1.吸水是乾燥的種子迅速吸水，其原生質吸水後膨脹，種子體積變大。
2.髮根是當種子吸水達到飽和狀態後即開始進行萌動、發芽。發芽過程首先是胚根的伸長，逐漸從種臍處露出。
3.發芽是種子隨著胚根的繼續伸長，種肧的胚軸也開始伸長。
4.子葉展開
種子從吸脹開始的一系列有序的生理過程和形態發生過程，大致可分五個階段：
一、吸脹
為物理過程。種子浸於水中或落到潮溼的土壤中，其內的親水性物質便吸引水分子，使種子體積迅速增大（有時可增大1倍以上）。吸脹開始時吸水較快，以後逐漸減慢。種子吸脹時會有很大的力量，甚至可以把玻璃瓶撐碎。吸脹的結果使種皮變軟或破裂，種皮對氣體等的通透性增加，萌發開始。
二、水合與酶的活化
這個階段吸脹基本結束，種子細胞的細胞壁和原生質發生水合，原生質從凝膠狀態轉變為溶膠狀態。各種酶開始活化，呼吸和代謝作用急劇增強。如大麥種子吸脹後，胚首先釋放赤黴素並轉移至糊粉層，在此誘導水解酶（α-澱粉酶、蛋白酶等）的合成。
水解酶將胚乳中貯存的澱粉、蛋白質水解成可溶性物質（麥芽糖、葡萄糖、胺基酸等），並陸續轉運到胚軸供胚生長的需要，由此而啟動了一系列複雜的幼苗形態發生過程。
三、細胞分裂和增大
細胞分裂和增大時吸水量又迅速增加，胚開始生長，種子內貯存的營養物質開始大量消耗。
四、胚突破種皮
胚突破種皮時胚生長後體積增大，突破種皮而外露。大多數種子先出胚根，接著長出胚芽。
五、長成幼苗
長成幼苗以後長出根、莖、葉，形成幼苗。有的種子的下胚軸不伸長，子葉留在土中，只由上胚軸和胚芽長出土面生成幼苗，這類幼苗稱為子葉留土幼苗，如豌豆、蠶豆等。有些植物如棉花、油菜、瓜類、菜豆等的種子萌發時下胚軸伸長，把子葉頂出土面，形成子葉出土幼苗。
自身條件
有生命力且完整的胚
被昆蟲咬壞了胚的種子不能萌發。種子在離開母體後，超過一定時間將喪失生命力而不能萌發，對不同種子而言其壽命時間長短不同。例如：柳種子僅有12小時，花生1年，小麥和水稻一般能活3年，白菜和蠶豆的能活5~6年。
有足夠的營養儲備
正常種子在子葉或胚乳中儲存有足夠種子萌發所需的營養物質，乾癟的種子往往因缺乏充足的營養而不能萌發。
不處於休眠狀態
多數種子形成後，即使在條件適宜的情況下暫時也不能萌發，這種現象被稱為休眠。
形成的主要原因：一是種皮障礙。有些種子的種皮厚而堅硬，或種皮上附著蠟質層或角質層，使之不透水、不透氣或對胚具有機械阻礙作用。二是有些果實或種子內部含有抑制種子萌發的物質。比如某些沙漠植物在長期的生活中，為了適應乾旱的環境，在種子表面具有水溶性抑制物質，只有在大量降雨後，這些抑制物質被洗脫掉才能萌發，以保證形成的幼苗不致因缺水而枯死。對於休眠的種子，若需促進萌發，應針對不同原因解除休眠。
擴展資料：
種子萌發是指種子從吸脹作用開始的一系列有序的生理過程和形態發生過程。種子的萌發需要適宜的溫度，適量的水分，充足的空氣。
種子萌發時，首先是吸水。種子浸水後使種皮膨脹、軟化，可以使更多的氧透過種皮進入種子內部，同時二氧化碳透過種皮排出，裡面的物理狀態發生變化；其次是空氣，種子在萌發過程中所進行的一系列複雜的生命活動，只有種子不斷地進行呼吸，得到能量，才能保證生命活動的正常進行；最後是溫度，溫度過低，呼吸作用受到抑制，種子內部營養物質的分解和其它一系列生理活動，都需要在適宜的溫度下進行的。
了解作物種子萌發所需的條件，掌握土壤溼度和播種深度，對於播種後早出苗、出全苗極為重要，是獲得高產的第一步。有些作物如早稻的某些品種，種子沒有休眠期，收穫時如遇雨水和高溫，就會在農田或打穀場上的植株上萌發，這種現象稱為胎萌。種子在貯藏時如果溼而熱也會萌發。有些雜草種子由於休眠期的個體差異，或在土層內分布深度不同，在若干年內陸續萌發。