細胞實驗重複性差?先看看有沒有支原體汙染

2020-12-03 先達基因

當實驗結果與預期不一致或無法重複時,先自查——查一下自己的研究樣本,特別是細胞培養是否做到位了,其中有「一點」需特別注意,因顯微鏡下很難觀察到它,沒有視覺,就沒有感知,所以它很容易被忽略。

這「一點」就是:支原體汙染!

全世界範圍內,不同實驗室的科研人員在培養細胞時,發生支原體汙染的概率是10%-85%不等。支原體是最小的原核生物,大約0.2-0.3um, 可以透過濾膜(0.22-0.45 um),因此被汙染細胞常常肉眼觀察不到。有的實驗室被支原體汙染後,如果不進行有效徹底的支原體清除,該實驗的細胞培養很難進行下去,細胞傳代3代以後狀態就急劇下滑,無法進行正常實驗,有的實驗室甚至只能指望換細胞間。

大量文獻報導細胞支原體汙染後,會影響DNA 、RNA 和蛋白的表達,進而會產生以下幾個方面的影響:

1,細胞生長和繁殖

2,細胞代謝及功能

3,染色體異常

4,免疫細胞的質量

如何與這害人的支原體做鬥爭?

首先,可對細胞進行支原體汙染檢測,下面介紹3種方法:

1,PCR法。

若有汙染,會P出條帶,如果不放心送去測序看看是不是支原體序列。記得那會實驗室每周有專人進行全實驗室細胞的支原體檢測,一發現有問題,馬上將其扼殺在搖籃裡。但是有時PCR法敏感性差容易出現假陰性結果,或是因為檢測範圍小不能檢測到所有的支原體汙染。

2,Hoechst等螢光染色法和酶活法。

Hoechst等螢光染色法需要先將細胞種植在載玻片上,等細胞長到合適的密度,對其進行固定、洗滌、染色等,最終在顯微鏡下的現象。酶活法是通過檢測支原體特異性ATP合成酶來檢測支原體的汙染,需要特定的試劑盒和相應的多功能酶標儀,而且試劑盒的價格還比較昂貴。這兩種方法沒有做PCR 來得簡單快速。

3,基於先達基因ERA技術的支原體檢測試劑盒

ERA是由我國蘇州先達基因自主研發的,核心是一套等溫核酸擴增組合酶製劑。該試劑盒可以在恆定的低溫下(25℃-42℃)對痕量的支原體種內保守性DNA片段進行特異性的擴增,擴增反應可以在20min內完成,該試劑盒檢測範圍涵蓋130種支原體。這可以說是目前最為理想的支原體檢測方法了。

然後,如果檢測到有支原體汙染,該如何處理呢?

方法1:直接棄之!

這就非常簡單粗暴了,如果還沒做處理,還是趕緊棄之吧,搶救不如重新復甦了,另外對培養箱要做由裡至外的清潔處理。

方法2:支原體清除培養基

如果你培養的細胞比較珍貴,直接丟棄可惜,那麼在確定對細胞的基因及蛋白表達沒有影響的情況下,可以使用——支原體清除培養基

Procell支原體清除培養基

支原體清除培養基是Procell在市面上已有的 支原體清除培養基基礎上開發的新一代產品,含有清除「支原體」的特殊成分(一種混合製劑,可通過抑制DNA和支原體生長所必須的相關蛋白合成來取得良好的支原體清除效果,最大程度上挽救珍貴的細胞,減少因支原體汙染帶來的損失)。

拯救被支原體汙染的細胞,你們Get到了嗎?

支原體汙染不易察覺,但染上卻可以毀了全部細胞。為了不讓自己輸在起跑線上,今後,請在蛋白檢測不順時,多注意下不易察覺的細節如支原體汙染,細胞交叉汙染,細胞傳代次數過多所導致的細胞老化,等等。做科研,細節決定成敗!

