JoVE微生物組專刊徵稿,寫方法拍視頻教程發SCI

2021-03-01 宏基因組
JoVE 視頻實驗雜誌

官網：https://www.jove.com/

包括上萬個實驗和分析方法視頻，還有幾十個領域的數百個專業視頻教程資源。

這個雜誌被SCI收錄了嗎？必須的。雜誌在Web of Science中JCR信息如下：

2年影響因子 1.1，5年影響因子1.6。雜誌和視頻需要訂閱才能訪問，一定成度限制了傳播和引用，但今年開始允許有權限有用戶分享視頻，將進一步促進科學傳播，上升空間極大。

下面是我分享的連結，有3個月的訪問權，可複製連結在瀏覽器中觀看視頻，感受一下文章的質量。

國內也有上百家單位訂閱，詳見：https://www.jove.com/subscribe/subscribed-institutions

如果覺得好，可以推薦自己單位的圖書館訂閱。

微生物組相關文章示例

示例1. 一種確定環境富集對小鼠結腸腫瘤模型結腸菌群生物多樣性影響的方法

A Method to Define the Effects of Environmental Enrichment on Colon Microbiome Biodiversity in a Mouse Colon Tumor Model

分享連結：https://www.jove.com/embed/player?id=57182&access=8o4ok5lyn9&t=1&s=1&fpv=1

示例2. 二步法PCR結合高通量測序16S rDNA

Microbiota Analysis Using Two-step PCR and Next-generation 16S rRNA Gene Sequencing

分享連結：https://www.jove.com/embed/player?id=59980&access=bywtlf7e8g&t=1&s=1&fpv=1

示例3. 多年生草的土壤、根際和根系微生物群落的分離與分析

Isolation and Analysis of Microbial Communities in Soil, Rhizosphere, and Roots in Perennial Grass Experiments

https://www.jove.com/embed/player?id=57932&access=v83yhdiu57&t=1&s=1&language=Chinese&fpv=1

複製以及連結，在瀏覽器中可訪問，有效期3個月。記得打開右下角的CC字幕，不錯任何細節。

微生物組教學資源示例

原文連結：https://www.jove.com/science-education/10510/16s-rrna-sequencing-pcr-based-technique-to-identify-bacterial

分享連結：https://www.jove.com/embed/player?id=10510&access=hsu67r53wj&t=1&s=1&fpv=1

樣片預覽：https://v.qq.com/x/page/a0970vyiomn.html

原文連結：https://www.jove.com/video/10509/pure-cultures-streak-plating-isolation-single-bacterial-colonies-from

分享連結：https://www.jove.com/embed/player?id=10509&access=losu418qcp&t=1&s=1&fpv=1

原文連結：https://www.jove.com/science-education/11104/the-roles-of-bacteria-and-fungi-in-plant-nutrition

分享連結：https://www.jove.com/embed/player?id=11104&access=9capwyhmxd&t=1&s=1&fpv=1

寫方法發SCI

宏基因組公眾號有近9萬海內外華人同行關注，現受JoVE雜誌邀請作為客座主編組織微生物組分析和可視化方法學專刊。

更多信息請訪問專刊網址：https://www.jove.com/methods-collections/426/analysis-visualization-methods-for-amplicon-metagenomic-data

專刊介紹

高通量測序的進展促進了微生物組研究的發展，並且已經生成了大量的微生物組數據集。微生物組數據分析使研究人員能夠了解微生物組與宿主之間的相互作用機制。但是，由於缺乏用於複雜分析和可視化的教程，因此沒有生物信息背景的生物學家很難進入該領域，開展分析存在一定困難。

該集合旨在為研究人員提供易於使用的微生物組分析和可視化方法。該集合的範圍包括分析軟體，資料庫本地和在線使用，分析流程以及統計和可視化方法的教程。可視化方法包括但不限於α和β多樣性，分類學組成，差異比較，排序，相關性，網絡和進化。統計方法主要包括組成型數據分析和機器學習等。

邀請信社交版

致宏基因組公眾號用戶：

迄今為止，儘管在微生物組分析中共享新技術和分析方法這類文章至關重要，但迄今為止很少有期刊可以接受視頻文章供我們發表。

因此，宏基因組決定接收可視化實驗雜誌（JoVE）的邀請，開設主題為「微生物組的擴增子和宏基因組學數據分析和可視化方法」的專刊 https://www.jove.com/methods-collections/426/analysis-visualization-methods-for-amplicon-metagenomic-data

該專刊的目的是全面概述微生物組的擴增子和宏基因組學數據的分析和可視化方法

根據Clarivate Analytics在2019年發布的2018年《期刊引證報告》，最新的JoVE影響因子（ISSN 1940-087X）為1.108，5年影響因子 1.682，《期刊》目前被PubMed，EMBASE，Scopus和Web of Science等主要資料庫索引。

提交後，將對每份手稿進行編輯和同行評審，這通常需要1-2個月的時間。文字文章通過審核後，將生成一個劇本。通常，拍攝日期定在接受後的4-8周內。攝像師將被派遣至作者的實驗室以拍攝該教學視頻。

如果您有興趣，請給我發消息或在此處提交摘要 https://www.jove.com/methods-collections/426/analysis-visualization-methods-for-amplicon-

Dear Friends and Colleagues,

To date very few Journals are available to accept video articles for submission/publication in our field, despite this type of articles are of paramount importance in microbiome analysis in order to share new techniques and approaches.

