關于波利尼西亞人起源，逐漸為最新的分子人類學證據所解析。
2018年1月，紐西蘭梅西大學基礎科學研究所統計和生物信息學組、愛沙尼亞生物中心、法國霍姆博物館、澳大利亞拉籌伯大學生物化學與遺傳學系、澳大利亞雪梨大學生命與環境科學學院、英國布里斯托大學布裡斯託分校社會與社區醫學綜合流行病學系和美國科羅拉多大學科羅拉多斯普林斯市科羅拉多學院分子生物學系等機構的研究者，在國際頂尖期刊國際知名期刊《科學報告》（Scientific Reports）上刊發論文。
研究者報導了一組玻里尼西亞的古人基因組數據和現代玻里尼西亞人的基因組數據，其中通過捕獲測序獲得了高質量的Y染色體測序信息，可以用於父系祖源的深入分析。
此前，大美基因Y染色體分型系統對下載編號為ERR2134225的玻里尼西亞人樣本進行Y染色體的父系祖源分析，結果顯示，該樣本屬於單倍體群O2a2b2a2b2a，攜帶AM00476等系列突變標記，是南島語系族群的重要父系遺傳標記。
同時，其母系也攜帶南島語族常見線粒體DNA標記B4a1a1c。
接下來，大美基因團隊嘗試應用Hapmap全血統祖源分析計算器對該玻里尼西亞樣本進行分析，該計算器採用人類基因組單體型圖計劃（Hapmap）的全球多種族樣本作為參照系，可以識別樣本的大種系血統組成。
結果發現，玻里尼西亞樣本攜帶100%的類蒙古人種血統，說明該樣本未攜帶高加索人種和尼格羅人種基因信號。值得注意的是，該計算器沒有澳大利亞人種的參照樣本，因此，並不意味著玻里尼西亞樣本與蒙古人種血統完全一致。
因為Hapmap的東方族群參照系樣本僅有漢族和日本人兩族，無法全面考察目標樣本與各主要東方族群的血統關聯。其後，大美基因以人類基因組多樣性計劃(HGDP)的東方族群樣本作為參照系，考察該例玻里尼西亞樣本的東方族群血統組成情況。
分析發現，該玻里尼西亞樣本攜帶約22.38%的類西南藏羌系族群納西族B組血統；攜帶14.63%的另一支西南藏羌系族群拉祜族血統，以上這兩種血統在東亞人群中並不常見，可能有著某種特殊的始祖源流；同時，該玻里尼西亞樣本攜帶約20.28%的類東南亞柬埔寨高棉人血統；攜帶約27.68%的類東南沿海遊耕民族畲族血統；攜帶約3.6%的東北通古斯語族赫哲族血統；攜帶約11.43%類西伯利亞突厥語族雅庫特人血統。
可見，玻里尼西亞人的蒙古人種血統與東亞大陸各主要族群都有一定血統關聯，其起源較為複雜。
參考文獻：
Investigating the origins of eastern Polynesians using genome-wide data from the Leeward Society Isles