【原理】
瓊脂糖（agarose）是經過挑選，以質地較純的瓊脂（agar）作為原料而製成的。瓊脂在化學上是由瓊脂糖和瓊脂膠組成的複合物。瓊脂膠是一含有硫酸根和羥基的多糖，它具有離子交換性質，這種性質會給電泳及凝膠過濾以不良的影響。瓊脂糖是直鏈多糖，它由D－半乳糖和3,6－脫水－L－半乳糖的殘基交替排列組成。
瓊脂糖主要通過氫鍵而形成凝膠。電泳時因凝膠含水量大（98－99%），近似自由電泳，因為固體支持物的影響少，故電泳速度快，區帶整齊。而且由於瓊脂糖不含帶電荷的基團，電滲影響很少，是一種較好的電泳材料，分離效果較好。
血清中脂類物質與血清載脂蛋白結合成水溶性的脂蛋白（lipoprotein）形式存在。各種脂蛋白中所含載脂蛋白的種類及數量不同，各種脂蛋白顆粒大小也相差很大，因此，以瓊脂糖凝膠為支持物，在電場中可使各種脂蛋白顆粒分離開來。
瓊脂糖凝膠電泳分離血清蛋白方法簡單。將血清脂蛋白用脂類染料蘇丹黑（或油紅等）進行預染。再將預染過的血清加樣於瓊脂糖凝膠板加樣槽中，通電後可以看到脂蛋白向正極移動，並分離出幾個區帶。
正常人血清脂蛋白可出現三條區帶，從陰極到陽極依次為β－脂蛋白（最深），前β－脂蛋白（最淺）及α－脂蛋白（比前β－脂蛋白略深些），在原點處應無乳糜微粒。有時前β－脂蛋白也顯
示不出來。
瓊脂糖主要通過氫鍵而形成凝膠。電泳時因凝膠含水量大（98－99%），近似自由電泳，因為固體支持物的影響少，故電泳速度快，區帶整齊。而且由於瓊脂糖不含帶電荷的基團，電滲影響很少，是一種較好的電泳材料，分離效果較好。
血清中脂類物質與血清載脂蛋白結合成水溶性的脂蛋白（lipoprotein）形式存在。各種脂蛋白中所含載脂蛋白的種類及數量不同，各種脂蛋白顆粒大小也相差很大，因此，以瓊脂糖凝膠為支持物，在電場中可使各種脂蛋白顆粒分離開來。
瓊脂糖凝膠電泳分離血清蛋白方法簡單。將血清脂蛋白用脂類染料蘇丹黑（或油紅等）進行預染。再將預染過的血清加樣於瓊脂糖凝膠板加樣槽中，通電後可以看到脂蛋白向正極移動，並分離出幾個區帶。
正常人血清脂蛋白可出現三條區帶，從陰極到陽極依次為β－脂蛋白（最深），前β－脂蛋白（最淺）及α－脂蛋白（比前β－脂蛋白略深些），在原點處應無乳糜微粒。有時前β－脂蛋白也顯示不出來。
【操作】
1、預染血清 血清0.2mL中加蘇丹黑染色液0.2mL，混合置37℃水浴中染色30分鐘，離心（2000轉/分）約5分鐘。以除去懸浮於血清中染料沉渣。
2、製備瓊脂糖凝膠板 將已配製好的0.5%瓊脂糖凝膠於沸水浴中加熱融化，用吸管吸取凝膠溶液澆注在載玻片上，約3 mL。靜置半小時後凝固（天熱時需延長，也可放入冰箱中數分鐘以加速凝固）。
3、點樣 將剪好的濾紙條對摺，以折邊在距凝膠一端2cm處切一點樣口。將毛細管插入預染好的血清中，待吸入部分血清後，取毛細管使其有樣品的一端靠於點樣口端部，停靠3秒左右。
4、電泳 將凝膠板平放入電泳槽中，使加樣端接在陰極一側，用四層濾紙或紗布做成「引橋」，敷於膠板的兩端，各搭住凝膠板約1cm左右，「引橋」的另一端浸於電泳槽內的巴比妥緩衝液中。接通電源，首先調節電流為3-4mA/凝膠板，電泳10－15分鐘；然後調節電流為6-7mA/凝膠板，電泳30－40分鐘，即可觀察到分離的區帶。
5、如果需要保留電泳圖譜，可將電泳後的凝膠板（連同載玻片）放入清水中浸泡脫鹽2小時，然後放烘箱（80℃左右）中烘乾即可。
【試劑】
1、蘇丹黑染色液 將蘇丹黑B加到無水乙醇中至飽和，搖蕩使乙醯化。用前過濾。
2、巴比妥緩衝液 稱取巴比妥鈉15.4g、巴比妥2.76g及EDTA0.29g，加水溶解後再加蒸餾水至1000mL（pH為8.6，離子強度0.075），為電極緩衝液。
3、凝膠緩衝液 取三羥甲基氨基甲烷1.212g、EDTA0.29g及NaCl5.85g，用蒸餾水溶解後，稀釋至1000mL，pH為8.6。
4、瓊脂糖凝膠 稱取瓊脂糖0.45 g溶於50 mL凝膠緩衝液中，再加水 50 mL。在水浴中加熱至沸，待瓊脂糖完全溶解後，立即停止加熱。
【注意事項】
1、電泳樣品應為新鮮的空腹血清。
2、加熱溶化瓊脂時，須防止水份蒸發過多。瓊脂糖凝膠最好隨用隨制，以免凝膠表面乾燥，影響分離效果。
3、製作凝膠板時瓊脂糖濃度一般選用0.5%左右為宜，高於1%以上α－脂蛋白部分較緊密，β和前β－脂蛋白部分不夠清晰；低於4.5%則凝固性較差，圖譜不清。
4、點樣口要大小適宜，邊緣整齊、光滑，否則會影響電泳圖譜。
5、在α－脂蛋白前若出現較淺區帶，可列為前α－脂蛋白。
【正常參考範圍】
α－脂蛋白 20~30%
β－脂蛋白 20~30%
前β－脂蛋白 0~28%
乳糜微粒（-）