For this reason, I decided to open a Collection titled 「Analysis and visualization methods for amplicon and metagenomic data of microbiome」 on the Journal of Visualized Experiments (JoVE): https://www.jove.com/methods-collections/426/analysis-visualization-methods-for-amplicon-metagenomic-data

The purpose of the Collection is to offer a comprehensive overview of Analysis and visualization methods for amplicon and metagenomic data of microbiome

The most recent Impact Factor for JoVE (ISSN 1940-087X) is 1.184, according to the 2017 Journal Citation Reports released by Clarivate Analytics in 2018, and the Journal is currently indexed in the major databases, including PubMed, EMBASE, Scopus and Web of Science.

After submission, each manuscript will be editorially and peer reviewed, which is typically a 1-2 month process. Once a text article passes review, a script will be generated. Generally, a filming date will be scheduled within 4-8 weeks after acceptance. A videographer will be sent to the authors』 site to film the procedure.

If you are interested, either message me or submit an abstract here https://www.jove.com/methods-collections/426/analysis-visualization-methods-for-amplicon-metagenomic-data

邀請信模板：https://docs.google.com/document/d/1HO9r1jAdbK0pz7C_eFJj-yT-39oviG1bbzS1CWAfNKY/edit

正式邀請信郵件版

親愛的朋友和同事，

作為JoVE的客座主編，我正在組織一個方法學專刊，標題為「微生物組擴增子和宏基因組學數據的分析和可視化方法」。

JoVE是領先的經過同行評審的科學方法視頻期刊，旨在提高研究的知名度和可重複性。JoVE的團隊會負責拍攝和製作視頻的整個過程。

該方法集將是「微生物組數據的分析和可視化」技術的權威記錄，並為同行內的可重複性設定標準。我的目標是涵蓋該領域的高級實驗和分析方法，我認為您的工作將是對本領域空白的補充。

完成後，此專刊將分發給該領域活躍的研究人員完整列表。這將促進同行研究人員之間的合作，並促進更廣泛地採用創新方法。

該專刊將成為未來幾年該領域方法的首選資源，我希望收錄您的文章。

您對發表方法及拍攝視頻教程感興趣嗎？

在此處提交摘要：https://www.jove.com/methods-collections/426/analysis-visualization-methods-for-amplicon-metagenomic-data

客座主編

劉永鑫，中國科學院遺傳與發育生物學研究所

陳同，中國中醫科學院國家中藥資源中心

鄭茂盛，華北電力大學環境科學與工程學院

Dear Friends and Colleagues,

As a Guest Editor for JoVE, I am organizing a Methods Collection titled 「Analysis and visualization methods for amplicon and metagenomic data of microbiome「.

JoVE is the leading peer-reviewed scientific methods video journal, aimed at increasing the visibility and reproducibility of research. JoVE’s team takes care of the entire process of filming and producing your video.

This Methods Collection will be the definitive record of 「Analysis and visualization of microbiome data」  techniques and set the standard for reproducibility within the community. I am aiming to cover advanced experimental and analysis approaches in the field, and I think your work would be an invaluable addition.

Once complete, this collection will be distributed to a comprehensive list of researchers who are active in the field. This will promote collaboration among researchers in the community and facilitate wider adoption of innovative methodologies.

This collection will be the go-to resource for methods in the field for years to come, and I look forward to including your article.

Would you be interested in contributing?

Submit an abstract here: https://www.jove.com/methods-collections/426/analysis-visualization-methods-for-amplicon-metagenomic-data

Best Regards,

Guest Editors

Yong-Xin Liu, Institute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences

Tong Chen, National Resource Center for Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medical Sciences

Maosheng Zheng, College of Environmental Science and Engineering, North China Electric Power University

地區要求

因為此文章有拍攝視頻的要求，可提供上門拍攝的中國城市如下：

中國大陸：北京、成都、杭州、南充、南京、寧波、上海、深圳、天津

中國香港：香港島、九龍

中國臺灣：新竹、臺中、臺南、桃源、臺北

更多國家和地區，可參考 https://www.jove.com/files/JoVE_Videographer_Network.pdf

註：不在以上地區，也可自己錄製視頻，但需要達到雜誌的要求。

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為鼓勵讀者交流、快速解決科研困難，我們建立了「宏基因組」專業討論群，目前己有國內外5000+ 一線科研人員加入。參與討論，獲得專業解答，歡迎分享此文至朋友圈，並掃碼加主編好友帶你入群，務必備註「姓名-單位-研究方向-職稱/年級」。PI請明示身份，另有海內外微生物相關PI群供大佬合作交流。技術問題尋求幫助，首先閱讀《如何優雅的提問》學習解決問題思路，仍未解決群內討論，問題不私聊，幫助同行。

學習16S擴增子、宏基因組科研思路和分析實戰，關注「宏基因組」

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