生命學院張竹青課題組發布首個蛋白質體外液液相分離資料庫

2021-01-09 中國科學院大學新聞網

　　近年來，蛋白質液液相分離（Liquid-liquid Phase Separation, LLPS）逐漸成為生物學研究的熱點之一。它在生命體的正常代謝和疾病過程中都發揮著非常重要的作用。隨著越來越多的探索LLPS具體發生機制的報導，人們發現影響蛋白質LLPS的因素主要來自於兩個方面：一是蛋白質序列性質，如突變及翻譯後修飾的影響；二是受到體系微環境，比如溫度、蛋白質濃度、pH值、鹽濃度、壓力等的調節。中國科學院大學碩士生導師，生命學院張竹青課題組收集了目前文獻報導過的所有能在體外發生LLPS的蛋白質及其相分離相關實驗條件，經過系統的分類整理和注釋，發布了目前首個專門研究蛋白質體外LLPS的資料庫（Liquid-liquid phase separation database, LLPSDB）。通過網站(http://bio-comp.ucas.ac.cn/llpsdb or http://bio-comp.org.cn/llpsdb)，用戶可以對資料庫進行瀏覽、查詢和下載。文章「LLPSDB: a database of proteins undergoing liquid–liquid phase separation in vitro」於2019年9月6日在國際著名期刊Nucleic Acids Research（IF=11.147）上在線發表（https://doi.org/10.1093/nar/gkz778）。中國科學院大學生命學院碩士生李倩和彭小珺為論文共同第一作者，2016級本科生李源清、唐文勤和朱家安參與了部分工作，張竹青副教授為論文通訊作者。該研究得到了國家自然科學基金和中國科學院大學青年教師提升項目的支持。

 

LLPSDB的數據結構

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