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  • 細胞培養中的支原體汙染的預防及處理
    國外調查證明,大約有二十多種支原體能汙染細胞,有的細胞株可以同時汙染兩種以上的支原體。 支原體汙染的來源包括工作環境的汙染、操作者本身的汙染(某些支原體在人體是正常菌群)、培養基的汙染、被汙染細胞造成的交叉汙染、實驗器材的汙染、製備細胞的原始組織或器官的汙染,等等。
  • Nature:大量的細胞研究被支原體汙染摧毀
    又因為其缺乏細胞壁,所以常規的抗生素並不能對它們起到抵抗作用。由於支原體本身的特性,不易被清除,而導致實驗研究中資金和人力的極大損失。John Hogenesch每次看到自己的實驗員愁眉不展時,他立馬就知道是實驗出問題了,他會給與實驗員一個好的方法去查找失敗的原因——「檢查下細胞培養是否存在支原體汙染」。支原體汙染總是會影響研究的發現,並浪費大量的科研經費。
  • 細胞培養中的支原體汙染問題
    支原體無細胞壁形態呈高度多形性.可為圓形、絲狀或梨形。支原體形態多變,在光境下不易看清部結構。電鏡下觀察支原體膜為三層結構.其中央有電幹密度大的密集顆粒群或絲狀的中心束。支原體多吸附或散在於細胞表面和細胞之間。橫斷面與細胞微絨毛相似,但微絨毛電子密度比支原體小,且中央無顆粒群或中央束。
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  • 細胞培養出現支原體汙染的危害及檢驗方法
    支原體是目前已知一類能在無生命培養基上生長繁殖的最小的原核細胞型微生物。細胞培養(特別是傳代細胞)被支原體汙染是個世界性問題。國內外研究表明,95%以上是以下四種支原體:口腔支原體(M.orale)、精氨酸支原體(M.arginini)、豬鼻支原體(M.hyorhinis)和菜氏無膽甾原體(A.laidlawii),為牛源性。國外調查證明,大約有二十多種支原體能汙染細胞,有的細胞株可以同時汙染兩種以上的支原體。
  • 細胞培養的實驗室對支原體汙染預防有幾種預防
    支原體的汙染肉眼不易察覺,直到嚴重的階段才會出現培養基變色、細胞異常等情況。支原體可造成細胞代謝改變,基因表達譜發生變化,從而嚴重幹擾實驗進程。本文締一生物為您分析細胞培養的實驗室對支原體汙染預防有幾種預防。因此,在細胞培養過程中,定期監測是否存在支原體汙染,及時預防支原體汙染是每個科研人員的工作之一。
  • 細胞被支原體汙染是每個實驗室常見但不自知的事
    這還挺有緣,我的實驗分享也是在星期四。其實還挺恐婚的,總感覺只要辦了婚禮,就要承擔責任,就不能再裝老小孩了。最最重要的是沒有了壓歲錢了,好傷心啊。   所以這一周都在忐忑不安中度過。其實我還沒有回家,已經先於我回家的妹妹昨天跟我講說,家裡面已經鑼鼓喧天的在準備我的婚禮了。
  • 支原體汙染引發細胞應激狀態的一則報導
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  • 同樣是細胞被支原體汙染,怎麼挑選支原體祛除劑
    養細胞時,除了支原體的檢測需要定期進行外,支原體的預防和祛除也是一個重要方面。它包括工作區域中的支原體的預防和祛除和培養箱水槽、水浴鍋中預防支原體的汙染。但一旦發生細胞培養時有支原體汙染,應如何挑選支原體祛除劑呢?這裡指的支原體祛除劑,是加入到細胞培養基中來發揮作用。德國MB有三種支原體祛除劑,都是加入到細胞培養基中使用。它包括:1.
  • 支原體汙染的影響是什麼?如何應對呢?
    細胞培養過程中,由於實驗環境、操作者鼻腔口腔、實驗器材等很多地方都有支原體的存在。因此,細胞發生支原體汙染的頻率很高。據美國數據統計,細胞發生支原體汙染的機率在70%以上。同時,由於支原體直徑很小,僅在180nm~350nm之間,只有通過電鏡才能看到。因此,支原體汙染不易被實驗者肉眼發覺。而支原體汙染是個循序的過程,普通抗生素對其無效。
  • 細胞培養支原體汙染的判斷和處理方法
    ,光鏡下難以看清它的形態結構,並對青黴素有抗藥性,是細胞培養界的隱性殺手。主要來源是血清,支原體汙染不能用肉眼或光學顯微鏡檢查細胞觀察出來,帶有一定的隱蔽性,易被人們忽視。當細胞被支原體汙染後,在光鏡下常可見到細胞核及胞漿內出現大小不等的顆粒或空泡,細胞營養液可能毫無變化,短期內細胞沒有明顯的病理變化,也可以因為傳代或換液而緩解。只有當汙染嚴重時才影響細胞增殖,使細胞脫落。支原體可以與宿主細胞形成一個共生關係,使汙染不斷擴大。
  • 細胞中支原體的汙染檢測有如下幾種方法
    支原體最早發現於1898年,1956年Robinson等首次從細胞培養物中分離出支原體,之後國內外關於支原體汙染細胞的報導屢見不鮮。它廣泛存在於自然界中,有100餘種。現在只要是做細胞培養並發表論文,國際期刊就要求一定要做支原體檢測。一般要一周測一次支原體。
  • 細胞汙染那些事
    點擊上方「細胞培養技術交流」關注我上次說到細胞培養只要用心,該注意的地方都注意到,一般不會發生汙染事件。細菌汙染如果發現的早,可以用高倍(5到10倍)抗生素的培養液培養清除,一天兩次換液,維持兩天後換回常規培養液培養。要是發現的晚(比如培養液都渾濁了),建議還是重新復甦細胞。真菌可以用兩性黴素來清除,但很難徹底清除。
  • 不可小看支原體汙染問題
    在培養細胞時,人們常常關注細菌和真菌的汙染,認為它們是細胞培養的主要幹擾因素。但其實,更嚴重的是支原體 的感染,它的發生率非常高,而且不易被發現。不僅普通光鏡下無法發現支原體,而且培養基也不容易變色。只有在汙染的後期培養基才容易變黃。下圖為支原體嚴重汙染後的表現:那麼,支原體汙染為什麼發生率這麼高?
  • 勿讓支原體成為培養細胞的殺手
    有時看到論文裡,會寫到在培養細胞時,一周檢測一次支原體,為什麼會出現這種情況呢?原來,支原體很容易成為培養細胞的殺手。支原體直徑約0.1-0.3µm,比細菌還小。它容易附著於細胞表面,與宿主細胞胞膜融合併交換成分。環境中很容易存在支原體,人體也容易攜帶支原體。