好測序技術的等待，研究人員期望整個計劃的開銷能夠控制在5000萬美元以內。儘管現在依然不清楚這項計劃的經費來自哪裡，以及對基因組數據的彙編和解釋能否跟上預想中的高通量測序技術，但Haussler依然對此充滿信心。他說：「我們現在真的有了動力。」（來源：科學時報 群芳）

 

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