周周講第二十一期:Co-IP與GST Pull-down的區別在哪裡?

2021-01-14 生物競賽菁英聯盟
點擊上面的藍字關注 生物競賽菁英聯盟


學習生競的同學可能都知道,用於研究蛋白質與蛋白質之間相互作用的技術有很多,比較有代表性的就是Co-IP與GST Pull-down技術,在周周講第十九期文章中我們也提到過,2018年聯賽中出現了免疫共沉澱Co-IP技術7道連選題。那麼Co-IP與GST Pull-down技術二者的區別和聯繫在哪裡?


Co-IP與GSTPull-down,本質上都是親和層析。Co-IP技術的原理是,用一個小磁珠,上面偶聯著A/G蛋白,該蛋白可以與抗體的恆定區結合。在Co-IP的結果圖中,我們經常可以看到IP:M這樣的字樣。IP:M代表著,體系中加入了M蛋白的抗體。則一個拉一個,小磁珠上會結合有A/G蛋白-M蛋白的抗體-M蛋白。若M蛋白與N蛋白有互作,則N蛋白也會在小磁珠上,最終被檢測到。而如果M蛋白與N蛋白沒有互作,則N蛋白不會出現於小磁珠,最終無法檢測到N蛋白。而對於GST Pull-down,假設要研究M蛋白能否與N蛋白互作,該方法需先將M蛋白與穀胱甘肽巰基轉移酶GST構建成融合蛋白,之後在穀胱甘肽親和層析柱中上樣,令M蛋白結合於層析柱。再將N蛋白過柱子,若層析柱最終結合有N蛋白,則代表M蛋白與N蛋白可互作。下期預告:在下一期將為大家分享關於生物聯賽考點相關的話題,18年聯賽考察Co-IP,19年聯賽考察EMSA。請同學們課前先思考:到了2020年,是不是有可能考察探究RNA與蛋白質之間相互作用的技術呢?


