Southern blot(印跡)操作步驟

2020-11-25 中國教育裝備採購網

  1.瓊脂糖電泳

  (1)取一定量的待測DNA樣品,用適當的限制性內切酶酶切。DNA的量根據樣品的種類及

  實驗目的的不同而異,對於克隆片段的限制性內切酶圖譜分析,取0.1-0.5μg即可;而對於鑑

  定基因組DNA中的單拷貝基因序列,則需要10~20μg;當採用寡核苷酸探針或探針的比放射

  性活性較低時,則需要30~50μg。

  (2)酶切完畢,在瓊脂糖凝膠中電泳。

  (3)電泳結束後,EB染色,長波紫外線下觀察電泳結果及照相。

  2.印跡轉移

  (1)切膠並作標記(左下角切除),以便於定位,然後將凝膠置於一容器中。

  (2)將凝膠浸泡於適量的變性液中,室溫下放置1h 使之變性,不間斷地輕輕搖動。

  (3)將凝膠用去離子水漂洗1次,然後浸泡於適量的中和液中30 min,不間斷地輕輕搖動。更換中和液,繼續浸泡15 min。

  (4)將濾紙,NC膜剪成與膠同樣大小,NC膜浸入轉移buffer 中平衡30 min。

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  (5)按圖操作:逐層鋪平,各層之間勿留有氣泡和皺摺。

  (6)虹吸轉移12-16h。

  3.固定DNA

  (1)取出轉移後的NC 膜,用濾紙吸乾NC 膜,NC 膜光面朝上平鋪於變性液中變性5min。

  (2)用相同的方法將NC膜平鋪在中性液上,中和兩遍,每遍5min。

  (3)將膜夾在兩張乾燥濾紙間,80℃烘烤1-2h。

  4.預雜交

  (1)將膜浸入5×SSC 中 2min,將膜放入乾淨的塑膠袋中。

  (2)將預雜交液事先在65℃ 預熱,然後將10 ml 預雜交液加入袋中,封口。

  (3)65℃預雜交1h 以上,不時搖動。

  5.雜交

  (1)取出雜交袋,剪去一角去除雜交液後,加入5ml 雜交液及5μl 變性探針,排除氣泡後封口。

  (2)將雜交袋放入65℃ 水浴中雜交過夜。

  6.按下列條件洗膜

  2×SSC, 0.1%SDS 50ml 室溫5min /2 次

  0.1×SSC, 0.1%SDS 50ml 65℃ 15min /2 次

  7.免疫酶聯檢測

  (1)偶聯反應

  ①用中和液洗膜2min,室溫。

  ②用封閉液50ml 洗膜30min,室溫,輕搖。

  ③用中和液將稀釋抗體-Dig –Ap 至 750 mU/ml ,將膜封入雜交袋,加入5 ml稀釋抗體輕搖50min。

  ④用中和液50 ml 洗膜,10min ×2 次,室溫,輕搖,除去未結合的抗體。

  (2)顯色反應①用平衡液20 ml平衡膜2min。

  ②將膜裝入雜交袋中,加入5ml 顯色液,避光30min 左右,當出現顏色時不要晃動。

  ③用TE洗膜終止反應。

  ④80℃烤乾。

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