三大發明 | 乙醯膽鹼 | 頭孢菌素 | 腎臟的神經調節

相關焦點

  • GST pull-down 和Co-IP的形象關係解釋
    GST pull-down和CoIPGST pull-down實驗是一個行之有效的驗證酵母雙雜交系統的體外試驗技術,近年來越來越受到廣大學者的青睞。GST:穀胱甘肽巰基轉移酶(glutathione S-transferase)GST pull down 和 Coimmunoprecipitation關係問題啥叫GST pull down , Coimmunoprecipitation呢? 學過生物的地球人都知道. 這是研究蛋白質相互作用的兩種方法.
  • IP、co-IP、ChIP、RIP、pull-down了解一下?
    IP、co-IP、ChIP、RIP、pull-down,這麼多單詞還分得清嗎?
  • GST pull-down實驗
    pull-down實驗原理pull-down技術是將"誘餌"蛋白與一種易於純化的配體標籤
  • GST-pulldown操作流程
    GST pull-down實驗是一個行之有效的驗證酵母雙雜交系統的體外試驗技術,近年來越來越受到廣大學者的青睞。GST-pulldown主要包括以下三個部分:①利用基因重組技術構建帶有GST標籤的原核表達載體;②通過原核表達系統表達帶有GST標籤的融合蛋白;③利用GST親和純化柱進行蛋白純化獲得高純度的融合蛋白,再利用GST親和純化柱進行蛋白間的相互作用檢測。
  • GST pulldown實驗——從一竅不通到略知一二
    GST pulldown實驗是一個行之有效的驗證酵母雙雜交系統的體外試驗技術,其基本原理是將靶蛋白-GST融合蛋白親和固化在穀胱甘肽親和樹脂上
  • 蛋白互作專題GST pull-down
    蛋白互作專題GST pull-down蛋白功能已成為當下研究的熱點之一,蛋白間相互作用在細胞的生命活動中起著關鍵作用。相互作用的蛋白之間通過形成複雜的功能性複合體,參與細胞內一系列的信號級聯反應,從而調控細胞及個體的生命活動。
  • 知無不「研」|一文讀懂 GST pull down
    GST pull down實驗原理和流程利用重組技術將誘餌蛋白與GST(Glutathione S transferase)融合,融合蛋白通過GST與固相化在磁珠上的GTH(Glutathione)親和結合
  • GST pull-down和CoIP有何區別?實驗結果該如何解讀?
    通過查閱資料,小P發現其實GST pull-down實驗和CoIP實驗原理是非常相似的!今天就簡單介紹一下兩者的異同,同時結合文獻案例給大家分享一下CoIP和GST pull-down實驗結果的分析方法。GST,全稱glutathione-S-transferase,即穀胱甘肽-S-轉移酶蛋白,能夠和穀胱甘肽(Glutathione,GSH)穩定結合。
  • 適合您的實驗——GST pulldown,請到碗裡來
    GST:穀胱甘肽巰基轉移酶(glutathione S-transferase),GSH作為GST的底物與其結合。如果有純化的天然的誘餌蛋白,可將其用生物素進行標記或偶聯一些其他小的標籤,可實現使用鏈親和素瓊脂糖樹脂進行pull-down實驗。技術流程圖
  • 【實驗專欄】蛋白檢測篇之GST pull-down
    接下來將為大家分享分子機制部分的蛋白檢測篇之GST pull-down。 GST pull-down實驗是一個行之有效的驗證酵母雙雜交系統的體外試驗技術,近年來越來越受到廣大學者的青睞。
  • 知無不「研」,DNA pull down 常見疑點解析
    適配子DNA單鏈,可以用帶有互補鏈的磁珠進行pull down嗎?如果可以,效率怎麼樣?一般需要怎麼優化條件?A:理論上說,若DNA單鏈能夠與磁珠上的互補鏈雜交成功,是可以進行pull down實驗的; 效率如何不好確定,這個取決於兩條DNA單鏈是否能雜交成功、蛋白-DNA結合的強弱、蛋白的豐度等。
  • co-ip實驗12個常見的問題,帶你在線掃盲
    Co-ip 實驗兩個抗體需要不同種源嗎?答:最好選擇兩個不同種源的抗體。Co-ip 實驗中使用的對照抗體有哪些?單克隆抗體:正常小鼠的 IgG 或另一類單抗;多克隆抗體:正常兔 IgG6. 免疫共沉澱陰性對照的意義是什麼?
  • RNA pull down實驗技術
    RNA pull-down是檢測RNA結合蛋白與其靶RNA之間相互作用的主要實驗手段之一。
  • 知無不「研」|一文讀懂免疫共沉澱技術(Co-IP)
    Co-IP(免疫共沉澱,co-inmunoprecipitation)是經典的利用抗體從樣品中捕獲靶蛋白及其互作蛋白、複合體的一項技術,能夠特異性富集所研究的目的蛋白。由於過程中採用了非變性條件,保留了互作及複合體的細胞內狀態。
  • 手把手教你做RNA pull down
    在之前的文章中我們已經了解了RNA pull down 實驗的原理、應用、案例和注意事項(回顧點這裡),今天我們來嘮一嘮RNA pull down 實驗的詳細步驟~RNA pull down 實驗步驟1、構建 RNA 過表達質粒:基因合成 +測序驗證;2、體外轉錄模板準備:設計含 T7 啟動子引物,PCR 擴增得到轉錄模板;3、體外轉錄:以 PCR 產物為模板,體外轉錄得到目的 RNA;4、RNA pull down :通過磁珠 -RNA 探針複合物富集互作的蛋白;
  • 知無不「研」|一文讀懂RNA pull down
    RNA pull-down作為研究RNA與蛋白互作的核心技術,已成為研究焦點。RNA pull down是使用體外轉錄法標記生物素RNA探針,然後與胞漿蛋白提取液孵育,形成RNA-蛋白質複合物。該複合物可與鏈黴親和素標記的磁珠結合,從而與孵育液中的其他成分分離。
  • 科研者必帶武器-pull down 技術
    這裡,小編來淺談下蛋白質相互作用技術中一種比較經典的實驗技術- pull down 實驗。      pull down 實驗又叫做蛋白質體外結合實驗(binding assay in vitro),是一個行之有效的驗證酵母雙雜交系統的體外試驗技術。用固相化的、已標記的餌蛋白或標籤蛋白(生物素-、PolyHis-或GST-),從細胞裂解液中釣出與之相互作用的蛋白。
  • DNA pull-down 來啦!
    在前面的文章中我們和大家一起學習了RNA pull-down這種實驗技術,好學且好奇心強的小編又很快發現一種和它挺像的叫做DNA pull-down的新技術,再一起來看看吧。DNA pull-down是體外研究DNA與蛋白互作的有力工具。
  • 教科書級別的RNA pull-down操作手冊,請收藏!
    上次Andy介紹到RNA pull-down的原理和做該實驗的準備工作,在萬事俱備以後,就可以開始為期三天的正式實驗了。我們這次的實驗流程是採用的生物素標記的磁珠法,也是比較常規的一種方法~RNA pull-down assay using Streptavidin magnetic beadsRNA pull-down 第一天——生物素探針標記RNA
  • 傑斯有話說第二十一期:讓金貢不爽的大龍蝦
    這裡是老司機傑斯將由我繼續主持第二十一期的傑斯有話說歡迎大家上車,一起來關注LOL各種資訊吧~!老司機即將發車,滴滴滴~快上車!被一隻大龍蝦給氣到的金貢可愛的牛寶來到FPX後,大家對他都很不錯,前幾天一起出去吃飯,lqs還請牛寶吃了一隻大龍蝦,把牛寶感動的不要不要的。